AFCユース選手権2006の予選は、2005年11月22日から2006年2月26日にかけて各地で開催された。
グループ1 開催地：クウェート、クウェート市 国名勝点試合勝分敗得失差6220030+33210142+20200216-5
2005年11月23日 0 - 2
2005年11月25日 4 - 1
2005年11月27日 1 - 0
グループ2 開催地：サウジアラビア、ダンマーム 国名勝点試合勝分敗得失差6220073+4321013300200226-4
2005年11月23日 3 - 1
2005年11月25日 2 - 4
2005年11月27日 2 - 0
グループ3 開催地UAE、ドバイ 国名勝点試合勝分敗得失差6220080+83210132+10200209-9
2005年11月23日 3 - 0
2005年11月25日 0 - 6
2005年11月27日 2 - 0
グループ4 開催地：ヨルダン、アンマン 国名勝点試合勝分敗得失差3210143+1321012203210134-1
2006年2月6日 4 - 1
2006年2月8日 2 - 0
2006年2月10日 2 - 0
グループ5 開催地：タジキスタン、ドゥシャンベ 国名勝点試合勝分敗得失差4211080+84211030+302002011-11
2005年11月23日 3 - 0
2005年11月25日 0 - 8
2005年11月27日 0 - 0
グループ6 国名勝点試合勝分敗得失差6220030+30200203-300000000 東ティモールは、棄権した。
開催地ネパール、カトマンズ 2005年11月22日 0 - 1
開催地キルギスタン、ビシュケク 2005年11月28日 2 - 0
グループ7 開催地：スリランカ、コロンボ 国名勝点試合勝分敗得失差6220070+73210125-30200215-4
2006年2月22日 3 - 0
2006年2月24日 1 - 2
2006年2月26日 0 - 4
グループ8 国名勝点試合勝分敗得失差6220070+70200207-700000000 アフガニスタンは、棄権した。
グループ9 国名勝点試合勝分敗得失差3210143+13210134-100000000 ブルネイは、棄権した。
グループ10 国名勝点試合勝分敗得失差6220051+41201124-21201113-2
グループ11 国名勝点試合勝分敗得失差4211052+34211021+10200215-4
グループ12 国名勝点試合勝分敗得失差62200261+253210139-602002019-19
グループ13 国名勝点試合勝分敗得失差62200150+153210145-102002317-14
グループ14 開催地：日本・熊本県 国名勝点試合勝分敗得失差6220060+63210151+402002010-10
AFCユース選手権2006出場国
20px日本
(開催国)