Il nome Giovanni III viene usato per riferirsi a diversi personaggi storici:
Imperatori: Giovanni III Vatatze, imperatore bizantino Giovanni III di Trebisonda Giovanni III d'Etiopia
Re: Giovanni III Sobieski Giovanni III del Portogallo Giovanni III di Svezia Papi: Papa Giovanni III Principi: Giovanni III di Brabante Giovanni III di Bretagna Giovanni III del Monferrato Giovanni III di Kleve Giovanni III di Mosca, meglio conosciuto come Ivan III di Russia Patriarchi: Giovanni III di Costantinopoli Giovanni III di Gerusalemme Giovanni III della Chiesa d'Oriente Giovanni III della Chiesa ortodossa copta Giovanni III della Chiesa greco-ortodossa di Alessandria Giovanni III della Chiesa greco-ortodossa di Antiochia Giovanni III della Chiesa ortodossa siriaca Giovanni III, metropolita di Kiev Giovanni III, vescovo di Novgorod