Mallikarjuna Raya succedette al padre Deva Raya II, che aveva portato la prosperità in tutto l'Impero Vijayanagara consegnandolo ad un'epoca d'oro. Tuttavia, Mallikarjuna Raya, a differenza di suo padre, fu generalmente debole e il suo governo corrotto.
All'inizio del suo regno difese l'impero dagli attacchi dei sultani di Bahamani e del Raja indù del regno di Orissa, ma successivamente subì una serie di sconfitte: i Gajapati conquistarono Rajamahendri nel 1454 e Udayagiri e Chandragiri nel 1463 e i regni Bahamani si impadronirono della maggior parte dell'Impero Vijayanagara nel 1450 avvicinandosi alla capitale, mentre allo stesso tempo i portoghesi arrivavano nell'India meridionale, conquistando molti dei porti sulla costa occidentale dell'Impero.
Questi eventi portarono al declino della dinastia Sangama; Virupaksha Raya II cugino di Mallikarjuna Raya, colse l'occasione per impadronirsi del trono, anche se non riuscì ad imporre un governo migliore.
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