vignette|180px|La Primatiale Saint-Jean et la basilique Notre-Dame de Fourvière en arrière-plan. vignette|180px|La vierge dorée veille sur Lyon
La ville de Lyon possède un riche patrimoine religieux : églises, monastères, couvents, congrégations religieuses et autres statues d'angle de rues. Cette liste classe les édifices religieux par arrondissement et les bâtiments par type.
1 arrondissement
Culte catholique Église Saint-Bruno-lès-Chartreux, rue Pierre Dupont : église baroque de Ferdinand-Sigismond Delamonce Église du Bon-Pasteur, rue Neyret : église des pentes de la Croix-Rousse. Non vouée au culte, sans parvis, les portes débouchent à trois mètres du sol. Église Saint-Polycarpe, rue René Leyraud : église Saint-Polycarpe des Église Notre-Dame-Saint-Vincent, quai Saint-Vincent : église de style néo-classique, restaurée en 1990 Église Saint-Pierre-des-Terreaux de Lyon, rue Paul Chenavard : ancienne église du couvent des Dames de Saint-Pierre (du ). Aujourd’hui glyptothèque du musée des beaux-arts de Lyon. Église Saint-Bernard, rue de Général de Sève, construite de 1857 à 1866 sur l'emplacement de l'ancien couvent des Bernardines de Lyon aujourd'hui désacralisée. Chapelle du Sacré-Cœur des Chartreux, rue Pierre Dupont. Chapelle institution des Chartreux, rue Pierre Dupont. Chapelle des Colinettes, Montée Saint-Sébastien, devenu hôpital militaire Villemanzy, fermé. Chapelle des Sœurs de Saint-Charles, montée des Carmélites. Église Saint-Saturnin, à quelques mètres de l'église Saint-Pierre, construite au et détruite pendant la Révolution. Église Notre-Dame de la Platière, détruite
Culte musulman Mosquée Koba : 10, bis rue Imbert-Colomès.
Culte protestant Église évangélique Bonne Nouvelle, quai Saint-Vincent. Temple protestant des Terreaux, rue Lanterne
Témoins de Jéhovah Salle du royaume, rue Mottet de Gérando.
2 arrondissement Culte catholique Basilique Saint-Martin d'Ainay, place d'Ainay : basilique romane du dans le quartier d'Ainay Église Saint-Nizier, place Saint-Nizier : église bâtie du située dans le quartier des Cordeliers Basilique Saint-Bonaventure, place des Cordeliers : église des Cordeliers, moines (franciscains) du Église Sainte-Blandine, Cours Charlemagne : église du sur le cours Charlemagne dans le quartier de Perrache Église Sainte-Croix, rue de Condé : église dans le Église Saint-François de Sales, rue Auguste-Comte : église de 1830, dôme, façade monumentale, grand orgue Cavaillé-Coll. Chapelle de l'Hôtel-Dieu (Notre-Dame-de-Pitié), place de l'Hôpital : chapelle de l’hôpital du située dans le quartier de Bellecour Chapelle de la Trinité, rue de la Bourse, dans le lycée Ampère : le fleuron de l'art baroque Chapelle Paul-Couturier, 12 rue Henri-IV : chapelle située dans le foyer du même nom, lieu de création en particulier de la Semaine de prière pour l'unité des chrétiens. Bateau chapelle le Lien quai Rambaud. Chapelle Saint-Ignace des clarisses, rue Sala. Chapelle Saint-Marc de l'ensemble scolaire, rue Sainte-Hélène. Clocher de l'hôpital de la Charité, place Antonin-Poncet. Chapelle Saint-Irénée: Anciennement située rue d'Inkermann (maintenant quai Perrache), elle est la résultante d'une communauté de catholiques traditionalistes existant depuis 1972 et alors initialement guidée par l'abbé Paul Aulagnier. Celle-ci subit d'abord une perte de certains ses membres qui devinrent, en 1980, sédévacantistes à la suite de l'action du père Michel Guérard des Lauriers puis une scission lorsque fut créée, en 1988, la Fraternité sacerdotale Saint-Pierre. Indécelable depuis la rue, l'intérieur de la chapelle ressemble à une véritable église où les prêtres de la Fraternité sacerdotale Saint-Pie-X célèbrent la liturgie selon le rite tridentin. Adjacente à cette dernière, se trouve le prieuré éponyme. Couvent des Célestins de Lyon. Bateau-chapelle des bateliers de Lyon
Culte hébraïque
Grande Synagogue du quai Tilsitt (Lyon)
3 arrondissement Culte arménien Église arménienne Saint-Jacques, rue André-Philip.
Culte catholique Église du Sacré-Cœur, rue Antoine-Charial : inachevée, sans dôme ni nef Église Notre-Dame-du-Bon-Secours, avenue du Château : église du quartier de Montchat Église Sainte-Jeanne-d'Arc, rue Jeanne-d'Arc. Église du Saint-Sacrement, rue Étienne-Dolet. Église de l'Immaculée Conception, rue Pierre-Corneille : quartier de La Guillotière Chapelle de l'hôpital Édouard-Herriot, rue du Professeur-Florence : chapelle du quartier de Grange Blanche. Chapelle de l'hôpital Desgenettes, cours Éugénie. Chapelle des Petites Sœurs des Pauvres, rue Gandolière. Église Sainte-Anne de Baraban (aujourd'hui détruitequelques infos, une photo.) Église de la cité Rambaud, détruite.
Culte musulman Mosquée Abou Bakr : 19, rue Paul-Bert, fermée. Mosquée Es-Salam : 119, rue Baraban, fermée.
Culte protestant Grand Temple de Lyon, église réformée EPUdF, 3 quai Victor-Augagneur Église évangélique arménienne, rue du Docteur-Paul-Diday. Armée du Salut, Congrégation 304 rue Duguesclin Église réformée, rue Constant (détruite). Évangélique Mission protestante, rue Paul-Bert.
4 arrondissement Culte catholique Saint-Augustin, rue Denfert-Rochereau : église romano-byzantine du plateau de la Croix-Rousse Saint-Charles de Serin, rue André-Bonin : église détruite puis rebâtie après la construction du tunnel de la Croix-Rousse Église Saint-Denis, rue Jacques-Louis-Hénon : église Église Sainte-Élisabeth, rue Jacques-Louis-Hénon : église sur le plateau de la Croix-Rousse Église Saint-Eucher, rue des Actionnaires. Chapelle de la congrégation des Petites Sœurs des Pauvres, rue Jacques-Louis-Hénon. Chapelle de l'hôpital, 103 Grand-Rue de la Croix Rousse. Chapelle de la Providence des Trinitaires, rue Bony.
5 arrondissement Culte catholique 150px|vignette|Église Saint-Paul. Primatiale Saint-Jean-Baptiste (ou cathédrale Saint-Jean), place Saint-Jean, dans le Vieux Lyon. L'Archevêque de Lyon est l'Évêque des Gaules, premier évêché de France. Son titulaire détient le titre honorifique de primat des Gaules prévalant sur l'ensemble des autres hommes d'Église en France. Notre-Dame de Fourvière, place de Fourvière, dédiée à l'Immaculée Conception. Sa construction a commencé en 1872, mais les œuvres de sculpture n'ont jamais été achevées. Située au sommet de la colline, elle est un des repères les plus visibles depuis toute l'agglomération lyonnaise. Elle est fréquentée chaque année par plus de deux millions et demi de visiteurs. Chapelle Saint-Thomas de Canterbury, place de Fourvière (jouxtant l'arrière de la chapelle de la Vierge). Chapelle Notre-Dame-de Fourvière, dite Chapelle de la Vierge, place de Fourvière, datant de 1168. Ces deux chapelles ont été en partie reconstruites à la fin du XVIe. Le clocher de la chapelle de la Vierge qui comptait une girouette aux armes du Doyen et des chanoines comtes de St Jean, depuis 1580, a été profondément remanié par Alphonse Duboys afin d'y installer, le , une magistrale statue de la Vierge Marie ouvrant ses bras sur la ville de Lyon. Cette statue recouverte d'or mesure de haut et est signée par Joseph-Hugues Fabisch ; statue de la Vierge miraculeuse, objet de pèlerinages, ex-voto. Église Notre-Dame du Point du Jour, rue de Champvert : église sur le plateau du . Église Sainte-Anne de Ménival, avenue de Ménival : église de Ménival. Église Saint-Irénée, place Saint-Irénée : abside paléochrétienne, crypte restaurée, calvaire de Lyon Église Saint-Georges, rue Saint-Georges : église du de l'architecte Pierre Bossan où la messe est célébrée dans le rite extraordinaire. Église Saint-Just, rue des Farges : une des plus grandes églises de Lyon, détruite par les protestants en 1562, puis reconstruite au . Façade de par Ferdinand-Sigismond Delamonce (pilastres corinthiens) Église Saint-Paul, rue Saint-Paul : église des , : en grande partie romane. Façade gothique. Chapelle du centre Don Bosco, rue Roger-Radisson. Chapelle du foyer Jean Pierre Delahaye, rue Roger-Radisson. Chapelle Sainte-Claudine de Jésus Marie, place de Fourvière. Chapelle des religieuses du Verbe Incarné, rue Roger-Radisson. Chapelle des Carmes, rue Roger-Radisson. Chapelle de l'hôpital de Fourvière, rue Roger-Radisson. Chapelle de la Chartreuse Saint-Just, place de l'Abbé-Larue. Chapelle du couvent des Carmes déchaussés, rue de Montauban, transformé en établissement scolaire. Chapelle de la communauté du Chemin Neuf, montée du Chemin-Neuf. Chapelle du couvent des Visitandines de l'Antiquaille, montée Saint-Barthélemy. Chapelle des Lazaristes, montée Saint-Barthélemy. Chapelle de la Maison Pauline Jaricot, montée Saint-Barthélemy. Chapelle Saint-Irénée de rite Byzantin, place Saint-Irénée. Chapelle des Servantes du Saint-Sacrement, rue Cleberg. Chapelle Sainte-Marie, rue de Montauban. Chapelle maison de Thérèse le Cénacle, place de Fourvière. Séminaire Saint-Irénée de Lyon, rue Roger-Radisson. Basilique funéraire Saint-Laurent de Choulans : vestiges d'une basilique funéraire de la fin du et de nombreuses tombes (immeuble Highway) Église Saint-Étienne et Sainte-Croix : vestiges des deux églises dans le parc archéologique jouxtant la cathédrale : baptistère Église Saint-Romain de Lyon, disparue. Église Saint-Alban de Lyon, disparue. Église Saint-Pierre-le-Vieux (détruite en 1866)
Culte protestant Temple du Change, ancienne Loge du Change, église réformée depuis 1803
Témoins de Jéhovah Salle du royaume, rue des Anges.
6 arrondissement Culte catholique Église Saint-Pothin, rue de Vendôme. Église Notre-Dame de Bellecombe, rue d'Inkermann. Église de la Rédemption, rue Vendôme. Église Saint-Joseph des Brotteaux, rue Masséna. Église du Saint-Nom-de-Jésus, place du Cardinal-Jean-Villot. Chapelle Sainte-Croix, rue de Créqui.
Culte protestant Église luthérienne EPUdF, 12 rue Fénelon. Église Évangélique Baptiste, 85 cours Vitton. Église Évangélique adventiste, rue Vendôme. Église Évangélique pentecôtiste, rue Robert. Église néo-apostolique, cours André-Philip.
Culte orthodoxe Église orthodoxe Saint-Nicolas, rue Sainte-Geneviève.
Témoins de jéhovah Salle du royaume, passage Coste.
7 arrondissement Culte catholique Église Saint-André, rue de Marseille. Église Notre-Dame des Anges, rue Félix-Brun : église au cœur du quartier de Gerland Église Notre-Dame Saint-Louis, rue de la Madeleine : église au cœur de la Guillotière Église Saint-Antoine, avenue Jean-Jaurès : église à Gerland Église Saint-Michel et Saint-André, avenue Berthelot : église rebâtie après les bombardements alliés de la Seconde Guerre mondiale sur l'avenue Berthelot Église Sainte-Marie de la Guillotière, boulevard des Tchécoslovaques (ensemble scolaire Chevreul-Lestonnac). Chapelle Notre-Dame des Sept Douleurs dite du Prado, rue de Père-Chevrier. Chapelle des religieuses de l'Adoration Réparatrice, boulevard Yves-Farge. Chapelle Saint François-Xavier, Centre Laennec Lyon (salle de travail transformée en chapelle consacrée) inaugurée en 2023.
Culte hébraïque Synagogue, 317 rue Duguesclin.
Culte musulman Mosquée Mossab Ibn Omaïr : 15, rue Sébastien-Gryphe. Mosquée de Gerland : 64, rue Clément-Marot.
Culte protestant Église réformée EPUdF, 50 rue Bancel Église Évangélique pentecôtiste, rue de Cronstadt.
Culte orthodoxe Église de l'Annonciation, rue d'Athènes, fresques récentes (métropole grecque, patriarcat de Constantinople)
Témoins de jéhovah Salle du royaume, rue de Lieutenant-Colonel-Girard.
8 arrondissement Culte catholique thumb|Église Saint-Maurice de Monplaisir.. Église Notre-Dame-Saint-Alban, rue Laennec : église Église Saint-Maurice, rue Saint-Maurice : église Église Sainte-Trinité, place Marc-Sanguier : église Église Saint-Jacques, rue Jean-Sarrazin : église du quartier des États-Unis Église Notre-Dame de l'Assomption, rue Hugues-Guérin. Église Saint-Vincent de Paul, route de Vienne (Lyon).