FMS est un sigle qui peut désigner :
organisations Fédération mondiale des sourds, une organisation non gouvernementale internationale pour les sourds ; Fondation pour la mémoire de la Shoah, une institution française créée en 2000 ;
informatique Flash Media Server, le serveur de diffusion vidéo développé par Adobe ; Fortran Monitor System, un ancien système d'exploitation d'ordinateur ; Freenet Messaging System, un logiciel de messagerie pour le réseau Freenet ;
autres , une adaptation du bus Controller area network pour les véhicules de transport en commun ; Foreign Military Sales, un programme américain de soutien aux exportations d'armement ; Flight management system (en français, système de gestion de vol), en aéronautique ; fermentation en milieu solide ; Fisichella Motor Sport, une équipe de sport automobile ; Flexible manufacturing system (en français, Atelier flexible).
F.M.S. ou f.m.s. est un sigle qui peut désigner : Institutum Fratrum Maristarum a Scholis (en français, Frères maristes), une congrégation laïque masculine enseignante.