Il seguente elenco, ordinato cronologicamente e suddiviso per secoli, riporta alcune delle bolle pontificie dei papi della Chiesa cattolica ritenute significative per la storia della chiesa universale.
XI secolo
In nomine Domini (Niccolò II, 12 aprile 1059) - Sull'elezione del Sommo Pontefice Libertas Ecclesiae (Gregorio VII, 1079) - Sull'autonomia della Chiesa Antiqua sanctorum patrum (Gregorio VII, 1079) - Concessione alla chiesa di Lione della supremazia su tutte le chiese di Francia
XII secolo Pie Postulatio Voluntatis (Pasquale II, 15 febbraio 1113) - Approvazione dell'Ordine dei Cavalieri Ospitalieri Sicut Judaeis (Callisto II, 1120 ca.) - Protezione agli Ebrei che hanno sofferto per mano dei partecipanti alla prima crociata Ex commisso nobis (Innocenzo II, 7 luglio 1136) - Unisce i beni delle chiese al patrimonio del Santuario della Madonna di Tirano Omne datum optimum (Innocenzo II, 29 marzo 1139) - Approvazione dell'Ordine dei Cavalieri templari Milites Templi (Celestino II, 1144) - Fornisce protezione ecclesiastica ai Cavalieri templari e sollecita le elargizioni a favore della loro causa Piae Postulatio Voluntatis (Eugenio III, 17 maggio 1145) - Tutela dei diritti spirituali, giurisdizionali e materiali del territorio veronese Militia Dei (Eugenio III, 17 maggio 1145) - Concede ai Cavalieri templari di raccogliere le decime e le tasse funerarie e di seppellire i loro morti nei cimiteri di loro proprietà Quantum praedecessores (Eugenio III, 1º dicembre 1145) - Indice la seconda crociata Justis fratrum (Eugenio III, 3 maggio 1152) Laudabiliter (Adriano IV, 1155) - Conferisce a Enrico II d'Inghilterra il possesso ereditario dell'Irlanda Ad abolendam (Lucio III, 1184) - Condanna l'eresia ed elenca alcune sanzioni da applicare Audita tremendi (Gregorio VIII, 29 ottobre 1187) - Indice la terza crociata Cum universi (Celestino III, 1192) - Religiosam vitam (Innocenzo III, 1198) - Riconoscimento degli Ospedalieri di Santo Spirito Post miserabile (Innocenzo III, 1198) - Comunica la necessità di indire un'altra crociata Vergentis (Papa Innocenzo III, 1199) - Equipare l'eresia al delitto di lesa maestà Sacrosanta Romana (Innocenzo III, 19 febbraio 1199) - Approvazione dell'Ordine Teutonico
XIII secolo
Etsi non displaceat (Innocenzo III, 1205) - Sollecita i regnanti a far terminare le malvagità compiute dagli Ebrei e fornisce l'elenco delle accuse Quia maior (Innocenzo III, 1213) - Indice la quinta crociata Vineam Domini Sabaoth (Innocenzo III, 1213) - bolla di convocazione del Concilio Lateranense IV Religiosam vitam (Onorio III, dicembre 1216) - Approvazione dell'Ordine Domenicano In generali concilio (Onorio III, 1218) - Obbligo per gli Ebrei di indossare abiti distintivi Etsi multam honestatem (Onorio III, 1217) - Agli studenti di Roma, Campania, Toscana, e Bologna Consideratis circumstantiis (Onorio III, 1219) - Autorizzazione ll'Arcidiacono di Bologna Cum sepe contingat (Onorio III, 28 giugno 1219) - Delega del riconoscimento delle lauree nell'Università di Bologna all'Arcidiacono Super speculam (Onorio III, 16 november 1219) - Solet annuere (Onorio III, 29 novembre 1223) - Approvazione della Regola di San Francesco Parens scientarum (Gregorio IX, 13 aprile 1231) - Autonomia dell'Università di Parigi Ille humani generis (Gregorio IX, 8 febbraio 1232) - Istituzione di un tribunale contro gli eretici Etsi Judaeorum (Gregorio IX, 1233) - Esorta a prevenire attacchi agli Ebrei Vox in Rama (Gregorio IX, giugno 1233) – condanna della stregoneria, intesa come eresia e denominata "Luciferianesimo". È errato credere che questa bolla abbia dato inizio ad una persecuzione su larga scala nei confronti dei gatti. Pietati proximum (Gregorio IX, 3 agosto 1234) - Poteri dell'Ordine Teutonico Ad capiendas vulpeculas (Gregorio IX, 1234) - Invita a stanare gli eretici della Borgogna dalle loro tane Devotionis Vestrae (Gregorio IX 17 gennaio 1235) Fondazione del Celeste Reale Militare Ordine di Santa Eulalia Vergine e Martire. Si vera sunt (Gregorio IX, 1239) - Ordina la confisca e l'ispezione di tutti i libri ebraici sospettati di bestemmie contro Cristo Impia Judaeorum perfidia (Innocenzo IV, 9 maggio 1244) - Esorta il re Luigi IX di Francia a proseguire nella confisca e nel rogo degli scritti rabbinici offensivi del Cristianesimo e lo invita a non permettere che donne cristiane servano ebrei come nutrici o domestiche. Cum non solum (Innocenzo IV, 1245) - Esorta l'imperatore mongolo a non attaccare la cristianità Ut pressi quondam (Innocenzo IV, 13 settembre 1246) - Concessione agli eretici conversi ad accedere agli ordini religiosi Lachrymabilem Judaeorum (Innocenzo IV, 1247) - Esorta a porre fine ad assassini e persecuzioni contro gli Ebrei provocati da accuse di omicidi rituali Ad extirpanda (Innocenzo IV, 15 maggio 1252) - Autorizza l'uso della tortura per far confessare gli eretici durante l'Inquisizione e autorizza l'uso della condanna al rogo Solet annuere (Papa Innocenzo IV), 9 agosto 1253 - Fondazione delle monache clarisse Querentes in agro (Innocenzo IV, 6 ottobre 1254) - Accoglie sotto la protezione della Sede Apostolica l'università di Oxford Transiturus de hoc mundo (Urbano IV, 11 agosto 1264) - Estende a tutta la Chiesa la celebrazione del Corpus Domini Turbato corde (Clemente IV, 1267) - Accuse contro gli Ebrei che convertono i cristiani alla loro fede Vineam Sorec (Nicolò III, 4 agosto 1278) – obbligo di insegnare il catechismo agli Ebrei Inter sanctorum solemnia (Celestino V, 29 settembre 1294) - Indulgenza plenaria per i pellegrini alla Basilica di Santa Maria di Collemaggio (c.d. Perdonanza Celestiniana) Clericis laicos (Bonifacio VIII, 25 febbraio 1296) - Divieto per l'autorità laica di far pagare tasse al clero senza autorizzazione della Santa Sede In excelso throno (Bonifacio VIII, 10 maggio 1297) - Scomunica dei cardinali Giacomo e Pietro Colonna Lapis abscissus (Bonifacio VIII, 23 maggio 1297) - Conferma delle precedenti scomuniche ora estesa a Jacopone da Todi, ai cinque nipoti del card. Giacomo Colonna ed i loro eredi dichiarati scismatici. De sepulturis (Bonifacio VIII, 1299) – Proibizione di bollire i cadaveri per separare la carne dalle ossa, al fine di trasportare facilmente le seconde in luoghi di sepoltura lontani. Antiquorum habet fida relatio (Bonifacio VIII, 22 febbraio 1300) - Indizione del primo Giubileo
XIV secolo
Ausculta fili (Bonifacio VIII, 1301) - Ribadiva le prerogative speciali della Chiesa; Unam Sanctam Ecclesiam (Bonifacio VIII, 18 novembre 1302) - Dichiara che non esiste salvezza al di fuori della Chiesa (Extra Ecclesiam nulla salus), e che la Chiesa deve rimanere unita; In suprema praeminentia dignitatis (Bonifacio VIII, 20 aprile 1303) - Sancisce la fondazione dello "Studium Urbis", nasce così l'Università di Roma La Sapienza; Pastoralis praeminentiae (Clemente V, 22 novembre 1307) - Ordina l'arresto dei Cavalieri templari e la confisca dei loro beni; Faciens misericordiam (Clemente V, 1308) - Dispone la procedura per perseguire i Cavalieri templari; Regnans in coelis (Clemente V, 1308) - Convocazione del Concilio di Vienne; In omnem (Clemente V, 27 marzo 1309) - Scomunica tutti i Veneziani come conseguenza dell'invasione veneziana di Ferrara; Vox in excelso (Clemente V, 22 marzo 1312) - Soppressione dell'ordine dei Cavalieri templari; Ad providam (Clemente V, 2 maggio 1312) - Concede la maggior parte delle proprietà dei Cavalieri templari ai Cavalieri Ospitalieri; Considerantes dudum (Clemente V, 6 maggio 1312) - Ridisegna la mappa degli ordini monastici ed avoca all'autorità papale il giudizio finale sui dignitari dell'Ordine dei Templari Nuper in concilio (Clemente V, 16 maggio 1312) - Licet dudum (Clemente V, 18 dicembre 1312) - Dudum in generali concilio (Clemente V, 31 dicembre 1312) - Licet pridem (Clemente V, 13 gennaio 1313) - Sane Considerante (Giovanni XXII, 1317) - Spondent Pariter (Giovanni XXII, 1317) - Condanna dell'alchimia Cum inter nonnullos (Giovanni XXII, 1323) - Sono considerate eretiche tutte le opinioni affermanti la totale povertà di Gesù e degli Apostoli Augit nos (Giovanni XXII, 1323) - disputa territoriale in Ferrara In agro dominico (Giovanni XXII, 1329) - dichiara eretiche alcune proposizioni di Meister Eckhart
XV secolo
Apostolicae Sedis (Innocenzo VII, 26 giugno 1405) - Approvazione della Regola del Terzo Ordine Domenicano emessa da Munio de Zamora nel 1285 Et si ex solicitudinis debitopastoralis (Eugenio IV, 23 novembre 1432) - Regolamenti sui monasteri benedettini Creator Omnium (Eugenio IV, 17 dicembre 1434) - condanna della schiavitù dei neri nelle Isole Canarie Sicut Dudum (Eugenio IV, 13 gennaio 1435) - condanna della schiavitù dei neri nelle Isole Canarie Laetantur Coeli (Eugenio IV, 6 luglio 1439) - Dum Diversas (Nicola V, 16 giugno 1452) - concede al re del Portogallo Alfonso la facoltà «di ridurre in perpetua schiavitù saraceni, pagani, infedeli e nemici di Cristo» Romanus Pontifex (Nicola V, 8 gennaio 1454) - Benedice la colonizzazione delle terre scoperte e incoraggia la schiavitù degli abitanti Ineffabilis providentia (Paolo II, 19 aprile 1470) Exigit sincerae devotionis (Sisto IV, 1º novembre 1478) - Istituzione di un inquisitore a Siviglia, sotto pressione politica di Ferdinando II di Aragona, che minacciava di ritirare l'appoggio militare del suo Regno di Sicilia Aeterni regis (Sisto IV, 21 giugno 1481) - Conferma i contenuti del Trattato di Alcáçovas Summis desiderantes (Innocenzo VIII, 5 dicembre 1484) - soppressione della stregoneria e dell'eresia, e nomina di inquisitori Inter Caetera (Alessandro VI, 4 maggio 1493) - Divide il Nuovo Mondo tra Spagna e Portogallo Eximiae devotionis (Alessandro VI, 3 maggio 1493) - Concessione ai regnanti spagnoli del dominio su tutte le nuove terre occidentali Piis Fidelium (Alessandro VI, 25 giugno 1493) - Concede al vicario di Spagna il potere di nominare i missionari per le Indie Dudum siquidem (Alessandro VI, 26 settembre 1493) - Ampliamento delle concessioni precedenti Ad Sacram Ordinis (Alessandro VI, 15 ottobre 1497) -
XVI secolo Equum Reputamus (Giulio II, dicembre 1503) Cum Tam Divino (Giulio II, 19 febbraio 1505) - invalidità delle elezioni pontificie macchiate di simonia Ad Sanctam Beati Petri Sedem Divina Dispositione Sublimati (Giulio II, 18 febbraio 1507) - istituzione dell'Università degli Studi di Urbino Apostolici Regiminis (Leone X, 19 dicembre 1513) - sull'immortalità dell'anima Regimini Universalis Ecclesiae (Leone X, 1514) - sulle esenzioni e sui diritti dei vescovi Supernae Dispositionis (Leone X, 1514) - sulla riforma della Curia romana Inter Sollicitudines (Leone X, 4 maggio 1515) - sulla censura preventiva dei libri Inter Multiplices (Leone X, 4 maggio 1515) - sulla liceità dei Monti di pietà Salvatoris Nostri Domini Jesu Christi (Leone X, 19 giugno 1515) - rifondazione dell'Ospedale di San Giacomo degli Incurabili Supremae Maiestatis (Leone X, 19 dicembre 1516) - sulla predicazione dei chierici Dum Intra Mentis (Leone X, 19 dicembre 1516) - sui religiosi e i loro privilegi Exsurge Domine (Leone X, 15 giugno 1520) - si esige la ritrattazione delle Tesi di Martin Lutero Decet Romanum Pontificem (Leone X, 3 giugno 1521) - Scomunica di Martin Lutero Veritas Ipsa (Paolo III, 2 giugno 1537) - proibisce la riduzione in schiavitù delle popolazioni indigene dell'America Regimini militantis Ecclesiae (Paolo III, 27 settembre 1540) - Approva la costituzione della Compagnia di Gesù Cupientes Judaeos (Paolo III, 21 marzo 1542) - sulla conversione degli Ebrei Illius qui (Paolo III, 19 febbraio 1543) - erezione di case a Roma per catecumeni (Ebrei convertiti) Injunctum nobis (Paolo III, 14 marzo 1543) - Copiosus in misericordia Dominus (Paolo III, 16 novembre 1548) - Istituisce a Messina il Messanense Studium Generale