新宿統括センター（しんじゅくとうかつセンター）は、東日本旅客鉄道（JR東日本）首都圏本部の駅・運転士・車掌を所管していた組織である。 2024年3月16日に新宿営業統括センター、新宿運輸区を統合して発足し、2025年3月15日に、御茶ノ水営業統括センターの一部、渋谷営業統括センターの一部を更に統合した。2026年6月30日限りで首都圏本部とともに廃止され、現在は新宿事業本部となっている（乗務員区所は対外的に「新宿乗務ベース」と呼称）。
所管 駅 新宿駅 - 所長所在駅 御茶ノ水駅 水道橋駅 飯田橋駅★ 市ケ谷駅 四ツ谷駅 信濃町駅 千駄ケ谷駅 代々木駅 大久保駅★ 新大久保駅★ 高田馬場駅★ ★: JR東日本ステーションサービスに業務委託
乗務ユニット 新宿駅構内に設置（旧新宿運輸区） 担当線区（運転士） 湘南新宿ライン：新宿駅 - 小田原駅・逗子駅間 東海道線：東京駅 - 来宮駅間 東海道貨物線：新鶴見信号場 - 小田原駅間 埼京線（相鉄線直通列車のみ）：新宿駅 - 羽沢横浜国大駅間
担当線区（車掌） 湘南新宿ライン：大宮駅 - 小田原駅・逗子駅間 中央本線：東京駅 - 塩尻駅間（中距離電車のみ乗務） 篠ノ井線：塩尻駅 - 松本駅間 東海道線：東京駅 - 熱海駅間 埼京線（相鉄線直通列車のみ）：新宿駅 - 羽沢横浜国大駅間 特急列車：あずさ、かいじ、湘南（新宿駅発着のみ）
歴史 2022年7月1日 - 新宿営業統括センター（新宿駅）が発足。 2023年6月1日 - 御茶ノ水営業統括センター（御茶ノ水、神田、水道橋各駅の統合）が発足。 2024年3月16日 - 新宿営業統括センター、新宿運輸区を統合して新宿統括センター発足。新宿営業統括センター、新宿運輸区を廃止する。 2025年3月15日 - 新宿統括センターに、御茶ノ水営業統括センターの一部（御茶ノ水、水道橋）、渋谷営業統括センターの一部（四ツ谷、信濃町、千駄ケ谷、代々木）をさらに統合する。御茶ノ水営業統括センターを廃止する。 2026年7月1日 - 首都圏本部の廃止に伴い、中野統括センターと業務統合のうえで、新宿事業本部へ改組される。