thumb|Structure d'une protéine antivirale du raisin d'Amérique. Les protéines inactivant les ribosomes, ou ribosome-inactivating proteins (abrégé en RIP), sont des protéines inhibant la synthèse protéique des cellules grâce à leur activité enzymatique qui désactive les ribosomes des organismes eukaryotes. Ce terme désigne une grande famille de protéines qui agissent comme des N-glycosylases de l'ARNr (EC 3.2.2.22). Elles inactivent les sous-unités ribosomiques 60S par un clivage N-glycosidique, qui libère une base adénine spécifique du squelette sucre-phosphate de l'ARNr 28S. Les RIPs sont retrouvés surtout chez les plantes et les bactéries mais aussi dans certains champignons et animaux .
Cette famille de protéines comprend les toxines de Shiga et assimilées, et les RIPs de type I (par exemple trichosanthine et luffine) et type II (par exemple ricine, agglutinine I du ricin et abrine). Toutes ces toxines sont structurellement apparentées. Les RIPs présentent un intérêt considérable en raison de leur utilisation potentielle, conjuguée avec les anticorps monoclonaux, comme immunotoxines pour traiter le cancer. L'élucidation des relations entre structures et fonctions des RIPs a par conséquent fait l'objet de recherches importantes.
Liste de protéines inactivant les ribosomes (RIPs) +D'après Gilabert-Oriol et al., tableau adapté et actualisé.Organisme sourceRIP (nom anglais)RIP (nom français)TypeMasse moléculaire (kDa)IC50 (nM) de l'activité inhibitrice sur la synthèse protéique (milieu acellulaire).Réf.BactérieEscherichia coliVerotoxin 1 (Shiga-like toxin 1, Stx 1)Vérotoxine 1AB570.5Verotoxin 2 (Shiga-like toxin 2, Stx 2)Vérotoxine 2AB570.5Shigella dysenteriaeShiga toxin (Stx)ShigatoxineAB570.7Streptomyces coelicolorS. coelicolor RIP (RIPsc)RIP de S. coelicolor129FungiFlammulina velutipesFlamminFlammine130FlammulinFlammuline140VelinVéline119VelutinVélutineSmall RIP13,8Hypsizygus marmoreusHypsinHypsine120MarmorinMarmorineSmall RIP9,6Lentinus edodesFruiting body protein (FBP)Protéine du corps fructifère123Lyophyllum shimejiLyophyllinLyophylline120Pleurotus tuberregiumPleutureginPleuturegine138Volvariella volvaceaVolvarinVolvarine129AlgueSaccharina japonica Aresch.LamjapinLamjapine136PlanteAbelmoschus esculentus (L.) MoenchAbelesculinAbelesculine130Abrus precatorius L.Abrin-aAbrine-a263Abrin-bAbrine-b267Abrin-cAbrine-c263Abrin-dAbrine-d267Abrin-IAbrine-I264Abrin-IIAbrine-II263Abrin-IIIAbrine-III263Abrus agglutininAgglutinine de Abrus267Abrus agglutininAgglutinine de Abrus2134APA-IAPA-I2130APA-IIAPA-II2128Abrus pulchellus L.PulchellinPulchelline261,5-63Adenia digitata Burtt-DavyModeccin (Modeccin 4B)Modeccine257Modeccin 6BModeccine 6B257Adenia ellenbeckii HarmsA. ellenbeckii RIPRIP de A. ellenbeckii130A. ellenbeckii RIPRIP de A. ellenbeckii260Adenia fruticosa Burtt-DavyA. fruticosa RIPRIP de A. fruticosa130Adenia goetzii Burtt-DavyA. goetzii RIPRIP de A. goetzii130A. goetzii RIPRIP de A. goetzii260Adenia keramanthus HarmsA. keramanthus RIPRIP de A. keramanthus260-65Adenia lanceolata Engl.A. lanceolata RIPRIP de A. lanceolata260LanceolinLancéoline261,2Adenia racemosa W.J. de WildeA. racemosa RIPRIP de A. racemosa130Adenia stenodactyla HarmsA. stenodactyla RIPRIP de A. stenodactyla260StenodactylinSténodactyline263,1Adenia venenata Forssk.A. venenata RIPRIP de A. venenata130A. venenata RIPRIP de A. venenata260Adenia volkensii HarmsVolkensinVolkensine262Agrostemma githago L.AgrostinAgrostine127Agrostin-2Agrostine-2130,6Agrostin-5Agrostine-5129,5Agrostin-6Agrostine-6129,6Allium sativum L.AllivinAllivineSmall RIP13Amaranthus caudatus L.Amaranthin (A. caudatus agglutinin, ACA)Amaranthine (agglutinine de A. caudatus)133-36Amaranthus tricolor L.A. tricolor antiviral protein-27 (AAP-27)Protéine-27 antivirale de A. tricolor127Amaranthus viridis L.AmaranthinAmaranthine130Aralia elata (Miq.) Seem.Aralin (A. elata lectin)Araline (lectine de A. elata)261,3Asparagus officinalis L.A. officinalis RIPRIP de A. officinalis132,5Asparin 1Asparine 1130,5Asparin 2Asparine 2129,8Basella rubra Roxb.B. rubra RIP 2aRIP 2a de B. rubra130,6B. rubra RIP 2bRIP 2b de B. rubra131,2B. rubra RIP 3RIP 3 de B. rubra131,2Ricinus communis L.RicinRicine262Ricin 1Ricine 1264Ricin 2Ricine 2267Ricin 3Ricine 3266Ricin DRicine D260Ricin ERicine E260Ricinus agglutinin (RCA120)Agglutinine de Ricinus (RCA120)2120Ricinus agglutinin 1 (RCA1)Agglutinine de Ricinus 1 (RCA1)2134Ricinus agglutinin 2 (RCA2)Agglutinine de Ricinus 2 (RCA2)2140Ricinus sangineus Hort. ex GroenlandRicin R11Ricine R11257,8Ricin R12Ricine R12262,2Ricin R2Ricine R2263,1R. sanguineus agglutininAgglutinine de R. sanguineus2120Sambucus ebulus L.Alpha-ebulitinAlpha-ébulitine132Beta-ebulitinBeta-ébulitine129Ebulin fÉbuline f256Ebulin I (ebulin 1)Ébuline I256Ebulin r1Ébuline r1256Ebulin r2Ébuline r2256Gamma-ebulitinGamma-ébulitine129S. ebulus agglutinin (SEA)Agglutinine de S. ebulus2136Sambucus nigra L.Basic nigrin bNigrine basique b263,5Nigrin bNigrine b258Nigrin fNigrine f258Nigrin l1Nigrine l1258Nigrin l2Nigrine l2258Nigrin sNigrine s257Nigritin f1Nigritine f1224,1Nigritin f2Nigritine f2223,6S. nigra agglutinin I (SNAI)Agglutinine I de S. nigra2240SNA-I’SNA-I’2120SNLRP1SNLRP1262SNLRP2SNLRP2260-62Sambucus racemosa L.Basic racemosin bRacémosine basique b258S. racemosa agglutinin (SRA)Agglutinine de S. racemosa2140Sambucus sieboldiana L.S. sieboldiana agglutinin (SSA)Agglutinine de S. sieboldiana2116Sieboldin-bSieboldine-b259,4Sapium sebiferum (L.) Roxb.SEBINSEBIN129,8Saponaria ocymoides L.OcymoidineOcymoïdine130,2Saponaria officinalis L.Saporin-6Saporine-6129,5Saporin-9Saporine-9129,5Saporin-L1Saporine-L1131,6Saporin-L2Saporine-L2131,6Saporin-R1Saporine-R1130,2Saporin-R2Saporine-R2130,9Saporin-R3Saporine-R3130,9Saporin-S5Saporine-S5130,9Saporin-S6Saporine-S6131,6Saporin-S8Saporine-S8129,5Saporin-S9Saporine-S9129,5Secale cereale L.S. cereale RIPRIP de S. cereale131Sechium edule (Jacq.) Sw.SechiuminSechiumine127Spinacia oleracea L.S. oleracea RIP1 (SoRIP1, BP31)RIP1 de S. oleracea131S. oleracea RIP2 (SoRIP2)RIP2 de S. oleracea 129Stellaria aquatica Scop.StellarinStellarine127,5Stellaria media (L.) Vill.RIP Q3RIP Q3128,2Trichosanthes anguina L.TrichoanguinTrichoanguine135Trichosanthes cucumerina Wall.T. cucumerina seed lectin (TCSL)Lectine de la graine de T. cucumerinaRIP-like69Trichosanthes cucumeroides Maxim.Beta-trichosanthinBêta-trichosanthine128Trichosanthes dioica Roxb.T. dioica seed lectin (TDSL)Lectine de la graine de T. dioicaRIP-like55Trichosanthes kirilowii Maxim.Alpha-kirilowinAlpha-kirilowine128,8Alpha-trichosanthinAlpha-trichosanthine131,7Beta-kirilowinBeta-kirilowine127,5Karasurin-AKarasurine-A127,1Karasurin-BKarasurine-B127,2Karasurin-CKarasurine-C127,4S-TrichokirinS-TrichokirineSmall RIP8TAP-29 (Trichosanthes anti-HIV protein 29 kDa)Protéine anti-HIV de Trichosanthes129TrichobitacinTrichobitacine127,2TrichokirinTrichokirine127Trichokirin-S1Trichokirine-S1Small RIP11,4TrichomislinTrichomisline127,2Trichosanthin (TCS)Trichosanthine125-26TrichosanthripTrichosanthripSmall RIP11Trichosanthes lepiniate Maxim.TrichomaglinTrichomagline124,7Trichosanthes sp. Bac Kan 8–98TrichobakinTrichobakine127Triticum aestivum L.TritinTritine130Tritin LTritine L137-37,9Tritin STritine S132,1-32,8Vaccaria pyramidata Medik.PyramidatinePyramidatine128Viscum album L.Mistletoe lectin II (ML II)Lectine II du gui260Mistletoe lectin III (ML III)Lectine III du gui250Viscumin (mistletoe lectin I, ML I)Viscumine (lectine I du gui)2115Viscum album subsp. coloratum Kom.KML-IILKML-IIL260KML-IIUKML-IIU264VCAVCA260Viscum articulatum Burm.f.Articulatin-DArticulatine-D266Ximenia americana L.RiproximinRiproximine263Yucca recurvifolia Salisb.Yucca leaf protein (YLP)Protéine de la feuille de yucca123Zea mays L.Maize proRIPProRIP du maïs334Maize seed RIP (b-32, corn RIP)RIP de la graine du maïs132,4AnimalAedes aegyptiA. aegypti RIP I (RIPAeI)RIP I de A. aegypti1NDA. aegypti RIP II (RIPAeII)RIP II de A. aegypti1NDRIPAeI likeRIPAeI like1NDCulex quinquefasciatusC. quinquefasciatus RIP (RIPcu)RIP de C. quinquefasciatus1ND
Notes et références
Annexes Bibliographie
Articles connexes Biosynthèse des protéines Métabolisme cellulaire Lectine
Liens externes
Catégorie:Biologie cellulaire Catégorie:Protéine