佐賀県の二級水系一覧では、佐賀県を流れる水系のうち、佐賀県が管理する二級水系を記述する。2005年（平成17年）3月現在、60水系、174河川ある。

リストの順序は、有明海沿岸を北東から南西へ、玄海灘沿岸を西から東へ、河口の位置を基準に並んでいる。島嶼部の河川は最下部に記載している。地形順の参考として一級水系（国土交通省管轄）も記載している。括弧内の水系名が一級水系。

水系名河川延長(km)流域面積(km2)河川数河口所在地備考 （筑後川） 143 2863 235福岡県柳川市、佐賀市一級水系 （嘉瀬川） 57 368 51佐賀市一級水系 福所江 3佐賀市、小城市 （六角川） 47 341 79小城市、白石町一級水系 福富川 1白石町 只江川 1白石町 廻里江川 3白石町 塩田川 24白石町、鹿島市 鹿島川 8鹿島市 石木津川 2鹿島市 浜川 3鹿島市 西葉川 1鹿島市さえがわ 母ヶ浦川 1鹿島市ほうがうらがわ 音成川 1鹿島市 黒木川 1鹿島市 嘉瀬の浦川 1鹿島市 龍宿浦川 1鹿島市やのうらがわ 飯田川 2鹿島市 江福川 1鹿島市 伊福川 1太良町 江岡川 1太良町 早垣川 1太良町 多良川 3太良町 嫁川 2太良町 糸岐川 3太良町 小田川 1太良町 破瀬ノ浦川 1太良町 休石川 1太良町いけすがわ 亀之浦川 1太良町 田古里川 1太良町 今里川 1太良町、諫早市 　 志佐川 4長崎県松浦市長崎県境へ流出。 佐代川 2伊万里市 楠久川 1伊万里市 後川 1伊万里市 里川 1伊万里市 脇野川 1伊万里市 有田川 24伊万里市 伊万里川 11伊万里市 木須川 1伊万里市 黒塩川 1伊万里市 拝川 1伊万里市 立川 1伊万里市 波多津川 2伊万里市 田野新田川 1唐津市 座川 2唐津市、玄海町そぞろがわ 有浦川 8玄海町 石田川 1玄海町 浜野浦川 1玄海町 八田川 1玄海町 志礼川 4玄海町 浦町川 1唐津市 野元川 1唐津市 潟川 3唐津市 江頭川 1唐津市 呼子川 1唐津市 橋本川 2唐津市 浦川 1唐津市 佐志川 2唐津市 （松浦川） 47 446 80唐津市一級水系 玉島川 18唐津市 那珂川 2福岡市中央区、博多区福岡県境へ流出。 　 大泊川 1唐津市加唐島 河内川 1唐津市馬渡島

関連項目 河川 二級水系 日本の川一覧

出典・参考文献 日外アソシエーツ編集発行　『河川大事典』　日外アソシエーツ、1991年（平成3年）。 佐賀県県土づくり本部河川砂防課編集発行　『佐賀県の河川』　佐賀県、2005年（平成17年）。