__NOTOC__ La terza stagione della serie televisiva Nikita è stata trasmessa in prima visione assoluta negli Stati Uniti d'America da The CW dal 19 ottobre 2012 al 17 maggio 2013.
In Italia la stagione è stata trasmessa in prima visione da Premium Action, canale a pagamento della piattaforma Mediaset Premium, dal 6 aprile al 31 agosto 2013; in chiaro è stata trasmessa da Italia 1 dal 15 aprile al 24 luglio 2014.
n°Titolo originaleTitolo italianoPrima TV USA Prima TV Italia 1 3.0 3.0 19 ottobre 2012 6 aprile 2013 2 Innocence L'innocente 26 ottobre 2012 13 aprile 2013 3 True Believer La terrorista 2 novembre 2012 20 aprile 2013 4 Consequences Conseguenze 9 novembre 2012 27 aprile 2013 5 The Sword's Edge Il filo della lama 30 novembre 2012 4 maggio 2013 6 Sideswipe Sideswipe 7 dicembre 2012 11 maggio 2013 7 Intersection Intersezione 18 gennaio 2013 18 maggio 2013 8 Aftermath Il giorno dopo 25 gennaio 2013 25 maggio 2013 9 Survival Instincts Istinti di sopravvivenza 1º febbraio 2013 1º giugno 2013 10 Brave New World Il nuovo mondo 8 febbraio 2013 8 giugno 2013 11 Black Badge Il distintivo nero 22 febbraio 2013 15 giugno 2013 12 With Fire Fuoco con fuoco 1º marzo 2013 22 giugno 2013 13 Reunion Faccia a faccia 8 marzo 2013 29 giugno 2013 14 The Life We've Chosen La vita che abbiamo scelto 15 marzo 2013 6 luglio 2013 15 Inevitability Blue-Files 29 marzo 2013 13 luglio 2013 16 Tipping Point Massa critica 5 aprile 2013 20 luglio 2013 17 Masks Maschere 12 aprile 2013 27 luglio 2013 18 Broken Home Impossibile salvare tutti 19 aprile 2013 3 agosto 2013 19 Self-Destruct Autodistruzione 26 aprile 2013 10 agosto 2013 20 High-Value Target Bersaglio di valori 3 maggio 2013 17 agosto 2013 21 Invisible Hand La mano invisibile 10 maggio 2013 24 agosto 2013 22 Til Death Do Us Part Finché morte non ci separi 17 maggio 2013 31 agosto 2013
3.0 Titolo originale: 3.0 Diretto da: Eagle Egilsson Scritto da: Craig Silverstein Trama Ryan convince il presidente degli Stati Uniti a non distruggere la divisione in quanto è convinto che possa essere usata per prendere tutti gli agenti ribelli che sono fuggiti durante lo scontro con Percy. Il presidente accetta alla condizione che dopo aver preso tutti i cani sciolti, la divisione verrà chiusa per sempre. Ryan viene affiancato da Nikita, Michael, Alex, Birkhoff e Sonya. La loro prima missione per prendere gli agenti ribelli sarà un fallimento e vedrà la cattura di Michael da parte della polizia. Per liberarlo Alex dovrà tornare nelle vesti di Alexandra Udinov e grazie al suo potere mediatico riuscirà a liberare Michael. Alla fine Michael e Nikita si trovano davanti a una fontana e lui le chiede di sposarlo.
L'innocente Titolo originale: Innocence Diretto da: John Badham Scritto da: Mary Trahan Trama Michael e Nikita devono affrontare una nuova minaccia. Un ex agente della divisione, Wade, ha rapito una bambina e l'ha addestrata affinché potesse diventare forte e abile come le reclute che addestrava quando era nella divisione. La bambina, di nome Liza, è tenuta prigioniera in uno stanzino sorvegliato e quando arriverà il momento, Liza, dovrà compiere la sua missione omicida. Il team prende Liza e la porta alla divisione dove Nikita le parla e sembra averla convinta, ma la bambina riesce a fuggire e ritorna da Wade. Prima che la missione possa avere atto, Nikita ritrova Liza e Michael uccide Wade. Nikita e Alex portano Liza dai genitori che l'aspettavano da tantissimo tempo.
La terrorista Titolo originale: True Believer Diretto da: Danny Cannon Scritto da: Carlos Coto Trama Nikita viene informata da Ryan che un'agente della divisione è stata catturata e che la divisione deve attivarsi per tirarla fuori. Nikita è perplessa e si chiede il motivo per il quale si debbano ancora fare questo tipo di missioni. La divisione scopre che Mia (la presunta agente catturata) è in realtà entrata a far parte dell'organizzazione terroristica guidata da Joshua, che si propone di uccidere il senatore americano, accusandolo di non curarsi dei disagiati ma di pensare solo al proprio potere. La divisione scopre qual è il luogo del veniente attentato, Nikita trova Mia e la convince che Joshua organizza in realtà i suoi attentati solo per motivi di soldi, per arricchirsi per conto di altri (lo fa attraverso il bot volante di Birkhoff che riprende la conversazione tra Joshua e un suo infiltrato nella scorta incaricata alla protezione del senatore). Mia decide così di fermare Salvador, il ragazzo con la bomba presente nel pubblico, e pronto a farla saltare. Mia lo ferma, ma nel tentativo di salvare il ragazzo viene uccisa dagli agenti che cercano di ucciderlo, Nikita neutralizza Salvador e sventa l'attentato.
Conseguenze Titolo originale: Consequences Diretto da: Nick Copus Scritto da: Kristen Reidel Trama Amanda manda un ex agente della divisione, Anne, a liberare Owen, rinchiuso in una cella in Russia. Owen riesce a mettersi in fuga e manda un messaggio a Nikita, la quale recepisce il messaggio e lo va a prendere. Arrivato alla divisione Owen è sconvolto per tutto quello che vede. Non può credere al fatto che Nikita abbia preso il controllo della divisione. Michael e Ryan non si fidano molto di Owen e nel frattempo il team comincia a sospettare che all'interno del bunker ci sia una talpa di Amanda.
Il filo della lama Titolo originale: The Sword's Edge Diretto da: Kenneth Fink Scritto da: Albert Kim Trama Un ex agente della Divisione, Markov, si è spinto così oltre da essere eletto presidente dell'Uzbekistan. Tocca ora a Nikita e al gruppo fermarlo.
Sideswipe Titolo originale: Sideswipe Diretto da: Joshua Butler Scritto da: Terry Matalas e Travis Fickett Trama Nikita e Michael intercettano Cyrus, un trafficante di armi intento ad acquistare un nuovo strumento tecnologico per conto di Ari Tasarov, chiamato Sideswipe, in grado di deviare qualsiasi tipo di segnale. Dalle chiamate ai missili. Cyrus viene catturato da Nikita ma riesce a fuggire con il Sideswipe, ma prima di scomparire del tutto, lascia un messaggio in codice a Nikita, la quale grazie a esso riesce a trovare il luogo dove avverrà lo scambio. Nikita trova infine il nascondiglio di Amanda la quale ha organizzato una trappola per Nikita che però grazie alla sua intelligenza non andrà a buon fine. Nel frattempo Birkhoff scopre da quale terminale vengono mandati i messaggi ad Amanda. La talpa è Sonya.
Intersezione Titolo originale: Intersection Diretto da: Dwight Little Scritto da: Michael Brandon Guercio Trama Michael parla con Alex riguardo al suo abuso di sostanze antidolorifiche e di droga e lei lo supplica di non dire nulla a Nikita. Birkhoff confessa al team che Sonya è la talpa di Amanda la quale le ha riattivato il killer chip e lo attiva se Sonya non manderà un messaggio con delle informazioni utili ogni due ore. Amanda ha però introdotto un'altra spia all'interno della divisione, che ha il compito di sorvegliare Sonya. Ryan e il team organizza un piano per sfruttare Sonya per scoprire dove si trova Amanda. Durante l'inseguimento tra Nikita e Amanda, alla divisione hanno disattivato il chip di Sonya che ora è libera. Nikita uccide Anne ma non spara ad Amanda perché troppo impegnata a salvare Michael che è rimasto incastrato con una mano sotto la macchina. Nikita si accorge che il serbatoio esploderà e che l'unico modo per salvare Michael è di tagliargli la mano.
Il giorno dopo Titolo originale: Aftermath Diretto da: Brad Turner Scritto da: Carlos Coto Trama D'ora in avanti, a causa della perdita della mano di Michael, ad affiancare Nikita sul campo sarà Owen. La prima missione del duo sarà quella di prendere un mercenario di nome Liam e mentre loro sono operanti sul campo Michael ricopre un nuovo ruolo nella Divisione. Il rapporto tra lui e Nikita, però, viene turbato dall'intesa che c'è tra Nikita e Owen e dal fatto che Michael si sente tagliato fuori dai giochi.
Istinti di sopravvivenza Titolo originale: Survival Instincts Diretto da: John Showalter Scritto da: Albert Kim Trama Un agente mercenario di nome Ray rapisce la sua ex ragazza perché ancora innamorato di lei e la porta nel bosco in una tana costruita da lui stesso. Ryan manda il team a salvare la ragazza ma Michael decide di mandare Owen al posto suo e Nikita rimane perplessa da questo comportamento.
Il nuovo mondo Titolo originale: Brave New World Diretto da: Marc David Alpert Scritto da: Kristen Reidel Trama Michael abbandona ufficialmente il suo ruolo da agente operativo per dedicarsi a coordinatore delle missioni. Nikita riceve una notizia da Birkhoff. Un'organizzazione di scienziati ha messo a punto un nuovo tipo di protesi fatte con un osso in fibra di carbonio e rivestite di pelle vera, ricavata con il DNA della persona stessa. Questo vuol dire che le crisi di rigetto sparirebbero. Nikita parte in missione per cercare informazioni su questa organizzazione ma quando Alex, Michael e Ryan scoprono il suo piano la raggiungono.
Il distintivo nero Titolo originale: Black Badge Diretto da: David Grossman Scritto da: Mary Trahan Trama Un'agente della CIA di nome Naomi viene a conoscenza di alcuni informazioni che potrebbero collegare la deceduta senatrice Madeline Pierce alla divisione. Naomi consegna il fascicolo nelle mani del direttore della CIA, Morgan Kendrick il quale poco dopo verrà ucciso e della sua morte verrà accusato Sean. Sean verrà trattenuto dalla CIA in custodia ma Nikita promette ad Alex che lo tirerà fuori. Nikita quindi organizza un piano pericoloso che prevede la falsa morte di Sean agli occhi di tutti. Viene quindi inscenata la morte e Sean viene portato alla divisione sano e salvo.
Fuoco con fuoco Titolo originale: With Fire Diretto da: Eagle Egilsson Scritto da: Carlos Coto Trama Ari Tasarov viene tradito da Amanda e si fa catturare dalla divisione per stare al sicuro. Ari propone uno scambio a Nikita: lui le dirà la prossima mossa di Amanda a patto che lei gli dia cinquanta milioni di dollari.
Faccia a faccia Titolo originale: Reunion Diretto da: Jon Cassar Scritto da: Terry Matalas e Travis Fickett Trama Amanda vuole la scatola nera e per prenderla rapisce il figlio di Ari, Stefan, per usarlo come leva. Ari prega Nikita di aiutarlo. La guardia del corpo di Stefan però, rapisce Nikita e Amanda e le due, legate insieme, saranno costrette a parlare dei propri passati e per salvarsi dovranno collaborare. Dopo essersi liberati, Amanda rapisce Alex.
La vita che abbiamo scelto Titolo originale: The Life We've Chosen Diretto da: Brad Turner Scritto da: Albert Kim Trama Amanda tiene prigioniera Alex e intende lasciarla andare solo in cambio di Ari. Michael assegna la missione di scambio a Nikita e Sean ma Ryan aggiunge anche Owen. Nel frattempo Alex fa la conoscenza di Larissa, un'altra prigioniera come lei. Alex promette lei di liberarla ma la missione non va come aveva previsto perché Nikita si intromette e Larissa muore. Alex è arrabbiata con Nikita per via della missione andata male.
Blue-Files Titolo originale: Inevitability Diretto da: Mark C. Baldwin Scritto da: Kristen Reidel Trama Il presidente degli stati uniti incarica la divisione di svolgere per lei alcune missioni omicide. Nikita vuole organizzare una missione per uccidere il presidente del Chad ma Alex è contraria e pensa che Nikita stia diventando come Percy e quindi chiede aiuto a Birkhoff per trovare qualcosa per incastrare Danforth nel caso qualcosa andasse storto.
Massa critica Titolo originale: Tipping Point Diretto da: Dwight Little Scritto da: Oliver Grigsby Trama Nikita e Michael scoprono che esiste un nuovo arto che porterebbe Michael a quello di un tempo ma il prezzo da pagare è alto. Ryan incarica Sean e Alex di scoprire i capi di un ammutinamento interno alla divisione. Rachel, un agente operativo, cerca di scappare ma viene catturata e interrogata da Ryan.