Košarkaško prvenstvo Herceg-Bosne za sezonu 1998./99. je osvojio Brotnjo iz Čitluka. U doigravanje za prvaka Bosne i Hercegovine (u kojem su sudjelovali klubovi iz Herceg-Bosne i bošnjački klubovi iz Lige KS BiH, bez klubova iz Republike Srpske) su se plasirali Brotnjo, Široki i Posušje.
Ljestvica mj. klub ut. pob. por. koš+ koš- bod 1. Brotnjo Čitluk 22 21 1 doigravanje za prvaka BiH2. Široki Brijeg 22 20 2 3. Posušje 22 16 6 4. Troglav Livno 22 14 8 5. Tomislav Gratex (Tomislavgrad) 22 14 8 6. Čapljina 22 14 8 7. Zrinjski Soko Mostar 22 13 9 8. FIS Vitez 22 8 14 9. Ljubuški 22 6 16 10. Rama Prozor 22 4 18 11. Novi Travnik 22 1 21 12. Stolac 22 0 22 odustali od natjecanja
Poveznice Košarkaška liga Herceg-Bosne Košarkaško prvenstvo Bosne i Hercegovine Košarkaški savez Herceg-Bosne
Izvori eurobasket.com, Liga Herceg-Bosne 1998./99., pristupljeno 3. studenog 2016. eurobasket.com, Prvenstvo BiH 1998./99., pristupljeno 3. studenog 2016.
1998-99