Liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé

Cette liste d'espèces protéobacteriennes dont le génome est séquencé (qui peut ne pas être à jour) présente une liste d'espèces de Proteobacteria dont le génome a été séquencé. La plupart de ces séquences ont été publiées dans des bases de données biologiques de séquences, et se trouvent en général dans la base de données publique INSDB (pour , en anglais), laquelle peut être consultée sur internet .. Les génomes ci-dessous annotés comme « non publiés » n'ont pas été publiés dans une publication scientifique à comité de lecture (mais sont généralement disponibles dans une base de données).

Delta-Epsilonproteobacteria + Espèces deltaprotéobactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceAnaeromyxobacter dehalogenans2CP-CProteobacteria delta-epsilon5,013,4794,346Non publiéBdellovibrio bacteriovorusHD100Proteobacteria delta-epsilon3,782,9503,583Campylobacter jejuniNCTC11168Proteobacteria delta-epsilon1,641,4811,643Campylobacter jejuniRM1221Proteobacteria delta-epsilon1,777,8311,838Desulfotalea psychrophilaLSv54Proteobacteria delta-epsilon3,523,3833,118Non publiéDesulfovibrio desulfuricansG20Proteobacteria delta-epsilon3,730,2323,775Non publiéDesulfovibrio vulgarisHildenboroughProteobacteria delta-epsilon3,570,8583,379Geobacter metallireducensGS15Proteobacteria delta-epsilon3,997,4203,519Non publiéGeobacter sulfurreducensPCAProteobacteria delta-epsilon3,814,1393,447Helicobacter hepaticusATCC51449Proteobacteria delta-epsilon1,799,1461,875Helicobacter pylori26695Proteobacteria delta-epsilon1,667,8671,566Helicobacter pyloriHPAG1Proteobacteria delta-epsilon1,596,3661,536Non publiéHelicobacter pyloriJ99Proteobacteria delta-epsilon1,643,8311,491Lawsonia intracellularisPHEMN1-00Proteobacteria delta-epsilon1,719,0141,344Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria delta-epsilon39,79424Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria delta-epsilon194,553104Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria delta-epsilon1,457,6191,187Non publiéMyxococcus xanthusDK1622Proteobacteria delta-epsilon9,139,7637,331Non publiéPelobacter carbinolicusDSM2380Proteobacteria delta-epsilon3,665,8933,119Non publiéSyntrophus aciditrophicusSBProteobacteria delta-epsilon3,179,3003,168Non publiéThiomicrospira denitrificansATCC33889Proteobacteria delta-epsilon2,201,5612,097Non publiéWolinella succinoDSMZ1740Proteobacteria delta-epsilon2,110,3552,044

Alphaproteobacteria + Espèces alphaprotéobactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceAgrobacterium tumefaciensC58Proteobacteria Alphaproteobacteria2,841,5812,722Anaplasma marginaleStMariesProteobacteria Alphaproteobacteria1,197,687949Anaplasma phagocytophilumHZProteobacteria Alphaproteobacteria1,471,2821,264Bartonella henselaeHouston-1Proteobacteria Alphaproteobacteria1,931,0471,612Bartonella quintanaToulouseProteobacteria Alphaproteobacteria1,581,3841,308Bradyrhizobium japonicumUSDA110Proteobacteria Alphaproteobacteria9,105,8288,317Brucella abortus2308 (chromosome I)Proteobacteria Alphaproteobacteria1,156,9481,1642308 (chromosome II)Proteobacteria Alphaproteobacteria2,121,3592,186Brucella abortus9-941 (chromosome I)Proteobacteria Alphaproteobacteria2,124,2412,0309-941 (chromosome II)Proteobacteria Alphaproteobacteria1,162,2041,055Brucella melitensis16M (chromosome I)Proteobacteria Alphaproteobacteria2,117,1442,05916M (chromosome II)Proteobacteria Alphaproteobacteria1,177,7871,139Brucella suis1330 (chromosome I)Proteobacteria Alphaproteobacteria2,107,7942,1231330 (chromosome II)Proteobacteria Alphaproteobacteria1,207,3811,150Caulobacter crescentusCB15Proteobacteria Alphaproteobacteria4,016,9473,737Ehrlichia canisJakeProteobacteria Alphaproteobacteria1,315,030925Non publiéEhrlichia chaffeensisArkansasProteobacteria Alphaproteobacteria1,176,2481,105Ehrlichia ruminantiumGardelProteobacteria Alphaproteobacteria1,499,920950Non publiéEhrlichia ruminantiumWelgevondenProteobacteria Alphaproteobacteria1,512,977958Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Alphaproteobacteria1,516,355920Erythrobacter litoralisHTCC2594Proteobacteria Alphaproteobacteria3,052,3983,011Non publiéGluconobacter oxydans621HProteobacteria Alphaproteobacteria2,702,1732,432Jannaschia speciesCCS1Proteobacteria Alphaproteobacteria4,317,9774,212Non publiéMagnetospirillum magneticumAMB1Proteobacteria Alphaproteobacteria4,967,1484,559Mesorhizobium lotiMAFF303099Proteobacteria Alphaproteobacteria7,036,0716,752Neorickettsia sennetsuMiyayamaProteobacteria Alphaproteobacteria859,006932Nitrobacter hamburgensisX14Proteobacteria Alphaproteobacteria4,406,9673,804Non publiéNitrobacter winogradskyiNb255Proteobacteria Alphaproteobacteria3,402,0933,122Non publiéNovosphingobium aromaticivoransDSM12444Proteobacteria Alphaproteobacteria3,561,5843,324Non publiéPelagibacter ubiqueHTCC1062Proteobacteria Alphaproteobacteria1,308,7591,354Rhizobium etliCFN42Proteobacteria Alphaproteobacteria4,381,6084,067Rhizobium leguminosarumviciae3841Proteobacteria Alphaproteobacteria7,751,3094,746Non publiéRhodobacter sphaeroides2.4.1Proteobacteria Alphaproteobacteria3,188,6093,022Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Alphaproteobacteria943,016835Non publiéRhodopseudomonas palustrisBisB5Proteobacteria Alphaproteobacteria4,892,7174,397Non publiéRhodopseudomonas palustrisCGA009Proteobacteria Alphaproteobacteria5,459,2134,833Rhodopseudomonas palustrisHaA2Proteobacteria Alphaproteobacteria5,331,6564,683Non publiéRhodospirillum rubrumATCC11170Proteobacteria Alphaproteobacteria4,352,8253,791Non publiéRickettsia belliiRML369-CProteobacteria Alphaproteobacteria1,522,0761,429Non publiéRickettsia conoriiMalish7Proteobacteria Alphaproteobacteria1,268,7551,374Rickettsia felisURRWXCal2Proteobacteria Alphaproteobacteria1,485,1481,400Rickettsia prowazekiiMadrid-EProteobacteria Alphaproteobacteria1,111,523834Rickettsia typhiWilmingtonProteobacteria Alphaproteobacteria1,111,496838Rhodopseudomonas palustrisBisB18Proteobacteria Alphaproteobacteria5,513,8444,886Non publiéSilicibacter pomeroyiDSS3Proteobacteria Alphaproteobacteria4,109,4423,810Silicibacter speciesTM1040Proteobacteria Alphaproteobacteria3,200,9383,030Non publiéSinorhizobium melilotiRm1021Alphaproteobacteria3,654,1353,341Sphingopyxis alaskensisRB2256Proteobacteria Alphaproteobacteria3,345,1703,165Non publiéWolbachia endosymbiontTRSProteobacteria Alphaproteobacteria1,080,084805Wolbachia pipientiswMelProteobacteria Alphaproteobacteria1,267,7821,195Zymomonas mobilisZM4Proteobacteria Alphaproteobacteria2,056,4161,998

Betaproteobacteria + Espèces bétaprotéobactériennes dont le génome est séquencéEspèceSoucheTypeNombre de paires de basesNombre de gènesRéférenceAzoarcus sp.EbN1Proteobacteria Betaproteobacteria4,296,2304,128Bordetella bronchisepticaRB50Proteobacteria Betaproteobacteria5,339,1795,006Non publiéBordetella parapertussis12822Proteobacteria Betaproteobacteria4,773,5514,402Non publiéBordetella pertussisTohamaIProteobacteria Betaproteobacteria4,086,1893,806Non publiéBurkholderia cenocepaciaAU1054Proteobacteria Betaproteobacteria3,294,5632,965Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria2,788,4592,472Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria1,196,0941,040Non publiéBurkholderia malleiATCC23344Proteobacteria Betaproteobacteria3,510,1482,996Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria2,325,3792,029Burkholderia pseudomallei1710bProteobacteria Betaproteobacteria4,126,2923,736Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria3,181,7622,611Non publiéBurkholderia pseudomalleiK96243 (chromosome I)Proteobacteria Betaproteobacteria4,074,5423,460K96243 (chromosome II)Proteobacteria Betaproteobacteria3,173,0052,395Burkholderia species383Proteobacteria Betaproteobacteria3,694,1263,334Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria3,587,0823,174Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria1,395,0691,209Non publiéBurkholderia thailandensisE264Proteobacteria Betaproteobacteria3,809,2013,276BMC Genomics. 2005 Dec 7, DecNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria2,914,7712,358Burkholderia xenovoransLB400Proteobacteria Betaproteobacteria4,895,8364,430Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria3,363,5232,960Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria1,471,7791,312Non publiéChromobacterium violaceumATCC12472Proteobacteria Betaproteobacteria4,751,0804,407Dechloromonas aromaticaRCBProteobacteria Betaproteobacteria4,501,1044,171Non publiéMethylobacillus flagellatusKTProteobacteria Betaproteobacteria2,971,5172,753Non publiéNeisseria gonorrhoeaeFA1090Proteobacteria Betaproteobacteria2,153,9222,002Non publiéNeisseria meningitidisAProteobacteria Betaproteobacteria2,184,4062,121Neisseria meningitidisBProteobacteria Betaproteobacteria2,272,3602,063Nitrosomonas europaeaSchmidtProteobacteria Betaproteobacteria2,812,0942,574Nitrosospira multiformisATCC25196Proteobacteria Betaproteobacteria3,184,2432,757Non publiéPolaromonas speciesJS666Proteobacteria Betaproteobacteria5,200,2644,817Non publiéRalstonia eutrophaJMP134Proteobacteria Betaproteobacteria3,806,5333,439Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria2,726,1522,407Non publiéRalstonia metalliduransCH34Proteobacteria Betaproteobacteria3,928,0893,601Non publiéNon spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria2,580,0842,313Non publiéRalstonia solanacearumGMI1000Proteobacteria Betaproteobacteria3,716,4133,441Non spécifiéNon spécifiéProteobacteria Betaproteobacteria2,094,5091,679Rhodoferax ferrireducensDSM15236Proteobacteria Betaproteobacteria4,712,3374,170Non publiéThiobacillus denitrificansATCC25259Proteobacteria Betaproteobacteria2,909,8092,827Non publié

Gammaproteobacteria