結合タンパク質（けつごうタンパクしつ、）とは、特定の分子と特異的に結合するタンパク質である。
この記事では結合タンパク質の一覧を示す。
DNA結合タンパク質 DNA結合タンパク質 (DNA-binding protein) 一本鎖DNA結合タンパク質 (single-strand binding protein) テロメア結合タンパク質 (telomere-binding protein) cAMP応答配列結合タンパク質 (cAMP response element-binding protein: CREB) ステロール調節配列結合タンパク質 (sterol regulatory element-binding protein) TATA結合タンパク質 (TATA-binding protein) CCAATエンハンサー結合タンパク質 (CCAAT-enhancer-binding protein) メチルCpG結合ドメインタンパク質2 (methyl-CpG-binding domain protein 2)
RNA結合タンパク質 RNA結合タンパク質 (RNA-binding protein) ポリA結合タンパク質 (poly(A)-binding protein) キャップ結合タンパク質複合体 (nuclear cap-binding protein complex) 鉄応答配列結合タンパク質 (iron-responsive element-binding protein) ポリピリミジントラクト結合タンパク質 (polypyrimidine tract-binding protein) CPE結合タンパク質 (CPE-binding protein)
タンパク質結合タンパク質 CREB結合タンパク質 (CREB-binding protein: CREBBP、CBP) アクチン結合タンパク質 (actin-binding protein) C4b結合タンパク質 (C4b-binding protein) Rap GTP結合タンパク質 (Rap GTP-binding protein) カルモジュリン結合タンパク質 (calmodulin-binding protein) シンタキシン結合タンパク質 (syntaxin-binding protein) シンタキシン結合タンパク質2 (Syntaxin-binding protein 2) シンタキシン結合タンパク質3 (syntaxin-binding protein 3) インスリン様増殖因子結合タンパク質 (insulin-like growth factor-binding protein) 成長ホルモン結合タンパク質 (growth hormone-binding protein) ミオシン結合タンパク質C (myosin-binding protein C) 高密度リポタンパク質結合タンパク質 (HDL-binding protein、HBP)
脂質結合タンパク質 フォスファチジルエタノールアミン結合タンパク質 (phosphatidylethanolamine-binding protein) フォスファチジルエタノールアミン結合タンパク質1 (phosphatidylethanolamine-binding protein 1) オキシステロール結合タンパク質 (oxysterol-binding protein) 脂肪酸結合タンパク質 (fatty acid-binding protein) 肝臓型脂肪酸結合タンパク質 (liver fatty acid-binding protein ) アシルCoA結合タンパク質 (acyl-CoA-binding protein) 回腸脂質結合タンパク質 ileal lipid-binding protein)
金属結合タンパク質 カルシウム結合タンパク質 (calcium-binding protein) カルシウム結合タンパク質1 (calcium-binding protein 1) S100カルシウム結合タンパク質A1 (S100 calcium-binding protein A1) 鉄結合タンパク質 (iron-binding protein) 亜鉛結合タンパク質 (zinc-binding protein) メタロチオネイン
その他 ペニシリン結合タンパク質 (penicillin-binding protein) レチノール結合タンパク質 (retinol-binding protein) レチノール結合タンパク質4 (retinol-binding protein 4) オドラント結合タンパク質 (odorant-binding protein) リポ多糖結合タンパク質 (lipopolysaccharide-binding protein) チロシン結合タンパク質 (thyroxine-binding proteins) 葉酸結合タンパク質 (folate-binding protein) GTP結合タンパク質 (GTP-binding protein) レチンアルデヒド結合タンパク質1 (retinaldehyde-binding protein 1) アンドロゲン結合タンパク質 (androgen-binding protein) マルトース結合タンパク質 (maltose-binding protein) ビタミンD結合タンパク質 (vitamin D-binding protein) FK506結合タンパク質 (FK506-binding protein、FKBP) エンドトキシン結合タンパク質 (endotoxin-binding protein) 核マトリクス結合タンパク質 (nuclear matrix-associated protein)