Il governatorato di Tomsk () è stato un gubernija dell'Impero russo, che occupava un territorio attualmente suddiviso fra l'oblast' di Tomsk, di Kemerovo e di Novosibirsk e i territori dell'Altaj e di Krasnojarsk nonché della regione del Kazakistan Orientale.
Istituito nel 1804, esistette fino al 1924. Il capoluogo era Tomsk.
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