Ha origini italiane, essendo i suoi bisnonni abruzzesi.. Fu scelto nel corso del primo giro (18º assoluto) del Draft NFL 2008 dai Baltimore Ravens.
Nel suo anno da esordiente lanciò 2.971 yard, 14 touchdown e 12 intercetti giocando come titolare tutte le 16 gare di stagione regolare e diventando solamente l'ottavo quarterback rookie nella storia della NFL a partire come titolare in una gara di playoff. Guidando i Ravens a due vittorie in trasferta nei playoff 2008-09, divenne il primo rookie tra i quarterback nella storia della lega a vincere due gare di playoff. Nella sua seconda stagione, Flacco migliorò passando 3.613 yard, 21 touchdown e 12 intercetti, stabilendo i record di franchigia per percentuale di completamento dei passaggi (63,1) e passer rating (88,9). Nel suo terzo anno nella NFL, Flacco divenne il leader di tutti i tempi della storia dei Ravens per yard passate (10.206) e passaggi da touchdown (60). Giocando come titolare due gare di playoff nel 2009, Flacco conquistò il primato per il maggior numero di presenze da titolare per un quarterback nelle sue due prime stagioni nella NFL (37). Flacco divenne solamente il quarto quarterback a portare la sua squadra ai playoff nelle sue prime quattro stagioni e il primo a vincere una partita in gnuna di esse. Nella stagione guidò i Ravens alla vittoria del Super Bowl XLVII venendo premiato come MVP della partita. Nel 2013 firmò l'allora contratto d'ingaggio pluriennale più alto nella storia della NFL: 120,6 milioni di dollari per 6 anni, ossia 20,1 milioni a stagione.
Carriera professionistica Baltimore Ravens Stagione 2008
Al Draft NFL 2008, Flacco fu selezionato come 18ª scelta assoluta dai Baltimore Ravens. Il 16 luglio 2008 firmò un contratto di 5 anni per 30 milioni di dollari di cui 8,75 garantiti. Debuttò nella NFL il 7 settembre 2008 contro i Cincinnati Bengals indossando la maglia numero 5.
Il 4 gennaio 2009, vincendo la gara di Wild Card contro i Miami Dolphins divenne il terzo quarterback rookie della storia a vincere la partita d'esordio nei playoff NFL.
La settimana successiva i Baltimore Ravens eliminarono i Tennessee Titans accedendo al secondo turno dei playoff. Joe Flacco diventò il primo quarterback rookie della storia a vincere due partite di playoff. Nella finale della AFC, i Ravens vennero eliminati dai Pittsburgh Steelers.
Stagione 2009 Nella gara di apertura a Baltimore contro i Kansas City Chiefs, Flacco guidò i Ravens alla prima vittoria della stagione. Egli lanciò per 307 yard e 3 touchdown, entrambi record in carriera. Joe subì anche un intercetto per un passer rating di 95,8. Durante quella partita, i Ravens superarono il record di franchigia per yard totali offensive guadagnate con 501.
Nella settimana 3 contro i Cleveland Browns, Flacco lanciò un nuovo record in carriera di 342 yard con un rating di 111,8 con un passaggio da touchdown.
Joe superò nuovamente il suo record in carriera nella settimana 6 contro i Minnesota Vikings, con 385 yard passate, anche se Baltimore perse la gara per due punti.
Nella settimana 15 contro i Chicago Bears, Flacco lanciò il suo record di touchdown con 4, con 234 yard passate e completando il 72% dei suoi passaggi, per un rating di 135,6. I Ravens vinsero 31-7.
Con 3.613 yard e 21 touchdown, Flacco divenne il primo quarterback dei Ravens dai tempi di Vinny Testaverde a lanciare più di 3.000 yard e 20 TD in una singola stagione.
Un infortunio limitò Flacco nella partita di wild card contro i Patriots. I Ravens vinsero comunque 33-14 malgrado Flacco abbia lanciato 4 completi su 10 per sole 34 yard ed un intercetto. La settimana seguente contro i Colts, Flacco giocò nuovamente male e i Ravens persero 20-3.
Stagione 2010 Nella prima partita della stagione, Flacco e i Ravens debuttarono contro i New York Jets in trasferta. Flacco lanciò per 248 yard completando il 52,6% dei suoi passaggi e tirando un intercetto nella vittoria 10-9. La settimana seguente giocò la peggior partita della carriera lanciando ben 4 intercetti contro i Bengals ma rifacendosi la settimana seguente passando tre TD contro i Browns per un passer rating di 128,7. Alla fine della stagione regolare, Flacco stabilì i propri record in carriera di yard passate (3.622), passaggi da touchdown (25), passer rating (93,6) ed il minimo stagionale di intercetti (10).
Nel primo turno di playoff, i Ravens vinsero contro i Kansas City Chiefs (30-7) e Flacco completò 25 passaggi su 34 passes per 265 yard e 2 touchdown senza intercetti, con un passer rating di 115,4. With the win, Flacco divenne il primo quarterback della storia della NFL a partire da titolare e vincere una partita di playoff in ognuno dei suoi primi anni di carriera e raggiunse Len Dawson, Roger Staubach, Jake Delhomme, e Mark Sanchez per il maggior numero di vittorie in trasferta nei playoff per un quarterback.
La corsa nei playoff dei Ravens si concluse contro gli Steelers, con Flacco che completò 16 passaggi su 30 per 125 yard, 1 touchdown ed un intercetto.
Stagione 2011
Poco dopo la fine della stagione 2010, i Ravens licenziarono l'allenatore dei quarterback Jim Zorn, per il dispiacere di Flacco. Questa fu solo la prima di una serie di drastici cambiamenti avvenuti nella offseason del 2011. Il 28 luglio 2011, il ricevitore principale di Flacco nelle ultime tre stagioni, Derrick Mason, fu tagliato per recuperare spazio nel salary cap. Inoltre i ricevitori numero 3 e 4, T.J. Houshmandzadeh e Donté Stallworth non furono rifirmati e lo storico tight end dei Ravens Todd Heap fu tagliato e firmato dagli Arizona Cardinals. Flacco rimase solo con Anquan Boldin e i rookie Torrey Smith and Tandon Doss come wide receiver finché i Ravens non acquisirono Lee Evans, un atleta veloce per il braccio di Flacco. I tight end al secondo anno Ed Dickson e Dennis Pitta sostituirono l'ex Pro-Bowler Heap.
Nella vittoria contro i St. Louis Rams, Flacco fece una grande prestazione, chiudendo con 27 lanci completati su 48 per 389 yard con 3 touchdowns, subì 2 sack perdendo 4 yard, con un rating di 103,6. Grazie a questa prova vinse il titolo di miglior quarterback della NFL della settimana.
I Ravens vinsero la propria division ed avanzarono nei playoff sino alla finale della AFC, persa dopo aver sbagliato il field goal del potenziale pareggio nei secondi finali coi New England Patriots.
A fine stagione, Flacco fu votato al 74º posto nella NFL Top 100, l'annuale classifica dei migliori cento giocatori della stagione.
Stagione 2012: vittoria del Super Bowl Il 10 settembre, Flacco iniziò la stagione alla grande guidando i Ravens a una netta vittoria contro i Cincinnati Bengals per 44-13. Joe completò 21 passaggi su 29 tentativi per 299 yard e 2 passaggi da touchdown. Nel turno successivo, i Ravens furono sconfitti dai Philadelphia Eagles: dopo un buon inizio Joe faticò nel corso della partita terminando con 232 yard passate, un touchdown e il primo intercetto subito in stagione. Nella settimana 3 i Ravens vinsero con un field goal negli ultimi istanti della gara contro i Patriots: Flacco passò per 382 yard con 3 touchdown e un intercetto.
Nel Thursday Night Football della settimana 4 i Ravens vinsero contro i loro rivali di division, i Cleveland Browns: Flacco passò 356 yard con delle grandi giocate, passando un touchdown con un intercetto e segnando un altro touchdown su corsa. Per questa prestazione, Joe vinse per la seconda volta in carriera il premio di miglior quarterback della settimana.
Nella settimana 5 i Ravens si portarono su un record di 4-1 con la vittoria sui Chiefs: il quarterback passò 187 yard senza touchdown e subendo un intercetto. I Ravens vinsero la quarta gara consecutiva nella settimana 6 contro i Dallas Cowboys con Flacco che passò 234 yard e un touchdown.
Nella settimana 7, Baltimore perse nettamente contro gli Houston Texans per 43-13: Flacco faticò per tutta la partita completando 21 passaggi su 43 tentativi per 147 yard, un touchdown e 2 intercetti, subendo anche una safety. Dopo la settimana di pausa i Ravens vinsero coi Browns con Flacco che passò 253 yard e un touchdown.
Nella settimana 10 i Ravens stabilirono il record di franchigia infliggendo 55 punti agli Oakland Raiders: Flacco giocò alla grande passando 341 yard con tre touchdown passati (1 intercetto) e un altro segnato su corsa, rimanendo in panchina nell'ultimo quarto a gara ampiamente decisa. Per questa prestazione, il giocatore vinse per la seconda volta in stagione il premio di miglior quarterback della settimana.
Nella settimana 11 Flacco confermò le sue difficoltà lontano dall'M&T Bank Stadium ma i Ravens ottennero comunque un'importante vittoria sugli Steelers privi di Ben Roethlisberger. Il quarterback passò 164 yard senza touchdown e intercetti.
Nel turno successivo, Joe disputò quella che fu forse la sua miglior gara in trasferta della stagione, guidando i Ravens alla rimonta da 13-3 fino a 16-13 nei tempi supplementari. Il momento chiave della gara fu quello in cui Flacco trovò con un passaggio Ray Rice in una situazione di quarto down e 29. La sua prestazione terminò con 355 yard passate e un touchdown.
Nella settimana 13 i Ravens sprecarono un vantaggio di 10 punti alla fine del primo tempo perdendo contro gli Steelers e interrompendo una striscia di 15 vittorie consecutive in casa. Flacco passò 188 yard con un touchdown e un intercetto.
Malgrado una gara di grande precisione di Flacco nel turno successivo (16 su 21 passaggi per 182 yard, 3 touchdown e 1 intercetto) i Ravens persero nuovamente ai supplementari contro i Redskins, complice anche un vistoso calo nella produzione offensiva del quarterback tra il primo e il secondo tempo. Malgrado il cambio di coordinatore offensivo (da Cam Cameron a Jim Caldwell, il periodo negativo della squadra proseguì la domenica successiva perdendo contro i Denver Broncos in cui Flacco passò 254 yard, 2 touchdown e un intercetto costoso che fu ritornato in touchdown dagli avversari.
Il 23 dicembre, battendo nettamente i Giants, i Ravens si assicurarono il secondo titolo di division consecutivo. Flacco passò 309 yard e 2 touchdown. Nell'ultimo ininfluente turno di campionato Baltimore perse contro i Bengals con Joe che disputò solo l'inizio della partita prima di venire sostituito per riposare in vista dei playoff.
Playoff 2012
Il 6 gennaio 2013, Flacco e i Ravens si sbarazzarono senza troppi problemi dei Colts nel primo turno dei playoff con Joe che passò 282 yard e 2 touchdown. La settimana successiva, in uno Sports Authority Field at Mile High congelato, andò in scena una delle partite più memorabili della storia dei playoff NFL. Contro i Denver Broncos, sotto di sette punti a un minuto dal termine, Flacco riuscì a pareggiare la gara con un passaggio da touchdown da 70 yard per Jacoby Jones. Alla fine i Ravens la spuntarono grazie a un field goal dopo due tempi supplementari col quarterback che passò 331 yard e 3 touchdown, entrambi primati personali nei playoff. Con questa vittoria, Flacco pareggiò il record NFL di Eli Manning per gare di playoff vinte in trasferta da un quarterback.
Nella finale della AFC, Flacco, al terzo tentativo, riuscì a guidare i Ravens al Super Bowl. In trasferta contro i Patriots, Joe trascinò la squadra con 240 yard e 3 passaggi da touchdown.
Super Bowl XLVII
Il 3 febbraio 2013, nel Super Bowl XLVII contro i San Francisco 49ers, Flacco condusse i Ravens al secondo titolo della loro storia. Joe completò 22 passaggi su 33 tentativi per 287 yard e 3 passaggi da touchdown, tutti nel primo tempo. I Ravens vinsero per 34 a 31 e Flacco fu nominato miglior giocatore dell'incontro. I suoi playoff si conclusero così con 11 passaggi da touchdown (pareggiando il record NFL in una singola annata della post-season, detenuto da Joe Montana e Kurt Warner) non subendo alcun intercetto.
Stagione 2013