Carriera Nel 1992 entrò nelle giovanili dell'Albacete Balompié e nel 2004 venne aggregato alla prima squadra. Il 2 settembre 1995 esordì in Primera División in una partita persa 3-0 in casa dello Sporting Gijón. Nella stagione 1995-1996 giocò 35 partite, ricevendo sei ammonizioni e un'espulsione. L'Albacete retrocesse in Segunda División e Muñoz restò per altre cinque stagioni.
Nel 2000 passò all'Atlético Madrid, appena retrocesso in Segunda División. Giocò 12 partite senza segnare e la squadra della capitale spagnola ottenne la promozione in Primera División arrivando al primo posto in campionato.
Muñoz fu acquistato dal Deportivo de la Coruña che lo cedette in prestito al , in Segunda División. Il paraguaiano Roberto Acuña invece si trasferì dal Real Saragozza al Deportivo.
Muñoz restò in Aragona per due stagioni. Nella prima ottenne la promozione e nella seconda vinse la Coppa del Re. Nel 2004 fu ceduto per una stagione in prestito al Terrassa FC, in Segunda División. Giocò 34 partite e la squadra retrocesse. Finito il campionato entrò a far parte della squadra del Deportivo, con cui collezionò una presenza nella stagione 2005-2006. Giocò per 16 minuti contro l'Osasuna a Pamplona.
Nella stagione 2006-2007 vestì la maglia della Real Sociedad Deportiva Alcalá, prima di passare al Club Polideportivo Villarrobledo. Giocò per due stagioni con il club di Villarrobledo e si ritirò nel 2009.
Palmarès Giocatore Club Competizioni nazionali
Atlético Madrid: 2001-2002
Real Saragozza: 2003-2004
Collegamenti esterni