Les Bacteroidota (anc. Bacteroidetes) sont un phylum du règne des Pseudomonadati au sein du domaine Bacteria. Son nom provient de Bacteroides qui est le genre type de ce phylum.
Ces bactéries sont largement répandues dans l'environnement, notamment dans le sol, dans les sédiments, l'eau de mer et dans les intestins d'animaux.
Introduction De loin, la classe des Bacteroidales est l'une des plus étudiées, notamment les genres Bacteroides (organismes abondants dans les selles des animaux à sang chaud, dont les humains) et Porphyromonas (un groupe d'organismes vivant dans la cavité buccale de l'Homme).
Les membres du genre Bacteroides sont des agents pathogènes opportunistes, rarement membres des deux autres classes de pathogènes pour l'Homme.
Le chercheur Jeffrey Gordon et ses collègues ont constaté que la flore intestinale des humains obèses possède un pourcentage plus faible de bactéries du phylum Bacteroidetes. Toutefois, ils ne savent pas si les Bacteroidetes peuvent prévenir l'obésité ou si cette flore intestinale n'est pas simplement préférée par l'intestin chez les personnes non obèses.
Taxonomie Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Bacteroidota Krieg 2021.
Le genre type est Bacteroides Castellani & Chalmers 1919.
Étymologie L'étymologie du nom du phylum Bacteroidota est la suivante : Bac.te.ro.i.do’ta N.L. masc. n. Bacteroides, genre type du phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour désigner un phylum; N.L. neut. pl. n. Bacteroidota, le phylum des Bacteroides.
Nomenclature Ce phylum est proposé dès 2010 par N.R. Krieg dans la deuxième édition de Bergey's Manual of Systematic Bacteriology sous le nom de « Bacteroidetes »Krieg NR « Phylum XIV. Bacteroidetes phyl. nov. » In : Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W & Whitman WB (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2ème édition, vol. 4 (The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes). Springer, New York, 2010. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-0-387-68572-4_3. Ce n'est qu'en 2021 qu'il est publié de manière valide par Oren et Garrity après un renommage conforme au code de nomenclature bactérienne (le nom du phylum devant être dérivé de celui de son genre type, en l'occurrence Bacteroides, par adjonction du suffixe -ota conformément à une décision de l'ICSP en 2021Oren A « Emendation of Rules 5b, 8, 15 and 22 of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes to include the rank of phylum » Int J Syst Evol Microbiol. 2021;71(6):004851. Accès libre.).
Synonymie Le phylum Bacteroidota a pour synonymes : Bacteroidaeota Oren 2015 Bacteroidetes Krieg 2010 Bacteroidota Whitman 2018
Liste des classes Selon ce phylum comporte les classes suivantes :
Notes et références
Liens externes
Catégorie:Bacteria Catégorie:Bacteroidota Catégorie:Phylum de bactéries (nom scientifique) Catégorie:Bactérie décrite en 2021 Catégorie:Bactérie décrite en 2010