Az AlkB-homológ 3, α-ketoglutarát-dependens dioxigenáz fehérje, melyet emberben az ALKBH3, más néven ABH3 gén kódol. Történet Az ALKBH3-at 2004-ben írták le Misina , akik ABH3-nak nevezték el. 2006-ban Sundheim a fehérje katalitikus magdoménjének -ionnal és 2-oxoglutaráttal alkotott komplexe szerkezetét 1,5 Å pontossággal határozták meg, kimutatva többek közt egy, a nukleotidcserében és az ssDNS és dsDNS megkülönböztetésében szerepet játszó rugalmas hajtűt és a reaktív oxigénszármazékok termelését csökkentő leucint.
Funkció Az Escherichia coli AlkB fehérjéje a metiláló ágensek citotoxicitása ellen véd az egyszálú DNS-ben keletkező léziók javításával. Az ALKBH2 () és az ALKBH3 ennek homológjai, melyek az 1-metiladenozin és a 3-metilcitidin eltávolítását katalizálják. A 3-metiltimidin (m3T) és 1,N6-etenoadenozin (εA) javítására kismértékben képes.
A katalízis során az aktív helyén található leucin hidroxilezése csökkenti a reaktív oxigénszármazékok termelését.
Az ALKBH3 az egyszálú DNS-t és RNS-t preferálja, míg az ALKBH2 az AlkB-hez hasonlóan a kétszálú DNS-t javítja leghatékonyabban. F1 β-hajtűjében sok poláris aminosav található, ami gátolja a kétszálúnukleinsav-javítást. Ennek E123F mutációja növeli a dsDNS-javító képességet, az ssDNS-javító képességet nem csökkenti. Klinikai jelentőség Rák Az ALKBH3 tumorigenezis során mennyisége megnő, annak szaporodásához szükséges. A hiperaktív promotereket megjelöli: erősen kötődik hozzájuk, de a célgének transzkripcióját nem befolyásolja, azonban szintcsökkenése a hozzá nem kötött gyulladásokozó gének expresszióját növeli. Ezenkívül számos tumorspecifikus jellemzővel is rendelkezik. Prosztatarák A prosztatarák egy lehetséges biomarkere: összefüggés van magasabb szintje és a magasabb Gleason-osztályozás közt, ennek oka feltehetően az, hogy az enzim DNS-javító. Májrák Egy hosszú nem kódoló RNS, az ALKBH3-AS1 (AlkB-homológ 3, antiszenz RNS 1) növeli az ALKBH3 mRNS-ének stabilitását, ami elősegíti a májrák sejtproliferációját és invázióját. Ennek mennyiségét növeli többek közt a hipoxiaindukált faktor 1α (HIF1A).
Jegyzetek
Fordítás
További információk