Biografia Hellmayr nacque a Vienna e studiò presso l'Università di Vienna. Nel 1908 fu nominato Curatore della Sezione Uccelli del Museo di Monaco, dove divenne specialista in uccelli neotropicali, studiando la collezione di Spix sugli uccelli brasiliani.

Fu curatore nella sezione di zoologia del Museo di Chicago nel 1922. Tra i suoi libri figurano 13 dei 15 volumi del Catalogo Uccelli delle Americhe (1918-1949) e Gli Uccelli del Cile (con Henry Boardman Conover).

Opere Muscicapa parva im Wienerwald, Ornithologisches Jahrbuch, IX. 1898

Beiträge zur Ornithologie Nieder-Österreichs, Ornithologisches Jahrbuch, X, 1901

Einige Bemerkungen über die Graumeisen, Ornithologisches Jahrbuch, XI, 1900

Über eine neue Meise, P. nigriloris, Ornithologische Monatsberichte, 8, 1900

Bemerkungen über die neuweltliche Gattung Polioptila nebst Beschreibung einer neuen Subspecies aus Peru, Novitates Zoologicae 7, 1900

Eine neue Graumeisenform aus Italien, Unbekannt, 1901

Ueber einige Arten des Genus Thryophilus, Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft, 1901

Noch einige Worte über Thryophilus, Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft, 1902

Beschreibung von zwei neuen brasilianischen Vögeln, Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft, 1902

Die Formen yon Passer petronius, Ornithologisches Jahrbuch XIII. 1902

Untersuchungen über einiger paläarctische Vögel, Ornithologisches Jahrbuch, XIII, 1902

Einige weitere Bemerkungen über Polioptila, Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft, 1903

Paridae, Sittidae und Certhiidae, R. Friedländer und Sohn, vol. 18, 1903

Über neue und wenig bekannte Fringilliden Brasiliens, Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft, 1904

Revision der Spix'schen Typen brasilianischer Vögel, K.B. Akademie der Wissenschaften, 1905

Description of two new birds discovered by Mr. O. T. Baron in Northern Peru, Novitates Zoologicae 12, 1905: 503-504

Auguste Ménégaux, Carl Eduard Hellmayr: Étude des espèces critiques et des types du groupe des Passereaux, Impr. Dejussieu, 1906

On the Birds of the Island of Trinidad, Novitates Zoologiae XIII (1 ) 1906: 1- 60

Auguste Ménégaux, Carl Eduard Hellmayr: The Supposed Types in the Lafresnaye Collection, The Auk 23 ( 4) 1906: 480-483

Übersicht der südamerikanischen Arten der Gattung Chaetura, Verhandlung der Ornithologischen Gesellschaft in Bayern, 1907

Another contribution to the ornithology of the Lower Amazons, Novitates zoologicae 14, 1907

On a collection of birds from Teffé, Rio Solimões, Brazil, Novitates zoologicae 14, 1907

Critical Notes on the Types of little-known Species of Neotropical Birds ; Novitates zoologicae 14, 1907

Emile Oustalet, Ornithologische Monatsberichte, XIV, 1907

Ludwig Lorenz (Ritter von Liburnau.), Carl Eduard Hellmayr: Ein Beitrag zur Ornis Südarabiens, K.K. Hof- und Staatsdruckerei, 1907

An Account of the Birds collected by Mons. G. A. Baer in the State of Goyaz, Brazil, Novitates zoologicae 14, 1910

Carl Eduard Hellmayr, Philogène Auguste Galilée Wytsman: Genera Avium, V. Verteneuil & L. Desmet, 1910

Lorenz Müller, Carl Eduard Hellmayr: Zoologische Ergebnisse einer Reise in das Mündungsgebiet des Amazonas, Verlag der Königlich Bayerischen Akademie, vol. 2, 1912

Die Avifauna von Timor: Mit einer Farbentafel, Nägele, 1914

Hans Graf von Berlepsch - Eine Lebensskizze, J. of Ornithology 63 ( 4) 1915

Carl Eduard Hellmayr, A. Laubmann: Nomenclatur der vögel Bayerns, G. Fischer, 1916

Carl Eduard Hellmayr, Charles Barney Cory, Boardman Conover:Catalogue of Birds of the Americas and the Adjacent Islands, Field Museum of Natural History, 1918, 1925. 1938, 1942, 1948, 1949

A contribution to the ornithology of northeastern Brazil, Field Museum of Natural History, 1929

Birds of the James Simpson-Roosevelts Asiatic expedition, Field Museum of Natural History, 1929

The birds of Chile, Field Museum of Natural History, 1932

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Neotropical ornithology: Then and now - Francois Vuilleumier