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nºTitolo originaleTitolo italianoPrima TV USA Prima TV Italia 1 The Siege (part 3) L'assedio (3) 15 luglio 2005 27 maggio 2006 2 The Intruder L'intruso 22 luglio 2005 3 giugno 2006 3 Runner Runner 29 luglio 2005 10 giugno 2006 4 Duet Un corpo per due 5 agosto 2005 17 giugno 2006 5 Condemned Accordo di sangue 12 agosto 2005 24 giugno 2006 6 Trinity Peccato di presunzione 19 agosto 2005 1º luglio 2006 7 Instinct Istinto 26 agosto 2005 8 luglio 2006 8 Conversion Trasformazione 9 settembre 2005 15 luglio 2006 9 Aurora Aurora 23 settembre 2005 22 luglio 2006 10 The Lost Boys (1) I ragazzi perduti (1) 23 settembre 2005 29 luglio 2006 11 The Hive (2) L'attacco (2) 6 gennaio 2006 9 settembre 2006 12 Epiphany Epifania 13 gennaio 2006 16 settembre 2006 13 Critical Mass La debolezza del male 20 gennaio 2006 23 settembre 2006 14 Grace Under Pressure In fondo all'oceano 27 gennaio 2006 30 settembre 2006 15 The Tower La torre 3 febbraio 2006 7 ottobre 2006 16 The Long Goodbye Il lungo addio 10 febbraio 2006 21 ottobre 2006 17 Coup D'Etat Colpo di stato 17 febbraio 2006 28 ottobre 2006 18 Michael Ospite ad Atlantide 24 febbraio 2006 14 ottobre 2006 19 Inferno Inferno 3 marzo 2006 4 novembre 2006 20 Allies (1) Un'alleanza pericolosa (1) 10 marzo 2006 11 novembre 2006

L'assedio (3) Titolo originale: The Siege - part 3 Diretto da: Martin Wood Scritto da: Martin Gero

Trama L'episodio ricomincia col Mag. Sheppard sul Jumper intento a portare la testata Genii in una delle 2 astronavi alveare rimaste. La nave esplode ma Sheppard riesce a salvarsi grazie all'arrivo della tanto attesa Daedalus che lo teletrasporta a bordo (essendo dotata di tecnologia Asgard possiede un ottimo sistema di teletrasporto) e invia nel contempo su Atlantide il modulo ZPM per poi ingaggiare la nave Wraith. I missili si rivelano inefficaci così Sheppard propone di teletrasportare la testata direttamente nella nave nemica rimasta che viene distrutta. I Wraith però puntano i Dardi sulla città ad altissima velocità per schiantarcisi su. Fortunatamente lo scudo viene riattivato in tempo da evitare il disastro e le rimanenti navi aliene battono in ritirata. La tregua non dura, infatti poco dopo vengono individuate ben 12 navi alveare con relativa scorta in avvicinamento. Nel frattempo il tenente Ford, dopo essere stato infettato da un Wraith, viene ritrovato in condizioni disperate al largo della città, attaccato a esso. Il dottor Beckett pensa di poterlo salvare, ma il rimedio potrebbe essere peggiore del male. La Daedalus tende un'imboscata alle navi nemiche distruggendone 2 prima di essere costretta a ritornare a Atlantide, danneggiata e non più in grado di teletrasportare le testate. Viene così proposto di occultare la città con un generatore stealth connesso allo scudo mascherando i sensori nemici con un'esplosione nucleare (non è pensabile resistere a lungo al fuoco delle navi, lo ZPM si esaurirebbe in pochi giorni) in modo da indurre i Wraith ad andarsene. Sheppard va in cerca del Ten. Ford che è diventato dipendente dall'enzima iniettato dai Wraith prima di uccidere le vittime e aggredisce alcuni uomini. Sheppard lo stordisce con il fucile Wraith ma Ford non cade, ruba un jumper e varca lo Stargate proprio mentre la città è occultata, per fortuna senza farsi rilevare dai Wraith che lasciano l'orbita convinti dell'autodistruzione di Atlantide.

L'intruso Titolo originale: The Intruder Diretto da: Peter DeLuise Scritto da: Paul Mullie e Joseph Mallozzi

Trama A bordo dell'astronave Daedalus uno scienziato muore in circostanze apparentemente casuali per una scarica elettrica dovuta ad un sovraccarico. McKay e Sheppard non sono convinti delle cause del decesso e cominciano ad investigare. Una serie di avarie e la morte di un secondo scienziato conferma che a bordo della nave c'è un sabotatore. Ma la realtà è molto peggiore dei loro timori. Nello scontro subito dall'astronave tempo prima con una nave alveare, quest'ultima aveva impiantato nella Deadalus un programma senziente il cui unico scopo è prendere possesso della nave e portarla dai Wraith più vicini. E uccidere chiunque tenti di fermarlo.

Runner Titolo originale: Runner Diretto da: Martin Wood Scritto da: Robert C. Cooper

Trama Sulle tracce del tenente Ford la squadra d'esplorazione capitanata da Sheppard e di cui fa parte un riluttante McKay viene attaccata da un misterioso individuo e si separa. Sheppard e Teyla vengono catturati da Ronon Dex, nativo del pianeta Sateda i cui abitanti vengono usati dai Wraith come selvaggina per una mortale caccia alla volpe, mentre proprio McKay finirà con l'incontrare il tenente Ford.

Un corpo per due Titolo originale: Duet Diretto da: Martin Wood Scritto da: Martin Gero

Trama Durante una spedizione il dott. McKay ed il tenente Laura Cadman vengono catturati da un Dardo dei Wraith. L'apparecchio viene abbattuto e trasportato su Atlantide per cercare di salvare i due, prigionieri in una sorta di teletrasporto, ma l'energia residua del caccia sembra sufficiente a rimaterializzare solo uno dei due. Dovendo scegliere alla cieca su un pannello Wraith che mostra solo due luci lampeggianti a simboleggiare gli umani catturati, ne scelgono uno e fanno riapparire Mckay. Ma il dottore non è solo. Visti i danni subiti dal Dart, è stato rimaterializzato il corpo di Mckay, ma all'interno della sua mente si trova anche la coscienza del tenente Cadman.

Accordo di sangue Titolo originale: Condemned Diretto da: Peter Deluise Scritto da: Sean Carley

Trama La squadra di ricognizione, in cerca di nuovi alleati, visita un pianeta tecnologicamente molto progredito curiosamente indenne dagli attacchi dei Wraith, in cui i condannati per qualunque reato vengono esiliati proprio sull'isola dove si trova lo stargate. Insospettiti dall'atteggiamento poco chiaro del governo planetario Sheppard e compagni decidono di rientrare alla base ma il Puddle Jumper su cui viaggiano viene abbattuto dai condannati dell'isola.

Peccato di presunzione Titolo originale: Trinity Diretto da: Martin Wood Scritto da: Damian Kindler

Trama La squadra di ricognizione trova un pianeta attorno al quale ruotano numerosi relitti di Navi-alveare Wraith. Scendendo sul pianeta, che sembra essere stato completamente devastato, viene rinvenuto intatto un unico edificio, chiaramente realizzato dagli Antichi, che ospita un'arma molto potente alimentata da una nuova forma di energia che sfutta il medesimo meccanismo degli ZPM (considerati "pile alcaline" in confronto a essa) ma a livello dell'intero universo. Si scopre che il progetto era stato chiamato Arcturus e non fu mai completato. Nonostante le perplessità della dottoressa Weir, McKay è certo di poter riattivare l'arma. La sua presunzione gli costerà cara, scoprendo anche perché il progetto rimase incompleto e il pianeta desolato.

Istinto Titolo originale: Instinct Diretto da: Andy Mikita Scritto da: Treena Hancock e Melissa R. Byer

Trama In visita su un piccolo pianeta la squadra di ricognizione capitanata dal colonnello Sheppard viene a sapere che gli abitanti del luogo sono perseguitati da un mostro che uccide periodicamente coloro che si avventurano fuori dai villaggi. La vista di uno dei cadaveri del mostro non lascia dubbi: è l'opera di un Wraith. Ma la caccia al mostro porterà la spedizione a fare una scoperta sconvolgente.

Trasformazione Titolo originale: Conversion Diretto da: Brad Turner Scritto da: Martin Gero e Robert C. Cooper

Trama A seguito delle ferite riportate nel combattimento con la Wraith mutante dell'episodio precedente, il colonnello Sheppard si infetta col retrovirus assunto dalla Wraith cominciando a risentire egli stesso degli effetti della mutazione e rischiando di diventare un mostro. Nel tentativo di salvarlo da una fine orribile la dottoressa Weir autorizza una pericolosa missione.

Aurora Titolo originale: Aurora Diretto da: Martin Wood Scritto da: Brad Wright e Carl Binder

Trama Sui sensori a lungo raggio della città di Atlantide appare un segnale degli Antichi. È la nave Aurora, di ritorno dalla sua missione ai confini della Galassia di Pegaso per scoprire il punto debole dei Wraith. La squadra di ricognizione del colonnello Sheppard decide di andare incontro alla nave e trova l'intero equipaggio in stasi con le menti collegate all'elaboratore della nave. Sheppard decide di collegarsi a sua volta all'elaboratore e scopre che gli occupanti della nave sono convinti di essere ancora nel mondo reale.

I ragazzi perduti (1ª parte) Titolo originale: The Lost Boys Diretto da: Brad Turner Scritto da: Martin Gero

Trama Con la speranza di rintracciare il tenente Ford la squadra di ricognizione condotta dal colonnello Sheppard cade in un'imboscata tesa dallo stesso Ford, a capo di un gruppo di persone che è riuscito a convincere ad unirsi a lui e ad utilizzare l'enzima estratto dai Wraith come potenziatore di forze. Per convincerli a collaborare con lui, Ford infetta tutta la squadra con l'enzima ad eccezione di Sheppard. A lui Ford illustra il suo piano: infiltrarsi in una Nave-alveare Wraith.

L'attacco (2ª parte) Titolo originale: The Hive Diretto da: Martin Wood Scritto da: Carl Binder

Trama Dopo il fallito attacco alla Nave-alveare Sheppard, Teyla, Ronon e gli uomini di Ford vengono tenuti prigionieri dai Wraith per essere interrogati. Il gruppo riesce ad evadere dalla prigione, ma durante la fuga la squadra di Sheppard trova altri umani imprigionati e tenta di liberarli. Così facendo fa scattare l'allarme ed il gruppo viene catturato nuovamente. Nel frattempo durante la prigionia gli effetti dell'astinenza da enzima cominciano a fasi sentire sugli elementi del gruppo.

Epifania Titolo originale: Epiphany Diretto da: Neil Fearnley Scritto da: Brad Wright e Joe Flanigan

Trama Durante l'esplorazione di un pianeta la squadra del colonnello Sheppard trova un cratere dal quale viene emessa energia. Per soddisfare la curiosità di McKay la squadra fa atterrare il Puddle Jumper vicino a quella che sembra un'entrata protetta da un campo di forza apparentemente innocuo al passaggio di oggetti inanimati. Ma non appena Sheppard si avvicina al campo viene inesorabilmente risucchiato dall'altra parte, dove il tempo scorre duecentocinquanta volte più velocemente che all'esterno del cratere.

Curiosità: McKay chiama Ronon "Conan", ma l'attore Jason Momoa ha impersonato il protagonista del film Conan the Barbarian solamente anni dopo, nel 2011 La debolezza del male Titolo originale: Critical Mass Diretto da: Andy Mikita Scritto da: Brad Wright e Carl Binder

Trama