thumb|Nicolas Baudin.
L'expédition Baudin est un voyage d'exploration scientifique français parti du Havre le et qui conduisit Nicolas Baudin et l'équipage du Géographe et du Naturaliste dans les mers du Sud au-delà du cap de Bonne-Espérance et jusque dans l'océan Pacifique.
Marquée par une rencontre avec le Britannique Matthew Flinders au large de l'Australie, ce qui indiqua aux Européens que l'île était un continent d'un seul tenant, elle coûta la vie à de nombreux hommes, et notamment au commandant lui-même, qui mourut de la tuberculose en 1803 à l'île de France (aujourd'hui île Maurice). Cependant, elle permit aux nombreux savants qui y prirent part de réaliser les premières descriptions véritablement scientifiques d'un grand nombre de territoires austraux et de populations indigènes, du piton de la Fournaise aux aborigènes australiens.
Préparations L'expédition intéressait au plus haut point les scientifiques de la Société des observateurs de l'homme fondée par Louis-François Jauffret. Pour guider les explorateurs dans leurs recherches, Cuvier avait rédigé une Note instructive sur les recherches à faire relativement aux différences anatomiques des diverses races d'homme et le baron Joseph-Marie de Gérando des Considérations sur les diverses méthodes à suivre dans l'observation des peuples sauvagesJean François Dortier, La Société des observateurs de l'homme . Bernard-Germain de Lacépède, lui, avait constitué une bibliothèque scientifique pour son protégé, Bory de Saint-Vincent, qui malheureusement arriva trop tard pour être transportée à bord.
C'est Pierre-François Kéraudren, premier médecin de la Marine, qui rédigea les instructions sanitairesIl y a deux cents ans.
Navires
L'expédition commença avec deux naviresdes corvettes dont la quille est doublée de cuivre, le Géographe et le Naturaliste. Huit officiers formaient l'état-major du premierLe capitaine de vaisseau Baudin ; le capitaine de frégate Le Bas de Sainte-Croix ; le capitaine de vaisseau Gicquel; le capitaine de vaisseau Charles Baudin ; le capitaine de vaisseau de Freycinet (Henry); le capitaine de vaisseau Capmartin ; l'officier de santé de Laridon et l'officier de génie maritime Ronsard et huit celui du second Le capitaine de frégate Hamelin; le lieutenant de vaisseau Bonnié; le lieutenant de vaisseau Milius; l'enseigne de vaisseau de Freycinet (Louis); l'enseigne de vaisseau de Saint-Cricq; l'enseigne de vaisseau Heirisson; l'enseigne de vaisseau Picquet et le chirurgien de Bellefin. Ils étaient équipés de filtres à eau conçus par Cuchet et Smith et fournis par le gouvernement.
La bibliothèque Bien que peu fournieD'après Bory de Saint-Vincent, leur bibliothèque avait un contenu dérisoire, ce qui lui fit regretter d'avoir raté la caisse de livres que lui avait envoyée Bernard-Germain de Lacépède, la bibliothèque contenait tout de même quelques relations de voyage intéressantes, la treizième édition du Systema Naturae, le Genera plantarum d'Antoine-Laurent de Jussieu ainsi que des ouvrages d'Étienne Pierre Ventenat. On y trouvait également le dictionnaire de Trévoux, une encyclopédie, les mémoires de Réaumur et la compilation de Valmont de Bomare.
Principaux participants thumb|Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent
D'après Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent (1778-1846), naturaliste qui quitta l'expédition à l'île de France (aujourd'hui Maurice), depuis que les puissances européennes envoyaient des vaisseaux de par le monde pour mieux le comprendre. De fait, selon lui, . Détail important pour la suite de l'expédition, qui vit la mort de nombreux hommes, il estime que Voyage dans les quatre principales îles des mers d'Afrique, Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent..
Les savants, naturalistes, dessinateurs, etc. sont au départ douze à bord du GéographeBissy (astronome) ; Boullanger (ingénieur géographe) ; Maugé (zoologiste) ; Leschenault (botaniste en chef) ; Milbert (dessinateur en chef) ; Riedlé (jardinier en chef); Depuch (minéralogiste en chef) ; Péron (zoologiste); Levillain (zoologiste) ; Sautier (garçon jardinier) ; Guichenot (garçon jardinier) et Lebrun (dessinateur) et dix à bord du NaturalisteBernier (astronome) ; Faure (géographe) ; Michaux ((botaniste) ; Bory de Saint-Vincent (zoologiste en chef) ; Bailly (minéralogiste) ; Dumont (zoologiste) ; Delisse (botaniste) ; Cagnet (garçon jardinier) ; Merlot (garçon jardinier) et Garnier (dessinateur). La moitié d'entre eux (onze personnes) quitte l'expédition à l'île de France. Lesueur, engagé comme artilleur, rejoint le groupe des savants en tant que dessinateur après la mort de Maugé et se fait assister de Petit.
Marins thumb|gauche|Louis de Freycinet
Aux dires de Bory de Saint-Vincent, .
En fait, l'atmosphère n'est pas bonne entre officiers, la raison est due à l'inexpérience et à la jalousie de certains jeunes officiers. Des coteries se forment rapidement, la principale étant celle du capitaine Le Bas de Sainte-Croix, d'un orgueil tout aristocratique.
L'état-major de la corvette le Géographe est constitué de huit officiers (plus sept aspirants) dont Baudin, le commandant de l'expédition, assisté du capitaine de frégate Le Bas de Sainte-Croix avec qui il ne s'entend pas et qu'il débarque à Timor. De plus, l'équipage est constitué de dix officiers mariniers ; quatre officiers mariniers de canonnage; huit officiers mariniers de timonerie; trois officiers mariniers de charpentage; deux officiers mariniers de calfatage ; deux officiers mariniers de voilerie; onze matelots de première classe; huit matelots de deuxième classe; sept matelots de troisième classe; huit matelots de quatrième classe; neuf mousses de et de , huit artilleurs ; un officier de santé de Hubert Jules Taillefer et six commis de cuisine, plus le maître d'hôtel du commandant assisté de deux cuisiniers; le secrétaire du commandantLouis Petitain, originaire de Lyon. Quatre matelots et un charpentier sont trouvés en plus à bord et un passager, Antoine Guth, débarqué à l'île de France.
L'équipage de la corvette Le Naturaliste est constitué de huit officiers d'état-major dont le capitaine de frégate Hamelin qui le commande ; neuf aspirants ; huit officiers de manœuvre; un officier marinier de canonnage; trois officiers mariniers de timonerie et neuf aides-timoniers; deux officiers mariniers de charpentage; deux officiers mariniers de calfatage; quatre officiers mariniers de voilerie ; douze matelots de première classeDont deux embarqués à Tenerife ; cinq matelots de deuxième classe ; huit matelots de troisième classe ; dix-neuf matelots de quatrième classe ; dix-sept moussesDont quatre embarqués à Tenerife : deux Flamands, un Luxembourgeois et un Espagnol ; six matelots au munitionnaire et deux garçons de confianceUn maître d'hôtel et un cuisinier ; huit canonniers et aide-canonniers et un passager chinois du nom d'A-Sam, débarqué à l'île de France.
Nicolas Baudin, ancien officier de la marine marchande, est le capitaine du Géographe et le commandant de l'expédition. Capitaine de frégate, Alexandre Le Bas de Sainte-Croix est le second à bord du Géographe. Pierre Guillaume Gicquel des Touches est lieutenant de vaisseau à bord du Géographe. Il a déjà suivi d'Entrecasteaux dans les mers du Sud lors de son voyage à la recherche de La Pérouse, dont l'expédition n'était pas revenue. Charles Baudin est un autre lieutenant de vaisseau embarqué à bord du Géographe et qui n'était pas parent du commandant. Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent l'estime . Henri de Freycinet est enseigne à bord du Géographe. Il est promu lieutenant de vaisseau en et devient de facto lieutenant de pied de Baudin avec Ronsard à bord du Géographe Jean-Antoine Capmartin a les mêmes fonctions sur le même navire. Il est laissé malade à l'île de France en . Ingénieur constructeur, François-Michel Ronsard est également enseigne à bord du Géographe. Il est promu enseigne de vaisseau en et devient de facto lieutenant de pied de Baudin avec Henri de Freycinet à bord du Géographe.
Emmanuel Hamelin, capitaine de frégate, est le commandant du Naturaliste et le second officier de l'expédition. Bertrand Bonié, second du capitaine Hamelin à bord du Naturaliste. Selon Bory de Saint-Vincent, M. Bonié est un lieutenant de vaisseau et marin consommé. Mais il abandonne l'expédition en à l'île de France. Il est remplacé par le lieutenant de vaisseau Milius. François-André Baudin est un lieutenant de vaisseau débarqué à l'île de France en . Pierre Bernard Milius est un autre lieutenant de vaisseau sur le Naturaliste. Il devient second du capitaine Hamelin, après le départ de Bonié. Il remplace le commandant Baudin après sa mort en et ramène le Géographe en France à Lorient en . Furcy Picquet est enseigne sur le Naturaliste, puis à partir d' à bord du Géographe. Il est débarqué à Timor le . Louis de Freycinet est enseigne sur le Naturaliste. Il est le petit frère d'Henri de Freycinet. François Heirisson est enseigne sur le Naturaliste. Jacques de Saint-Cricq est enseigne sur le Naturaliste. Hyacinthe de Bougainville, fils du navigateur Louis-Antoine de Bougainville, est un des aspirants de marine participant à l'expédition. Jean-Marie Maurouard est également aspirant de marine. Charles Moreau est également aspirant de marine. Étienne Giraud, aspirant sur le Naturaliste. Armand de Gouhier, embarqué novice de à 15 ans sur le Naturaliste fait aspirant de à Timor en ; mort en mer le Thomas Vasse, seconde classe sur le Naturaliste. Un petit mousse relevant du plus jeune des deux Freycinet, appelé Cadet.
Géographes, cartographes, dessinateurs et artistes
Charles-Pierre Boullanger, géographe à bord du Géographe. Pierre Faure est géographe à bord du Naturaliste. Il quitte l'expédition à son retour à l'île de France en . Charles Alexandre Lesueur, artiste. Nicolas-Martin Petit, artiste assistant Lesueur. Jacques-Gérard Milbert est le dessinateur en chef. Il est embarqué à bord du Géographe, mais quitte l'expédition à l'île de France en . Louis Lebrun est un dessinateur adjoint embarqué à bord du Géographe. Michel Garnier est peintre à bord du Naturaliste, mais quitte l'expédition à l'île de France en .
Naturalistes, médecins et jardiniers
Jean-Baptiste Bory de Saint-Vincent, officier d'état-major, zoologiste en chef. Il quitte l'expédition à l'île de France en . François-Étienne L'Haridon de Créménec est un autre médecin à bord du Géographe. Hubert Jules Taillefer, également médecin sur le Géographe. Jérôme Bellefin est chirurgien parti sur le Naturaliste. François Collas est pharmacien, embarqué à bord du Naturaliste avec le grade d'aspirant. Jean-Baptiste Leschenault de La Tour, naturaliste, est botaniste en chef et embarqué à bord du Géographe. Il est débarqué malade à Timor en . René Maugé de Cely est un naturaliste faisant office de zoologiste à bord du Géographe. Il meurt de dysenterie au large de la Tasmanie, le . Stanislas Levillain est un zoologiste embarqué à bord du Géographe. Il meurt de dysenterie au large de Timor, le . François Péron est un zoologiste embarqué à bord du Géographe. Il est chargé de l'étude des Hommes . Désiré Dumont est zoologiste adjoint à bord du Naturaliste. Il quitte l'expédition en à l'île de France. André Michaux, naturaliste célèbre, botaniste en chef sur le Naturaliste. Il quitte la France avec pour but d'en rester absent pendant dix ans et ne se considère donc que comme un passager. Il quitte l'expédition à l'île de France en . Jacques Delisse, originaire de Dax, est botaniste adjoint à bord du Naturaliste. Il quitte l'expédition à l'île de France en . Anselme Riedlé, premier garçon au Jardin des Plantes, est un jardinier embarqué à bord du Géographe. Il meurt de dysenterie dans la baie de Coupang, en . Antoine Sautier, jardinier chargé d'assister Riedlé. Il meurt en mer le . Antoine Guichenot, autre jardinier. Jean-François Cagnet, garçon jardinier. Attaché au service de Michaux, il quitte avec lui l'expédition en à l'île de France.