アポタンパク質（アポタンパクしつ、Apoprotein）は、タンパク質から、ある機能をもった部分を取り除いた残りの構造をいうIUPAC Gold Book - apoprotein。アポ (ἀπό) はギリシア語で「〜から離れる」を意味する接頭語。
アポタンパク質の例 以下の表は、アポタンパク質の一部を載せたものである。 +アポタンパク質の例因子機能アポA-IHDL粒子の主要構成要素アポA-II HDL粒子の構成要素アポA-VTG分解におけるLPLの補因子アポB-100LDL受容体リガンドアポB-48カイロミクロンの主要構成要素アポC-IILPLの補因子アポC-IIILPLを阻害アポELDL受容体リガンドアポ（a）Lp(a)の構成要素でありLDL様粒子に結合
脚注
関連項目 アポ酵素 - 酵素から補因子や金属を取り除いたタンパク質部分のこと。 アポリポタンパク質 - リポタンパク質から脂質を取り除いたタンパク質部分のこと。