thumb|330px|沖縄戦に従軍するため鹿屋基地に集結した芙蓉部隊第一陣、前2列目中央無帽でアメリカ軍のフライトジャケットを着ている人物が美濃部、撮影日は1945年4月1日から4日のいずれかの日 芙蓉部隊（ふようぶたい）とは、大東亜戦争（太平洋戦争）末期の日本海軍において、三個飛行隊（戦闘八〇四飛行隊、戦闘八一二飛行隊、戦闘九〇一飛行隊）により編成された進攻夜間戦闘機隊。
「関東空部隊」として発足した当初、自らで「芙蓉部隊」（もしくは「芙蓉隊」）と称し、沖縄戦における菊水作戦中に正式な部隊名として呼称されるようになったアジア歴史センター「芙蓉部隊天号作戦々史 自昭和20年2月1日至昭和20年8月末日 第3航空艦隊131航空隊芙蓉部隊」「一、部隊ノ編制経過」。美濃部正少佐が指揮を執り、美濃部の方針により特攻を拒否し、敵飛行場や敵艦船に対する夜襲を主戦法としたとされる航空自衛隊静浜基地 https://www.mod.go.jp/asdf/shizuhama/sub/fuyo_rekishi.html。しかし、特攻そのものは否定しておらずアジア歴史センター「芙蓉部隊天号作戦々史 自昭和20年2月1日至昭和20年8月末日 第3航空艦隊131航空隊芙蓉部隊」「5.戦訓」48頁中33-35頁、決定的な戦機到来の暁には特攻する覚悟であり、実際に複数回の特攻出撃を行い、芙蓉部隊隊員の4人が特攻による戦死で連合艦隊司令長官から感状を授与されている。芙蓉部隊隊員の多くも、自分達が特攻隊の編成から外されたという認識は無く、部隊の一部が「夜鴉特攻隊」と称して特攻の訓練を行っていたなど、部隊の実態については異聞がある。
特徴 thumb|200px|芙蓉部隊員のマフラーの色の元となったフヨウの花、1日の間に白から次第に赤くなっていくが、マフラーはこの写真のような赤くなりきる前の薄紅色で染められていた 部隊の名称は、富士山の別名“芙蓉峰”からとった芙蓉隊、後に芙蓉部隊が用いられた。これは部隊の根拠地となった静岡県志太郡静浜村（現・焼津市）の藤枝基地（現・航空自衛隊静浜基地）から富士山がよく見えたことにちなんで美濃部少佐が命名したものである。第三航空艦隊長官寺岡謹平中将の揮毫による隊旗も作られた。芙蓉部隊所属の搭乗員は、フヨウの花の色である薄紅色のマフラーを着用していた。 編制上の芙蓉部隊（関東空部隊）は第三航空艦隊に所属し、1945年2月1日から4月19日まで「関東空部隊」の名前で指揮官は関東海軍航空隊司令、4月20日以降は 「芙蓉部隊」の名前で第一三一海軍航空隊に所属し、指揮官は一三一空司令であった。発足時は戦闘九〇一飛行隊、戦闘八一二飛行隊は131空所属、戦闘八〇四飛行隊は北東海軍航空隊所属で、3月15日に戦闘804も131空に編入された。3月31日より美濃部を指揮官とする鹿屋部隊（戦闘901、戦闘804、戦闘812の一部）と戦闘812飛行隊長を指揮官とする藤枝部隊（戦闘812、戦闘901・戦闘804の錬成員）に分けられた。4月20日以降、美濃部を指揮官とする「鹿屋（岩川）芙蓉部隊」と戦闘812飛行隊長（後に座光寺一好少佐）を指揮官とする「藤枝芙蓉部隊」に分けられたアジア歴史センター「芙蓉部隊天号作戦々史 自昭和20年2月1日至昭和20年8月末日 第3航空艦隊131航空隊芙蓉部隊」「一、部隊ノ編制経過」。実質的な指揮は戦闘901飛行隊長（3月5日から131空飛行長）の美濃部正少佐が行っていた。 副官の徳倉正志大尉は芙蓉部隊の部隊名が決まると『芙蓉部隊の歌』という歌を作っている。
芙蓉部隊の搭乗員は特色のあるフヨウの花の色で染められたマフラーをしていた。これは、のちに芙蓉部隊が進出した岩川基地近郊の、芙蓉部隊士官らが将校クラブとして利用することになった開業医院の川崎邸で軍の後援者が兵士に対して自宅を開放しており、兵士は後援者宅で自由に休息でき、食事なども提供されていた。このような後援者の自宅を兵士はクラブや下宿と呼んでいた。、芙蓉部隊の黒川上等兵曹が川崎の妻女に対して「搭乗員のマフラーをフヨウの花の色に染めてほしい」と依頼している。妻女は歌人で花の色にも詳しかったことから、フヨウの花は白と薄紅色があるので薄紅色に染色しようと提案するなど、黒川の依頼を快諾しボランティアでマフラーの染色を請け負っている。数が大量であったため妻女ひとりではさばききれず、東京から疎開してきていた長女（夫は大本営参謀）や医院の看護婦までが手伝った。芙蓉部隊搭乗員の首で風にたなびくフヨウの花の色のマフラーは、夜目にも美しく見えたという。
夜襲 対敵空母 美濃部は1944年（昭和19年）、第九三八海軍航空隊の飛行隊長としてオーストラリア領ニューギニア（現・パプアニューギニア）のラバウルにいたときに、マラリア治療のため入院していた野戦病院で、精神障害で入院していた美濃部の教官時代の教え子の操縦員と再会「私は飛行機に乗れますよ、教官、私を退院させて下さい。零式水上偵察機に250 kg爆弾を積み、20 mm機銃4丁付けて攻撃したい」との訴えを受けている。この教え子は、従軍看護婦が、会話中の美濃部にわざわざ手信号で「頭が狂ってる」と伝えたほど正気を失って、看護婦の手を煩わしていたが、この発狂した教え子が、幻の中で描いていた攻撃方法が美濃部に強烈な印象を与え、美濃部はこの攻撃方法を「画期的な発想」と考えて、後の芙蓉部隊に繋がる夜襲戦法を決心するきっかけとなった。
しかし、攻撃するにしても鈍足の水偵では敵戦闘機の群れを突破できずに撃墜されるに違いなく、美濃部は敵戦闘機の追撃をかわすため零式艦上戦闘機の活用を思い立った。零戦に夜間飛行能力に長けた水上機搭乗員を乗せて夜襲をかければ天下無敵になると考え、南東方面艦隊に進言することにした。美濃部が退院した頃には、九三八空は3機の水偵を残すのみとなっており、戦局打開策が必要となっていた。美濃部は「南東方面艦隊に水上機搭乗員100余名、夜間飛行、洋上航法、爆撃、空戦も可能、うち飛行1000時間超えの熟練操縦員50名が残存。零戦には10日もあれば転換可能。水上機搭乗員をもって敵侵攻兵力を叩くべきである」と南東方面艦隊司令部に進言したが、この時は一蹴されてしまった。進言を却下された美濃部であったが、夜襲作戦を実践するため、指揮下の九三八空の水上機を爆装させ、敵の背後に当るニュージョージア島の二ヤイ飛行場への夜襲を命じた。この夜襲は成功し、無警戒に灯火を付けたままの滑走路に駐機する大型中型機5機を爆撃して無事帰投することができた。美濃部はこの成功で再度司令部に水上機搭乗員の零戦への転換を上申したところ、逆転で採用が決定した。トラック島竹島基地で零戦5機を受領し、水上機搭乗員からの選抜者18名が1週間で零戦操縦をマスターしたがトラック島空襲で計画は頓挫する。
1944年2月には軍令部航空参謀源田実大佐に夜襲部隊の編制を直談判し、第三〇一海軍航空隊戦闘316飛行隊の飛行隊長に任じられることとなったが、その際に美濃部が考案していたのは、零戦の爆戦により、アメリカ軍機動部隊に夜襲をかけるというものであり、具体的には、サイパン島に55機の零戦で進出し、「連日18機で未明600キロの哨戒・探索を行う」「9機4群の夜襲隊で、発艦前の敵空母を攻撃する」というものであった。（美濃部考案の敵空母への夜襲特攻戦術の詳細は#計画参照）この作戦は美濃部が戦闘316の飛行長を更迭されたため実現しなかったが、第一航空艦隊第一五三海軍航空隊戦闘901飛行隊の飛行隊長として戦ったレイテ島の戦いにおいても、指揮下の零戦や夜間戦闘機月光を、アメリカ軍機動部隊への索敵攻撃に投入しており、海軍省功績調査部に「今次数度の戦闘において丙戦（主に夜間戦闘機のこと）訓練と用法により新しき戦闘方策を樹立せるを実証せり。即ち、敵空母に対し未明発艦前の敵飛行機を甲板上に破壊し、爾後わが昼間戦闘を有利にす」と報告するなど、敵空母への夜襲に強い拘りを見せていた。そして芙蓉部隊編成後も、戦闘316や戦闘901の指揮官時と同様に、美濃部考案の敵空母に対する夜襲を試みていたが、それが実現することはなかったアジア歴史センター「芙蓉部隊天号作戦々史 自昭和20年2月1日至昭和20年8月末日 第3航空艦隊131航空隊芙蓉部隊」「偖言」。（芙蓉部隊による敵空母攻撃の詳細については#艦船攻撃を参照）
美濃部が、頑迷な日本海軍上層部に対し、航空機による夜間攻撃の有効性を説き続け、合理的思考と創意工夫で、日本海軍内でも特別な夜襲隊を運用していたなどという主張もあるが、全くの事実誤認である。美濃部が夜襲部隊を構想する以前から、日本軍の航空作戦は夜間に集中するようになっており、航空機での夜間攻撃は日本軍の普遍的な戦術となっていた。アメリカ軍が日本軍航空機の夜襲に悩まされるきっかけは、ガダルカナルの戦いの際の、日本軍の夜間攻撃機である通称「ウォッシングマシーン・チャーリー（洗濯機チャーリー）」であり、アメリカ軍兵士は、夜間に同期をずらしたエンジンで、独特のけたたましい騒音を鳴らしながら来襲する日本軍攻撃機を、洗濯機の騒音になぞらえて「ウォッシングマシーン・チャーリー」と名付けて恐れ、その騒音や爆撃への警戒で睡眠を殆ど取ることができず、対策に苦慮したアメリカ軍は夜間戦闘機の開発を急ぐこととなった。
日本軍航空機の夜襲は機動部隊にも行われるようになり、アメリカ海軍の公式報告書でもアメリカ太平洋艦隊司令長官チェスター・ニミッツ元帥が、1943年12月の時点で「南太平洋および中部太平洋における日本軍の攻撃航空活動の90%以上が夜間に行われた。」と報告している。そのため、アメリカ軍は夜間戦闘能力の強化に注力しており、アメリカ海兵隊は1942年11月16日にチェリー・ポイント海兵隊航空基地で、アメリカ海軍は1943年4月1日にで夜間戦闘機部隊を就役させ、1943年5月8日にはを開校して夜間戦闘の専門家を多数育成し、日本軍航空部隊の夜襲に備えていた。このアメリカ海兵隊と海軍の夜間戦闘能力向上策は、早々に効果を発揮し、 ロッキードPV-1の夜間戦闘機型を配備したアメリカ海兵隊夜間戦闘機隊VMF(N)-531が、1943年10月31日の夜間に機上レーダーにより一式陸上攻撃機を撃墜している。
美濃部が戦闘316で敵機動部隊への夜襲を画策していたサイパンの戦い時点では、既に各空母に夜間戦闘機が配置されており、日本軍は航空機による夜襲を何度も行ったが、全て撃退されている。中でも空母「エンタープライズ」配属の夜間戦闘機隊VF(N)-103はマリアナ作戦中に一夜で3機の日本軍機を撃墜する活躍を見せており、同作戦で日本軍の夜間攻撃でのアメリカ軍艦船の損害は殆どなかった。その後も、アメリカ海軍とアメリカ海兵隊はレーダーと夜間戦闘機を駆使した夜間戦闘能力を向上させていったが、美濃部を含む日本軍側は、アメリカ軍とのエレクトロニクスの格差を最後まで理解することはなく、有効な対策を講じることはできなかった。
対敵航空基地 芙蓉部隊は、ジャンボリー作戦への迎撃や、菊水作戦で何度も敵空母部隊への攻撃を試みたが、接触することすらできず、菊水作戦途中から芙蓉部隊は沖縄の敵航空基地攻撃を命じられるようになった。（詳細は#特攻命令#4月参照）美濃部は日本軍の制空戦闘機（甲戦）では制空権の確保は困難になったと考えておりアジア歴史センター「芙蓉部隊戰闘経過」「四、芙蓉部隊作戦思想」「（イ）制空権獲得法」「（一）甲戦」、それを補うために地上で敵戦闘機を撃破すべきと考えた、これは、アメリカ軍の爆撃機B-24やB-29により、日本軍が大量の航空機を地上で撃破され戦力を消耗したことが最適例だと指摘しているがアジア歴史センター「芙蓉部隊戰闘経過」「四、芙蓉部隊作戦思想」「（イ）制空権獲得法」「（二）」、美濃部自身もフィリピンの戦いで多数の指揮下の戦闘機を爆撃で撃破された痛い経験に基づくものであった。そこで、 「夜間戦闘機といえども対大型機局地邀撃に非ずして専ら侵攻企図を有せるものなり」と、夜間戦闘機（丙戦）の戦闘目的を空戦ではなく「夜間特に黎明期銃爆撃に依り敵制空隊の漸減」と定めた。敵飛行場を攻撃するのは夜間戦闘機（丙戦）であり、日の出前1-2時間前に丙戦で敵飛行場に攻撃をかければ、当日昼間に作戦従事予定の敵作戦機が「飛行準備不如意」の状態で滑走路上に並んでいるはずであり、そこを銃爆撃すれば敵は十分な迎撃ができず、一方的に敵航空戦力の漸減が図れるはずと美濃部は想定している。これが劣勢な日本軍航空部隊がアメリカ軍航空部隊を斃せる「唯一の手段」であり、芙蓉部隊の丙戦が黎明攻撃で敵飛行場を制圧したのち、昼間に航空部隊主力が作戦行動すれば「極めて有効なる作戦主動性」を把握できるとも美濃部は考えたアジア歴史センター「芙蓉部隊戰闘経過」「四、芙蓉部隊作戦思想」「（イ）制空権獲得法」「（三）丙戦」。戦後しばらく経過してから、美濃部が「夜戦部隊はゲリラ的な戦法こそ有効」と、少数機によるゲリラ攻撃を主張していたなどと根拠なく言われることがあるが、戦時中の美濃部の理想は敵夜間戦闘機対策として、できうる限りの大兵力を同時使用して敵の応援の暇を無くそうというものであったアジア歴史センター「敵夜戦に対する対策 夜間戦闘機隊 戦訓其の3 昭和20年7月」三.當野戦隊ニテ探リタル対策並ビニ戦訓 （ト）其ノ他ノ対策（2）大兵力ノ同時使用。
美濃部が日本軍戦闘機の空戦能力を低く評価していたのは、上記の戦闘316飛行隊の指揮官時代の痛い失敗に基づいていた。美濃部は当初「水上機パイロット出身者は零戦で訓練すれば、空中戦もすぐに上達する」などと楽観的に考えていたが、実際に訓練させてみると殆ど上達が見られなかったので「そんなに短期間で空戦訓練ができるわけがない」と当初の楽観的な見通しを改めており、「戦闘機の任務は空中戦だけではない」として、本来は空戦の訓練を行っていた甲戦の零戦の搭乗員に対しても、空戦の訓練を行わないこととし、「専ら侵攻企図を有せる」夜襲に特化した訓練を行っていた。そのため、芙蓉部隊の戦闘機搭乗員は敵戦闘機に対する空戦技術を殆ど持たなかった。芙蓉部隊と同様に美濃部に特訓を受けた戦闘316飛行隊は、最新型の零戦52型で編成されていたのにも拘わらず、テニアン島のアメリカ軍艦載機に対する迎撃戦で一方的に撃墜されて全滅しており、戦闘316飛行隊と同様に芙蓉部隊の搭乗員の空戦技術が乏しいと自覚していた美濃部は、戦艦大和による海上特攻の際、第五航空艦隊司令部からの戦艦大和の護衛任務の要請を拒否したこともあった。
芙蓉部隊の訓練度 芙蓉部隊の訓練は美濃部が考案したものであり、作戦の主体である夜間に身体をならすため「猫日課」と称して昼夜を逆転させた生活を送らせていた。午前0時に起床、1時に朝食、6時に昼食、11時に夕食、午後4時に夜食として、電灯使用を制限して夜目の強化を促した。夜間洋上航法訓練では、黎明－薄暮－夜間の順で定点着陸訓練から、太平洋へ出ての洋上航法通信訓練を行った。時間と燃料が十分にないため、指揮所に基地の立体模型を作って夜間の進入経路を覚えさせ、図上演習を繰り返し実施した。薄暮・夜間飛行訓練を行うときは可能な限り見学させ、「飛ばない飛行訓練」に努めて練度向上をはかった。座学も重視して、飛行作業の合間に講義が頻繁に行われた。特に雨天時は搭乗員を集めて集中的な講義を実施した。講義の内容は航法、通信、夜間の艦艇の見え方、攻撃方法などの戦術、飛行機の構造、機材等についてであった。搭乗員の訓練は効率を第一にして実用的なことのみ徹底して教えたため、訓練時間を通常の約1/3にまで短縮することに成功したという主張もあり、美濃部自身も「特攻部隊の3倍の厳しい訓練であった」や「航空部隊幹部も若年パイロットに対し我が隊のような教育をどれほどしたであろうか」などと自画自賛している。しかし訓練の中には、搭乗員に暗闇を凝視させて夜間視力を強化するといったものもあったが、暗所視や暗順応は、医学的に訓練などで向上することはなく、訓練中の事故も多く、多数の殉職者を出している。
美濃部の徹底した夜間飛行訓練を行い、やっと離着陸ができるようになった経験の浅い搭乗員でも、往復約1,700 km、約5時間にも及ぶ夜間飛行が可能となるまで鍛え上げたとされるアジア歴史センター「芙蓉部隊天号作戦々史 自昭和20年2月1日至昭和20年8月末日 第3航空艦隊131航空隊芙蓉部隊」。その結果、1945年1月の段階では、戦闘九〇一飛行隊で夜間作戦を支障なくこなす操縦技術を有するA級操縦員は28名中3名（10.7％）に過ぎなかったが、3月の段階では戦闘九〇一飛行隊のA級操縦員は52人中15人（28.8％）、芙蓉部隊全体でも126人中34人（26.9％）と搭乗員数が急増したのにも関わらず練度が上がっている。これは、同時期の第一航空艦隊、第三航空艦隊、第五航空艦隊のA級操縦員平均割合15.8％を大きく上回り、同時期に編成された第三四三海軍航空隊のA級操縦員227人中54人（23.7％）をやや上回っていた。しかし、練成を要するD級と判定された芙蓉部隊の操縦員については126人中62人（49.2％）と半数近くにも上っており、同時期の第一、三、五航空艦隊の平均40.7％を大きく上回り、第三四三海軍航空隊に至っては227人中22人（9.6％）で芙蓉部隊の約1/5の水準であるなど、一部のA級操縦員を除けば、芙蓉部隊の平均的な夜間飛行能力はむしろ低かった。
また、単座機を除き複座以上の機種では、操縦員だけがA級でも偵察員が準A級でなければ夜間作戦は困難であり、操/偵を合算したA級搭乗員で見ると、芙蓉部隊は226名中60名(26.5％)に対し、第一、三、五航空艦隊の平均は16.8％、第三四三海軍航空隊263人中64人（24.3％）と操縦員と同様に芙蓉部隊の割合が高いが、操縦員単独と比較するとその差は少なくなっている。それに対しD級搭乗員の割合は、芙蓉部隊226人中115人（50.8％）と操縦員平均値よりさらに悪化しており、第一、三、五航空艦隊の平均47％、第三四三海軍航空隊263人中33人（12.5％）とも格差がある。従って、美濃部の猛訓練によって、芙蓉部隊の隊員の夜間戦闘の技能が極めて高かったとか、中には日本陸海軍全航空部隊中最高クラスであったなどという主張は、当時の記録からは全く確認できず、夜間飛行能力と同様に、芙蓉部隊の平均的な夜間作戦能力は低かった。
美濃部の考案したとされる「猫日課」と称する昼夜逆転訓練が芙蓉部隊独特であるというのも全くの事実相違で、昼夜逆転の生活は他の部隊でも行われており、例えば、練習機白菊で特攻出撃した白菊特別攻撃隊は、夕刻の午後5時に起床し、暗くなるのを待って離陸降爆訓練を連日行っていたなど、芙蓉部隊独自のものではなかった。また、沖縄戦が佳境に入った頃には、各部隊の夜間操縦能力は向上しており、白菊特別攻撃隊の高知空（菊水白菊隊）では、操縦も未熟な訓練生でも1か月間訓練すると、全員が夜間出撃し洋上飛行が可能な水準まで達していたなど、夜間洋上飛行での出撃は各部隊で行われるようになった。
特攻 「芙蓉部隊天号作戦々史」に芙蓉部隊が特攻に反対した根本理由が記されている。 1つに、若い搭乗員が特攻の編制を成し、司令、飛行長､隊長を編制より除きたる点に有り。 2つに、特攻隊は精神の極致なれども戦技訓練に関心少きため終局の勝利者にあらず、軍人なれば腕を磨き精神を極養するは死に至るまでの修養なり、これ戦力培養上不可欠なり。 3つに、特攻は戦機に乗じ臨機必死隊を出すべきものにして常用するは戦闘の邪道なり、芙蓉隊は対機動部隊先制制圧隊に対して決号策戦時、必死者の編制は成しありたり。（行っていた） 人曰くフィリピン島戦時の峠を見たる時、今や日本に資材不足、燃料不足、搭乗員若年にして従来の攻撃にては勝算なし、特攻攻撃こそ唯一の必勝の鍵なりと。我らはその精神は採るべきは勿論なれども、上下挙隊（部隊総員挙げ）死を賭して研究訓練する所、何事か成らざらん、特攻攻撃にて片付けるは上層幹部責任逃避なり。
このように芙蓉部隊は特攻を完全否定するものでは無く、敵の本土上陸作戦を迎え討つべく特攻を準備しており、美濃部自身がこれを直率する搭乗割になっていた。
計画 芙蓉部隊は対敵機動部隊の戦術として美濃部考案の特攻戦術を採用している。この戦術は「敵の戦闘機隊が十分な行動ができない未明に、まず芙蓉部隊機が敵空母甲板上の敵機を銃撃ロケット弾で攻撃し、発艦前に打撃を与え雷爆特攻機をもって撃滅戦を行い、最後に黎明銃爆特攻隊で搭乗員諸共敵空母甲板上に特攻し、敵空母甲板上の艦載機を一掃する」というものであった。
美濃部考案の対機動部隊特攻戦術は、1945年2月17日にジャンボリー作戦で関東近海に来襲した第58任務部隊を攻撃するために実行されたが、この日に特攻出撃を命じられた河原政則少尉によれば、指揮所に行くと自分の名前が出撃者名簿の中にあり、特攻機出撃前と同様に並べられた別れの盃（別杯）を前にして美濃部から「機動部隊を見つけたら、そのままぶち当たれ」と命じられたという。鞭杲則少尉によれば「空母を見つけたら飛行甲板に滑り込め」と命じられたのちに別盃を交わしている。沖縄戦のさいにも、別杯をかわした特攻出撃が行われたが、芙蓉部隊による機動部隊への攻撃は全て空振りに終わっており、美濃部が考案した機動部隊への特攻戦術は一度も実現することはなかった。
また、沖縄戦が始まると、芙蓉部隊はそれまで駐屯していた藤枝基地に訓練隊を残して、主力は最前線となった鹿屋基地に前進したが、この後は藤枝基地が後方基地となり、新人を訓練して、随時要員を交代させるというシステムを確立している。その訓練隊は「夜鴉特攻隊」と称され、美濃部の考案した特攻訓練が行われていた。第十二期海軍甲種飛行予科練習生出身で、月光にも乗ってＢ29邀撃戦に参加した藤本光男は、その後に藤枝基地に移って、彗星で「猫日課」の過酷な訓練に明け暮れていたが、その訓練は「帝都防衛」を任務とした特攻を想定したもので、藤本はその訓練の様子を「夜の訓練を終えると明るくなってくる。明け方・夕暮れ・夜間の3つに分けて、毎日の訓練。これだけの訓練をやって、ようやく腕前も一人前になったなと思ったら「あとは死ね」だから。」「急降下は、敵艦に体当たりする特別攻撃を意識した訓練でしかない。『帝都防衛』とは、九十九里や駿河湾にやってくる敵艦の撃沈。特攻要員と自覚した」と振り返っている。藤本はそのまま藤枝で終戦を迎え、秋田県特別攻撃隊招魂祭実行委員会が主催して毎年開催されている「秋田県特別攻撃隊招魂祭・昭和の日記念祭」では1993年から特攻隊員の生き残りとして追悼の言葉を述べている。
沖縄戦での日本軍の敗北が明らかとなり、連合軍による日本本土上陸（ダウンフォール作戦）の可能性が高まると、美濃部は「芙蓉部隊決号作戦計画」という最後の特攻・自爆作戦を考案している。その作戦計画によれば、美濃部が直卒する24機の特攻機が「敵は上陸前に、必ず機動部隊の猛攻を加えてくる。まず、爆装の索敵攻撃隊を出して敵艦隊を捕捉する。その通報を受けてやはり爆装の攻撃隊が発進し、爆弾を海面でスキップさせて敵艦の舷側にぶつける肉薄の反跳爆撃を敢行したのち、全弾を撃ちつくして艦艇に突入。空母がいて甲板上に飛行機がならんでいれば、滑りこんで誘爆で破壊する」と特攻攻撃を敢行するというものであった。特攻出撃する機体については通常の爆装のほか、主翼の燃料タンクまでに火薬を詰め込んで、特攻したときの破壊力を増大させることまで美濃部は構想していた。そして残された整備兵などの地上要員については、第五航空艦隊から出されていた日向市富高への撤退命令を美濃部は「笑止」と一笑に付し、「基地に地雷や空雷（航空機用の爆弾やロケット弾を樹上にぶら下げたもの）を敷設し、敵が上陸すれば一兵たりとも後退戦法はとらず、最後は付近住民と共に、全員が敷設した地雷、空雷で自爆し敵上陸軍と刺し違える」という地元の住民も巻き添えにした自爆作戦を敢行させる計画であったがアジア歴史センター「芙蓉部隊天号作戦々史 自昭和20年2月1日至昭和20年8月末日 第3航空艦隊131航空隊芙蓉部隊」「5.戦訓 ハ.士気」美濃部の著書では、基地に残される地上要員について、志願者を募り決死隊を編成、決死隊は穴を掘って爆弾とともに入り、敵の陸上部隊が迫ってきたら火のついたガソリン缶や地雷と空雷で抵抗し、最後は爆弾で特攻し敵戦車と刺し違える。そのほかの大多数の若い隊員に対しては、美濃部が軍命に背いて解隊命令を出し基地を離れさせて自由義勇軍とし、故郷に帰るか、市民に紛れてゲリラ戦を展開するか、各人の判断に委ねるつもりであったとしている、終戦により実行されることはなかった。
拒否 thumb|250px|美濃部が特攻を拒否する発言を行ったと主張する会議が開催されたとされる日本海軍木更津基地（1947年） 美濃部は遺稿などで「特攻は本人の意思で行うことがあっても他から命令するのは冷酷、非情な軍隊指揮で死刑宣告に等しい人格否定で自分には出来ない」と戦時中に考えていたと主張し、戦後になってからは、美濃部の主張に基づき、芙蓉部隊は特攻を採用しなかった部隊として紹介されることも多い。
芙蓉部隊の指揮官である美濃部が特攻を拒否したとして、次のようなエピソードが紹介されることが多い。
1945年（昭和20年）2月下旬、千葉県木更津市の木更津基地（現・陸上自衛隊木更津駐屯地）において日本海軍の会議が開催された。その会議の冒頭に、連合艦隊もしくは第三航空艦隊の参謀より、教育部隊を廃し、白菊や赤とんぼなどの練習機も含めた全員を特攻に投入するという説明があった。研究会に参加していた美濃部は、会議参加者のなかでは一番の若輩にもかかわらず「全力特攻と言いますが、特に速力の遅い練習機まで駆り出しても十重二十重のグラマンの防御網を突破することは不可能です。特攻のかけ声ばかりでは勝てません。敵の弾幕を突破するような手段を考えなければなりません。フィリピン戦では敵は300機の直援戦闘機を準備していました。今度も同じでしょう。」と説明した参謀に反論したと主張している。意外な反論を受けたある参謀は「必死尽忠の士が空を覆って進撃するとき、何者がこれをさえぎるか！ 第一線の少壮士官が何を言うか！」と怒鳴りつけた。特攻以外に何の策も持たない司令部に激高した美濃部は、抗命罪も覚悟のうえで「今の若い搭乗員のなかに、死を恐れる者は誰もおりません。ただ、一命を賭して国に殉ずるためには、それだけの目的と意義がいります。しかも、死にがいのある戦功をたてたいのは当然です。精神力一点ばかりの空念仏では、心から勇んで発つことはできません。同じ死ぬなら、確算のある手段を講じて頂きたい」、「私のところ（芙蓉部隊）では総飛行時間200時間の零戦パイロットでも皆夜間洋上進撃可能です。劣速の練習機が何千機進撃しようと、昼間ではバッタの如く落とされます」「2,000機の練習機を、（特攻に）狩り出す前に此処にいる古参パイロットが西から帝都に進入されたい、私が箱根上空で零戦で待ち受けます。一機でも進入出来ますか。艦隊司令部は、芙蓉部隊の若者達の必死の訓練を見て戴きたい」と反駁したと主張している。他に、「2,000機の練習機を特攻に狩り出す前に赤とんぼまで出して成算があるというなら、ここにいらっしゃる方々が、それに乗って攻撃してみるといいでしょう。私が零戦一機で全部、撃ち落として見せます」と反論したとする資料もある。