O termo gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase cando non se especifica nada máis adoita referirse ao encima da glicólise gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase ou GAPDH (con número EC 1.2.1.12), que se encontra nas células somáticas. Usa como coencima o NAD+.
Outro encima similar ao anterior e co mesmo número EC (1.2.1.12) pero específico dos testículos e codificado noutro xene é a gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase espermatoxénica ou GAPDHS. Usa como coencima o NAD+.
Outros encimas distintos que se denominan gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase con outros números EC son: gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase (NADP+) (fosforilante) (EC 1.2.1.13) gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase (NAD(P)+) (EC 1.2.1.59) gliceraldehido-3-fosfato deshidrosenase (NADP+) (EC 1.2.1.9) gliceraldehido-3-fosfato deshidroxenase (ferredoxina) (EC 1.2.7.6)