藤澤 知親（ふじさわ ともちか）は、日本の生物学者、データサイエンティスト。滋賀大学データサイエンス・AIイノベーション研究推進センター講師。専門は進化生物学、進化ゲノミクス、系統ゲノミクス、DNA分類学、バイオインフォマティクス。DNA配列やゲノムデータ、画像データなどを用いた生物種の分類、種分化、生物多様性の解析に関する研究を行っている。
経歴 大阪大学基礎工学部を卒業後、大阪大学大学院工学研究科修士課程を修了した。その後、イギリスのインペリアル・カレッジ・ロンドン（Imperial College London）生命科学系博士課程に進学し、生物学の博士号（Ph.D.）を取得した。博士課程では進化生物学者ティモシー・G・バラクラフ（Timothy G. Barraclough）の指導のもと、DNA配列データを用いて生物の種境界を推定する手法などを研究した。
博士課程修了後は京都大学の動物生態学研究室で研究員を務め、オサムシ類や周期ゼミなどを対象とした進化ゲノミクス、種分化に関する研究に従事した。
2017年にはフランスのパスツール研究所およびフランス国立科学研究センター（CNRS）・LIRMMに所属し、Evolutionary Bioinformatics Laboratoryで博士研究員として研究を行った。
その後京都大学に戻り、2019年4月に滋賀大学データサイエンス教育研究センター助教に就任した。
滋賀大学では、組織改編に伴いデータサイエンス・AIイノベーション研究推進センター助教を経て、2024年4月に同センター特任講師、2025年12月に講師となった。
研究 進化生物学およびバイオインフォマティクスを専門とし、DNA配列やゲノムデータ、画像データなどを用いて、生物の種分化や多様性を解析する研究を行っている。
初期には、DNA配列から生物種の境界を統計的に推定する手法の研究に取り組み、系統樹上における種内の遺伝的変異と種間の分岐を識別する種境界推定法の改良や評価を行った。また、複数の遺伝子領域から得られる情報を利用して種境界を推定する計算手法の開発にも携わり、解析用ソフトウェアの実装も行っている。
その後は、ゲノムデータを用いて生物が異なる種へと分化する過程を明らかにする研究を進めた。周期ゼミを対象とした研究では、異なる生活周期がどのように進化したかを集団ゲノム解析によって検討した。また、オサムシ類を対象として、種ごとに異なる交尾器の形態や捕食に関連する形態の違いについて、その遺伝的基盤と種分化との関係を解析している。
滋賀大学着任後は、従来の進化ゲノミクスやDNA分類学に加え、機械学習や深層学習を生物多様性研究へ応用している。大量に採集された昆虫を画像から自動的に分類する手法の開発では、撮影条件や採集地域が異なる場合にも分類性能を維持するためのドメイン適応などを利用している。
また、DNAバーコーディングと機械学習を組み合わせた生物分類についても研究しており、学習データに含まれていない未知の生物種を検出するOut-of-Distribution検知の性能や限界を検討している。画像解析とDNAメタバーコーディングを組み合わせることで、多数の生物を効率的に分類し、生物多様性をモニタリングする手法の開発にも取り組んでいる。
このほか、進化生物学で培った画像解析や機械学習の手法を、生物学以外のデータ解析や産学連携研究にも応用している。
社会・産学連携活動 滋賀大学データサイエンス・AIイノベーション研究推進センターでは、生物学分野の研究に加え、トヨタ自動車、日東電工、JR東海などの企業との産学連携にも携わっており、画像解析や機械学習を活用した共同研究、企業向けデータサイエンス人材育成プログラムなどを担当している。
脚注
外部リンク