A rendszerbiológusok számos olyan kifejezést alkottak, melyek biológiai adatokat, leginkább egy szervezet valamilyen fajta biomolekuláit leíró teljes adathalmaz megnevezését adják; ezek a „genom” és a „genomika” példáját folytatva leginkább „-om”, illetve „-omika” végződésűek. A kifejezések egy része hierarchikus rendszert alkot. Például a genom tartalmazza az ORFeomot, ami átalakul transzkriptommá, ez pedig proteommá íródik át. Más kifejezések átfedik egymást, és a fehérjék funkcióira és/vagy struktúrájára utalnak (pl. glikom, kinom).
Témák listája
-om Tudományág(-omika) Ezeket gyűjti össze Szülőfogalom JegyzetekAllergenom Allergenomika Allergének proteomikája Bibliom Bibliomika Tudományos bibliográfiai adatok Trialom Orvostudomány Klinikai kutatások adatai a klinikai kutatás-regiszterekből, kiegészítve az eredményekkel és hivatkozásokkal az adatokat felhasználó publikációkra Citom Citomika Szervezetek sejtszintű rendszerei Sejtbiológia Konnektom Konnektomika Az agy strukturális-funkcionális kapcsolódásai különböző térbeli és időbeli skálákon Idegtudomány Editom RNS-szerkesztési helyek Embriom Embriomika Embrionális sejtvonalak, a fejlődés során kifejeződő gének és jelen lévő antigének Embriológia Epigenom Epigenomika Epigenetikai módosulások Molekuláris genetika Az epigenomika a sejtek örökítőanyaga epigenetikai változtatásainak összességét, összefoglalóan az epigenomot tanulmányozzaExpozom (2005) Expozomika Egy személy környezeti hatásoknak való kitettsége, ideértve a születés előtti környezetet is Molekuláris genetika Javasolt kifejezés és tudományterület a környezeti tényezők patogén hatásainak vizsgálatára (a nature vs. nurture „nurture” komponense).Expozom (2009) A foglalkozási kitettségek és foglalkozási ártalmak összessége Munkahelyi biztonság és egészségvédelem A kifejezés ajánlói tudatában voltak az előbb említett expozom szónak, de ennek ellenére javasolták annak új területen való használatát.Exom Exomika A genomban található exonok Molekuláris genetika Farmakogenetika Farmakogenetika SNP-k, azok farmakokinetikai és farmakodinamikai hatásaival együtt FarmakogenomikaGenomika Farmakogenom Farmakogenomika A genom változásainak farmakológiai hatásai FarmakogenetikaGenomika Fenom Fenomika Fenotípusok Genetika Fiziom Fiziomika Egy szervezet fiziológiája Fitokemom Fitokemomika Fitokemikáliák A kifejezés első használata: del Castillo et al., 2013, Food Research International, http://dx.doi.org/10.1016/j.foodres.2013.05.014. A fitokemomika a fitokemikáliák bioaktivitását vizsgálja, ami egyre fontosabb a mezőgazdaság, élelmezés, orvostudomány és kozmetika területénFoodom Foodomika Élelmiszerrel és táplálkozással kapcsolatos dolgok, azok összefüggései bioaktivitással, minőséggel, biztonsággal és az élelmiszerek nyomon követhetőségével, a fejlett rendszerbiológiai technológiák felhasználásával, a fogyasztó jólétének, egészségének és bizalmának növelése érdekében. Táplálkozástudomány A fogalmat először 2009-ben használtákGenom Genomika(Klasszikus genetika) Gének (DNS-szekvenciák/Kromoszómák) Genetika A „genom” szó szerint egy élőlény összes génjét jelenti. Azonban a genom kifejezés megalkotásakor még nem tudták, hogy az örökítő anyag nagy részét géneket nem alkotó, nem kódoló DNS adja, ezért a genom eredetileg az élőlény teljes DNS-állományára utalt. A jelenlegi szakirodalomban szövegkörnyezettől függően mindkét definícióval találkozhatunk.Glikom Glikomika Glikánok Glikobiológia Interferom Interferomika Interferonok Immunológia Interferome névvel szintén létezik egy adatbázis is.Interaktom Interaktomika Az összes interakció Az interaktomika kifejezés valójában nem terjedt el. Ehelyett az interaktomokkal a rendszerbiológia foglalkozik.http://www.the-scientist.com/article/display/14769/Ionom Ionomika Szervetlen biomolekulák Molekuláris biológia Kinom Kinomika Kinázok Molekuláris biológia Foszforiláló funkciójú fehérjékLipidom Lipidomika Lipidek Biokémia Mechanom Mechanomika A szervezeten belüli mechanikai rendszerek Metabolom Metabolomika Metabolit A biológiai reakciók köztes és végtermékeiMetagenom Metagenomika A környezeti mintákban talált örökítőanyag Molekuláris biológia A mintában lévő genetikai anyag feltételezhetően több szervezetből származik, így több genom alkotja, ezért használják a meta- prefixumot.Metallom Metallomika Fémek és félfémek Obesidom Obesidomika Elhízáshoz köthető fehérjék Proteomika A kifejezés megalkotói Pardo et al., 2012.ORFeom ORFeomika nyitott leolvasási keretek (ORF-ek) Molekuláris genetika Organom Organomika Szervek közötti interakciók Sejtek jelzőrendszerei / szövettervezés és -előállítás A szervek közötti kommunikáció tanulmányozása fiziológiailag releváns, in vitro modellek segítségévelProteom Proteomika Fehérjék Molekuláris biológia Regulom Regulomika Átírási faktorok és más, a génkifejezõdés szabályozásában érintett molekulák Molekuláris biológia Researchsome Egy kutató vagy intézet kutatási területeinek összessége Kutatás Ivan Erill használta a 2011-es EBM meetingen(2011) "15th EBM PROGRAM" ''Evolutionary Biology Meeting at Marseilles'.' Hozzáférés ideje: December 14, 2011.Szekretom Szekretomika Szekretált (kiválasztódó) fehérjék Proteomika A proteomnak a sejtekből aktívan kivitelre kerülő fehérjékből álló részhalmaza.Speechom Speecheomika A nyelvelsajátításra ható tényezők A Human Speechome Project által használt kifejezésBBC article on the Speechome ProjectTranszkriptom Transzkriptomika mRNS-átiratok Molekuláris biológia Toponom Toponomika Sejti és szöveti struktúrák Molekuláris biológia
Témák hierarchiája Az érthetőség kedvéért egyes témák többször is szerepelnek a listában.
Bibliom Citom Expozom Genom Exom ORFeom Transzkriptom Proteom Kinom Szekretom Farmakogenom Fenom Regulom Interaktom Metagenom Molekulom Glikom Ionom Lipidom Metabolom Metallom Proteom Fiziom Konnektom Mechanom Membranom Researchsome Trialom Antibodyom
Jegyzetek
További információk Omics.org
Kategória:Rendszerbiológia Kategória:Bioinformatika
Kategória:Biológiai és orvostudományi listák