以下は、2021年のBillboard Japan Hot 100チャートシングル1位の一覧である。Billboard Japan Hot 100（以下Japan Hot 100）は、日本におけるシングルのヒットをランク付けした音楽チャートの一つである。Japan Hot 100はCDセールス、音楽ダウンロードサービスの販売実績、ストリーミングサービスや動画サービスでの再生数、ラジオ放送回数、PCでCDを読み込んだ（ルックアップ）回数、ツイート、カラオケ歌唱回数の8指標からなる総合チャートである。

2021年度のチャート集計期間は2020年11月23日から2021年11月28日である。

年間チャート首位を獲得したシングルは優里の「ドライフラワー」であった。2020年11月以降、年間を通してトップ10圏内にランクインする異例のロングヒットを記録し、ストリーミング、ダウンロード、カラオケの3指標で1位となった。前年度と同じく、CDリリースのない楽曲が年間首位を獲得した。

「ドライフラワー」の週間Hot 100チャート最高位は2位であるため、以下のリストには含まれていない。

チャート遍歴 2021年年間チャート首位のシングルである優里の「ドライフラワー」は週間Hot 100チャートで1位を獲得しなかった 日付曲名アーティスト名出典1月4日付ビューティフルNEWS1月11日付炎LiSA1月18日付1月25日付週刊うまくいく曜日ジャニーズWEST2月1日付GrandeurSnow Man2月8日付僕は僕を好きになる乃木坂462月15日付恋落ちフラグSKE482月22日付キミトミタイセカイ関ジャニ∞3月1日付僕が僕じゃないみたいだSixTONES3月8日付Luv BiasKis-My-Ft23月15日付うっせぇわAdo3月22日付RoarKAT-TUN3月29日付One Last Kiss宇多田ヒカル4月5日付LET'S MUSICSexy Zone4月12日付Take a pictureNiziU4月19日付4月26日付BAN櫻坂465月3日付ひとりじゃないSEVENTEEN5月10日付Born To Be WildJO15月17日付サムシング・ニュージャニーズWEST5月24日付ネガティブファイターHey! Say! JUMP5月31日付Magic TouchKing & Prince6月7日付ButterBTS6月14日付6月21日付ごめんねFingers crossed乃木坂466月28日付Pale Blue米津玄師7月5日付不思議星野源7月12日付ButterBTS7月19日付7月26日付HELLO HELLOSnow Man8月2日付Permission to DanceBTS8月9日付でっかい愛ジャニーズWEST8月16日付夏のハイドレンジアSexy Zone8月23日付マスカラSixTONES8月30日付REALJO19月6日付群青ランナウェイHey!Say!JUMP9月13日付あの頃の君を見つけたSKE489月20日付We Just Go Hard feat. AK-69KAT-TUN9月27日付FearKis-My-Ft210月4日付君に叱られた乃木坂4610月11日付根も葉もRumorAKB4810月18日付恋降る月夜に君想ふKing & Prince10月25日付流れ弾櫻坂4611月1日付明け星LiSA11月8日付ってか日向坂4611月15日付Gifted.BE：FIRST11月22日付初心LOVEなにわ男子11月29日付12月6日付Sing-alongHey!Say!JUMP12月13日付Secret TouchSnow Man12月20日付残響散歌Aimer12月27日付僕らの季節JO1

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