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La prima stagione della serie televisiva Bones è stata trasmessa in prima visione negli Stati Uniti d'America da Fox dal 13 settembre 2005 al 17 maggio 2006.
In Italia è stata trasmessa in prima visione in chiaro da Rete 4, non nella sequenza originale, dal 4 dicembre 2006 al 10 febbraio 2007, ad eccezione dell'episodio Il bambino nel prato, che è stato trasmesso in prima visione satellitare Fox Life, canale a pagamento della piattaforma Sky, l'8 settembre 2008; questo è stato poi trasmesso per la prima volta in chiaro da Cielo il 23 giugno 2012.
nº Titolo originale Titolo italiano Prima TV USA Prima TV Italia 1 Pilot Testimone dal passato 13 settembre 2005 4 dicembre 2006 2 The Man in the S.U.V. L'attentato 20 settembre 2005 3 A Boy in the Tree Al di sopra di ogni sospetto 29 settembre 2005 5 dicembre 2006 4 The Man in the Bear La mano 1º novembre 2005 5 A Boy In a Bush Il bambino nel prato 8 novembre 2005 11 dicembre 2006 6 The Man in the Wall La mummia 15 novembre 2005 7 A Man on Death Row Condannato a morte 22 novembre 2005 18 dicembre 2006 8 The Girl in the Fridge Il gioco dell'ex 29 novembre 2005 9 The Man in the Fallout Shelter Il più bel regalo di Natale 13 dicembre 2005 23 dicembre 2006 10 The Woman at the Airport La donna dell'aeroporto 1º febbraio 2006 11 The Woman in the Car Rapimento e riscatto 1º febbraio 2006 30 dicembre 2006 12 The Superhero in the Alley Morte di un supereroe 8 febbraio 2006 13 The Woman in the Garden Doppio delitto 15 febbraio 2006 13 gennaio 2007 14 The Man on the Fairway Scomparsi 22 febbraio 2006 15 Two Bodies in the Lab Due corpi sotto esame 15 marzo 2006 20 gennaio 2007 16 The Woman in the Tunnel Sotto la città 22 marzo 2006 17 The Skull in the Desert Il teschio nel deserto 29 marzo 2006 27 gennaio 2007 18 The Man with the Bone La maledizione dei pirati 5 aprile 2006 19 The Man in the Morgue Dopo Katrina 19 aprile 2006 3 febbraio 2007 20 The Graft in the Girl Senza speranza 26 aprile 2006 21 The Soldier on the Grave Il reduce sulla tomba 10 maggio 2006 10 febbraio 2007 22 The Woman in Limbo Un volto per l'assassino 17 maggio 2006
Testimone dal passato Titolo originale: Pilot Diretto da: Greg Yaitanes Scritto da: Hart Hanson
Trama L'antropologa forense Temperance Brennan soprannominata "Bones" viene tallonata dall'agente dell'FBI Seeley Booth che le chiede di aiutarlo a risolvere l'omicidio su un caso in cui la vittima è irriconoscibile. Si scopre che la vittima era l'ex stagista di un senatore. Le pressioni politiche e il fatto che Bones sia affidata alla tutela dell'Agente Booth butta scompiglio sia a livello personale fra i due, sia a livello di accuse. A seguito di attente analisi, il sospetto cade sull'ex fidanzato della stagista, nonché attuale segretario del senatore. L'assassino che tenta di bruciare la sua cantina per cercare di eliminare le prove a suo carico. Bones lo ferma in tempo sparandogli un colpo di pistola alla gamba.
Altri interpreti: Chris Conner (Oliver Laurier), Larry Poindexter (Senator Bethlehem), Sam Trammell (Ken Thompson), Tyrees Allen (Ted Eller), Naja Hill (Cleo Louise Eller).
L'attentato Titolo originale: The Man in the S.U.V. Diretto da: Allan Kroeker Scritto da: Stephen Nathan Trama Bones e Booth vengono chiamati a indagare sull'esplosione dell'auto di un diplomatico mediorientale. I due devono scoprire se l'uomo era un terrorista o se è rimasto vittima di un omicidio. Le indagini degli investigatori partono dai familiari della vittima: il fratello e la ex moglie. I tecnici di laboratorio scoprono che entrambi i fratelli soffrivano di eruzioni cutanee al volto e iniziano a fare delle ipotesi sul tipo di sostanza con la quale i due sono entrati in contatto. Scoperto un laboratorio per la costruzione di rudimentali bombe alla diossina nell'appartamento del fratello della vittima, quest'ultimo diventa il principale sospettato e viene fermato all'interno di un centro commerciale con un colpo di pistola sparato da Booth, giusto un attimo prima che faccia detonare un altro ordigno.
Al di sopra di ogni sospetto Titolo originale: A Boy in a Tree Diretto da: Patrick R. Norris Scritto da: Hart Hanson Trama Bones e Booth devono districarsi in una fitta di rete di frodi e ricatti a sfondo sessuale in una scuola privata, dopo avere ritrovato il corpo di un ragazzo impiccato a un albero nel giardino della medesima. Bones e Booth si ritrovano a subire le pressioni del preside che intende salvare la reputazione della scuola, fiore all'occhiello in fatto di sicurezza, a cui sono iscritti i figli di importanti figure della politica americana. Il preside quindi tende a escludere l'omicidio per favorire la tesi del suicidio, tesi che, se confermata dalle indagini, escluderebbe ogni responsabilità della scuola. Il fiuto di Booth porterà però la scoperta di un filmato a sfondo sessuale autoprodotto che smaschererà due degli ex compagni della vittima come esecutori del delitto, che avevano il fine di chiedere soldi per la non diffusione del video.
La mano Titolo originale: The Man in the Bear Diretto da: Allan Kroeker Scritto da: Laura Wolner Trama Viene ritrovata una mano all'interno di un orso morto; Bones e Booth vengono chiamati a indagare in una cittadina fuori Washington. Dopo avere eseguito i rilevi del caso e avere avuto un riscontro con i reperti inviati al Jeffersonian, Bones e Booth iniziano a sospettare del guardiaparco della zona, scoprendo però che si tratta solo di un bracconiere che finge di amare la natura. Proseguendo con le indagini, i sospetti cadono sul dottore della città, colpevole di aver cercato di eseguire un rito di iniziazione usando pezzi di corpi umani.
Il bambino nel prato Titolo originale: A Boy in a Bush Diretto da: Jesús Salvador Treviño Scritto da: Greg Ball e Steve Blackman Trama Viene ritrovato il corpo di un bambino stuprato; Booth si rivolge agli aiutanti di Bones per cercare di fare luce sulla vicenda. Si scopre che i fratelli della vittima nonché la vittima stessa sono dei bambini adottati; la scoperta però non porta a nessun progresso, inizia così una ricerca a ritroso sugli ultimi istanti del bambino in compagnia dei fratelli. Grazie al temperamento di Bones, che si ritrova ad avere un dialogo quasi materno con il fratello minore della vittima, si viene a conoscenza del nome dell'autore dell'omicidio. Il pedofilo viene arrestato e i due figli adottivi possono continuare a vivere con la madre.
La mummia Titolo originale: The Man in the Wall Diretto da: Tawnia McKiernan Scritto da: Elizabeth Benjamin Trama Bones e Angela si ritrovano quasi coinvolte in una rissa in discoteca. Durante la colluttazione, una porzione di parete crolla e viene trovato il corpo mummificato di un uomo e della droga. La vittima era un deejay piuttosto famoso e le indagini si spostano quindi nel mondo del rap e dell'hip hop; successivamente viene coinvolto il proprietario del locale e talent scout di artisti emergenti. Il padre della vittima si reca da Booth per convincerlo che suo figlio non ha mai fatto uso di droghe. Il detective pensa quindi che sia da escludere la pista del regolamento di conti. Con la scoperta di un altro cadavere che presenta un medesimo strano segno, quasi come se fossero stati colpiti dalla stessa arma, Bones e Booth arrestano il proprietario del locale e gli confiscano il bastone da passeggio: all'estremità porta la testa di un animale in acciaio, conformazione che combacia con i segni trovati sui cadaveri.
Condannato a morte Titolo originale: The Man on Death Row Diretto da: David Hugh Jones Scritto da: Noah Hawley Trama Un'avvocatessa di un'organizzazione pro bono tenta di salvare un uomo dalla condanna a morte per aver ucciso una ragazza. La donna cerca di coinvolgere Booth il quale, tempo prima, aveva arrestato il colpevole e trovato alcune prove. Il detective si ritrova a dover riaprire un caso che lui stesso aveva chiuso e a fronteggiare sia il suo superiore, sia i genitori della vittima che si sentono traditi dalla giustizia. Bones fa riesumare il corpo della ragazza mentre Zack, risolvendo l'enigma di alcuni numeri ritrovati su un foglietto legato all'omicidio, riesce a trovare una palude con altri cadaveri. Bones e Booth sono quindi obbligati a fare fermare l'esecuzione alla luce delle nuove prove. Per ironia della sorte, i due scoprono che anche le altre vittime sono state uccise proprio dal condannato a morte, il quale ora dovrà restare in attesa di un nuovo processo dai tempi decisamente lunghi. Il colpevole ha raggiunto il suo scopo: rimandare l'esecuzione. Bones e Booth sono affranti e l'avvocatessa se ne va piangendo.
Il gioco dell'ex Titolo originale: The Girl in the Fridge Diretto da: Sanford Bookstaver Scritto da: Dana Coen Trama Booth porta nei laboratori del Jeffersonian un frigo contenente il corpo decomposto di una donna; è ora compito di Bones risolvere gli enigmi del caso. Viene però coinvolta sentimentalmente da un suo ex professore universitario, Michael. Le indagini portano alla scoperta di una coppia che aveva dato alloggio alla defunta e che probabilmente è coinvolta nel suo omicidio. La coppia viene arrestata e parallelamente il coinvolgimento professionale e privato tra Bones e il suo ex professore continua, fino alla scoperta di Booth: il professore è il medico legale della difesa, e ora, dopo aver assimilato tutti i dati dell'accusa tramite la relazione con Bones, si ritrovano faccia a faccia in tribunale. Dapprima in evidente crisi, a causa della freddezza e nell'uso di un lessico da laboratorio che non convince la giuria da parte di Bones, l'accusa, su consiglio di Booth, sfigura Bones ai loro occhi, portandoli a conoscenza del suo passato di figlia orfana di genitori assassinati ancora senza giustizia; questo fatto scatena in lei un susseguirsi di risposte che la porterà a convincere la giuria e a fare condannare la coppia.
Il più bel regalo di Natale Titolo originale: The Man in the Fallout Shelter Diretto da: Greg Yaitanes Scritto da: Hart Hanson Trama Booth porta a Bones lo scheletro di una persona defunta negli anni cinquanta, ritrovata all'interno di un rifugio antiatomico. Sebbene sia l'antivigilia di Natale, la squadra si mette ad analizzare i vari reperti del caso. Mentre Zack ed Hodgins stanno tagliando con una sega elettrica le ossa al fine di analizzarle, una polvere ricca di spore di un particolare fungo si alza nell'aria, provocando la chiusura ermetica delle porte di sicurezza e decretando lo stato di quarantena. Il gruppo si trova quindi a passare il Natale chiuso in laboratorio, lontano dalla famiglia. È qui che Bones, con l'aiuto dei suoi collaboratori e spinta dallo spirito natalizio di Angela, riesce a rintracciare la ex fidanzata del defunto la quale si presenterà in laboratorio la mattina di Natale. La vicenda viene chiarita, la donna ottiene le sue risposte e Bones, rimasta sola dopo l'azzeramento dello stato di quarantena, sconfigge i propri fantasmi del passato aprendo il regalo che le fecero i genitori poco prima della loro scomparsa.
La donna dell'aeroporto Titolo originale: The Woman at the Airport Diretto da: Greg Yaitanes Scritto da: Teresa Lin Trama