Il campionato italiano di calcio di Eccellenza regionale 2003-2004 è stato il tredicesimo organizzato in Italia. Rappresenta il sesto livello del calcio italiano.
Questo è il girone organizzato dal comitato regionale della Puglia.
Aggiornamenti L'Associazione Sportiva Ruvo ha ceduto il proprio titolo sportivo a un'altra società, che ha cambiato nome allo stesso in "Associazione Sportiva Real Altamura". L'Associazione Calcio Virtus Locorotondo si è trasferita a Monopoli, cambiando nome in "Associazione Calcio Monopoli".
Squadre partecipanti Squadra Città A.C. AcquavivaAcquaviva delle Fonti (BA) U.S. AltamuraAltamura (BA) A.S.D. Antonio Toma MaglieMaglie (LE) U.S. CasaranoCasarano (LE) Pol. CopertinoCopertino (LE) A.S. Calcio FasanoFasano (BR) A.S.D. Francavilla CalcioFrancavilla Fontana (BR) A.C. GallipoliGallipoli (LE) A.C. MonopoliMonopoli (BA) Ostuni SportOstuni (BR) U.S. Pro Italia GalatinaGalatina (LE) A.S. Real AltamuraAltamura (BA) U.S. San Giorgio ApricenaApricena (FG) Pol. San Pancrazio SalentinoSan Pancrazio Salentino (BR) A.S. San Paolo BariBari (BA) A.S.D. TaurisanoTaurisano (LE) A.S. Tricase CalcioTricase (LE) U.S. VictoriaBari (BA)
Classifica finale Squadra 1. 823425727425+49 2. 663420685129+22 3. 6134171074830+18 4. 593417895132+19 5. (-1)5034149114640+6 6. 50341311104946+3 7. 4834139124042-2 8. San Giorgio Apricena46341113104136+5 9. Victoria Bari4634137144345-2 10. 4434135163341-8 11. Acquaviva4134118153845-7 12. 40341010143740-3 13. 40341010143543-8 14. 3934109153852-14 15. San Pancrazio3934123193544-9 16. 333489173450-16 17. 3034612163044-14 18. 233458212873-45
Legenda: Promosso in Serie D 2004-2005. Ammesso ai Play-Off nazionali. Retrocesso in Promozione Puglia 2004-2005. Promozione diretta. Retrocessione diretta.
Note: Tre punti a vittoria, uno a pareggio, zero a sconfitta.
San Paolo Bari promosso in Serie D 2004-2005 perché finalista della Coppa Italia Dilettanti 2003-2004.
San Pancrazio retrocesso in Promozione Puglia 2004-2005 dopo aver perso lo spareggio salvezza con il Real Altamura (giunto a pari punteggio in classifica).
Fasano penalizzato con la sottrazione di 1 punto in classifica.
Spareggio salvezza Risultato Luogo e data Real Altamura 4-0 San Pancrazio ?, ? 2004
Bibliografia ANNOGOL 2005 di Carlo Fontanelli - GEO Edizioni
Puglia