Era la terzogenita e la seconda delle figlie femmine di Enrico II, Conte di Nassau-Siegen e di sua moglie Maria Maddalena, nata Contessa di Limburg-Stirum.
Vita Nata nella sede della famiglia del Castello di Wisch a Terborg, la morte della sorella maggiore Ernestina nel 1652 lasciò Sofia Amalia come unica figlia femmina sopravvissuta dei suoi genitori, in aggiunta di due fratelli, Guglielmo Maurizio (in seguito Principe di Nassau-Siegen) e Federico.
A L'Aia il 25 ottobre 1675, Sofia Amalia sposò Federico Casimiro Kettler, Principe Ereditario di Curlandia. Ebbero cinque figli:
Federico Kettler (3 aprile 1682 - 11 febbraio 1683), Principe Ereditario di Curlandia. Maria Dorotea Kettler (2 agosto 1684 - 17 gennaio 1743), sposò Alberto Federico, Margravio di Brandeburgo-Schwedt. Eleonora Carlotta Kettler (11 giugno 1686 - 28 luglio 1748), sposò Ernesto Ferdinando, Duca di Brunswick-Lüneburg. Amalia Luisa Kettler (27 luglio 1687 - 18 gennaio 1750), sposò Federico Guglielmo Adolfo, Principe di Nassau-Siegen. Cristina Sofia Kettler (15 novembre 1688 - 22 aprile 1694).
Nel 1682, dopo la morte di suo suocero, Sofia Amalia divenne duchessa consorte di Curlandia. Morì sei anni dopo.
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