Le département de San Pedro est une des 17 subdivisions de la province de Misiones, en Argentine. Son chef-lieu est la ville de San Pedro.
Le département a une superficie de . Sa population s'élevait à habitants, selon le recensement de 2001. Sa population était estimée à habitants par l'INDEC en 2005.
Villes et localités San Pedro, chef-lieu Tobuna
San Pedro