En biologie, l'empire (en latin imperium) est une catégorie taxonomique supérieure à celle du règne. Il est parfois considéré comme un synonyme du terme plus récent de domaine. Toutefois, ces notions ne se recouvrent pas totalement. En particulier, le terme d'empire est préféré dans le contexte de la systématique évolutionniste ou bien dans le cadre du « modèle à deux empires ».
Historique
Historiquement, c'est le terme empire qui a été proposé en premier, par analogie avec la domination d'un empire sur des royaumes vassaux (les « règnes » de la classification). Linné arrangeait tous les objets naturels à l'intérieur de trois règnes (minéral, végétal et animal) dont, à partir de la dixième édition (1758) du Systema Naturae, il définissait les frontières au sein de l'empire de la nature : Imperium Naturae. Dès 1766 Peter Simon Pallas, Elenchus Zoophytorum, generum adumbrationes, specierum descriptiones, cum selectis synonymis, La Haye, 1766., Pallas divisait la nature en deux empires. Ce sont deux groupes (les corps bruts et les êtres organisés) que Pallas a placés au-dessus des règnes sous la dénomination d'empires : l'empire inorganique constitué par le règne minéral, et l'empire comprenant les deux règnes animal et végétal. Aujourd'hui on parle plutôt de monde inerte et de monde vivant.
Modèle à deux empires
Au , le terme d'empire a été employé pour désigner la structure radicalement différente des procaryotes et des eucaryotes (voir aussi plan d'organisation).
Selon Thomas Cavalier-Smith (1998) Thomas Cavalier-Smith, 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266. : Empire Prokaryota Règne Bacteria Sous-règne Unibacteria Sous-règne Negibacteria Empire Eukaryota Règne Protozoa Règne Animalia Règne Fungi Règne Plantae Règne Chromista
Voir également Mayr (1998) Ernst Mayr, "Two empires or three?", Proceedings of the National Academy of Sciences, Vol.95, No.17, August 18, 1998, p.9720–9723.
Variantes Pour la plupart des taxonomistes, le domaine est équivalent au superrègne. On trouve cependant parfois des classifications où le choix a été fait d'intercaler les rangs de sous-domaine et de superrègne entre le domaine et le règne. Des variantes de classification sont élaborées par glissement de rang des taxons supérieurs.
Classification à deux domaines Selon Ernst Mayr (1990) En 1990, le systématicien évolutionniste Mayr retient un système naturel d'organismes à deux domaines divisés en quatre sous-domaines Ernst Mayr, "A natural system of organisms" , Nature, Vol.348, No.6301, December 6, 1990, p.491. : Domaine Prokaryota (Monera) Sous-domaine Eubacteria Sous-domaine Archaebacteria Règne Crenarchaeota Règne Euryarchaeota Domaine Eukaryota Sous-domaine Protista Sous-domaine Metabionta Règne Metaphyta (plantes) Règne Fungi Règne Metazoa (animaux)
Selon Radhey S. Gupta (1998) En 1998, Gupta propose une classification Gupta RS (1998). What are archaebacteria: life's third domain or monoderm prokaryotes related to gram-positive bacteria? A new proposal for the classification of prokaryotic organisms. Mol Microbiol. 29(3):695-707. à la suite de ses travaux sur les liens phylogénétiques et structuraux unissant les bactéries à Gram positif et les archébactéries.
Domaine Eucaryotae Domaine Procaryotae Sous-domaine Monodermata Sous-sous-domaine Archaebacteria Division Euryarchaeota Division Crenarchaeota Sous-sous-domaine "bactéries à Gram positif" Division "Low G+C" Division "High G+C" Sous-domaine Didermata (bactéries à Gram négatif)
Classification à deux superrègnes Selon Robert H. Wittaker et Lynn Margulis (1978) En 1978, Whittaker et Margulis s'accordent sur une classification des organismes suivant deux super règnes et cinq règnes Robert Harding Whittaker & Lynn Margulis, "Protist classification and the kingdoms of organisms", Biosystems, Vol.10, No.1-2, April 1978, p.3-18. : Superrègne Prokaryota Règne I. Monera Superrègne Eukaryota Règne II. Protista ou Protoctista Règne III. Animalia Règne IV. Fungi Règne V. Plantae
Selon Charles Jeffrey (1982) En 1982, le botaniste Jeffrey propose une classification à deux superrègnes développés différemment en cinq règnes Charles Jeffrey, "Kingdoms, Codes and Classification", Kew Bulletin, Vol.37, 1982, p.403-416. : Superrègne Prokaryota Règne I. Bacteriobiota Règne II. Archeobacteriobiota Superrègne Eukaryota Règne III. Phytobiota Règne IV. Mycobiota Règne V. Zoobiota
Selon Thomas Cavalier-Smith (1987) En 1987, Cavalier-Smith présente une classification rangée en deux superrègnes et sept règnes : Superrègne 1. Prokaryota Règne 1. Eubacteria Règne 2. Archaebacteria (= Metabacteria) Superrègne 2. Eukaryota Règne 1. Protozoa Règne 2. Chromista Règne 3. Fungi Règne 4. Plantae Règne 5. Animalia
Selon Lynn Margulis et Michael J. Chapman (2009) Les biologistes Margulis et Chapman (2009) Lynn Margulis & Michael J. Chapman, Kingdoms & Domains : An Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth, Academic Press, Boston, 2009, 731 p. proposent une classification taxonomique du vivant où le domaine est une division du règne et dont l'articulation entre taxons se résume ainsi : thumb|Origine des eucaryotes selon la théorie endosymbiotique. Superrègne Prokarya Règne Bacteria Domaine Archaea Domaine Eubacteria Superrègne Eukarya Règne Protoctista (Hogg 1860) Règne Animalia Règne Fungi Règne Plantae
Selon Michael A. Ruggiero et al. (2015) Les biologistes Ruggiero (2015), incluant Cavalier-Smith, développent une classification des organismes vivants subdivisée en deux superrègnes et sept règnes, selon le schéma simplifié suivant : Superrègne Prokaryota Règne Archaea (= Archaebacteria) Règne Bacteria (= Eubacteria) Superrègne Eukaryota Règne Protozoa Règne Chromista Règne Fungi Règne Plantae Règne Animalia
Critiques
Pour les cladistes le modèle à deux empires n'est pas pertinent car il admet des taxons paraphylétiques comme les procaryotes. Cette critique n'est cependant pas acceptée par les évolutionnistes puisque selon eux, les groupes paraphylétiques peuvent servir à créer une classification..
Évolution des systèmes de classification
Autres rangs taxonomiques
Notes et références
Notes
Références
Voir aussi Biota, le taxon censé regrouper l'ensemble des formes de vie sur Terre, parfois élevé au rang d'Empire Classification classique Arbre phylogénétique Phylogénie Évolutionnisme Règne
Catégorie:Rang taxinomique Biologie