モンテディオ山形（モンテディオやまがた、）は、日本の山形市、天童市、鶴岡市を中心とする山形県全県をホームタウンとする、日本プロサッカーリーグ（Jリーグ）に加盟するプロサッカークラブ。
概要 1984年創部のNEC山形サッカー部が前身となり、1999年よりJリーグへと加盟している。クラブ名称の「モンテディオ」は、イタリア語の「モンテ」（Monte、山）と「ディオ」（Dio、神）を合わせた造語で「山の神」を意味する。
ホームスタジアムはNDソフトスタジアム山形、練習場は山形県総合運動公園（詳細は#スタジアム・練習場を参照）。
運営法人は株式会社モンテディオ山形（2013年8月設立）。なお、2013年度までトップチームを運営していた公益社団法人山形県スポーツ振興21世紀協会はユースなどのアカデミーの運営を行っていたが（詳細は#運営法人の株式会社化を参照）、2026年1月末で解散し、以後は一般社団法人モンテディオ山形スポーツクラブ（2025年12月設立）がアカデミー等の運営を引き継いでいる公益社団法人山形県スポーツ振興21世紀協会の事業譲渡及び解散について - モンテディオ山形スポーツクラブ・2026年1月29日。
チームの歴史 前史
1984年に創部された山形日本電気のサッカー同好会が前身。1990年から1993年まで東北社会人サッカーリーグを4連覇、1994年よりジャパンフットボールリーグ（JFL）へ昇格。
1996年にチーム名をモンテディオ山形へ変更。1998年2月に運営法人となる山形県スポーツ振興21世紀協会が設立された。1999年からのJリーグの2部制開始とともにJリーグ ディビジョン2（J2）に参加した。
1999年 - 2008年（J2） 1999年
前平塚監督の植木繁晴が監督に就任した。
補強面では、市原から鷲田雅一を、平塚から岩元洋成を、京都から吉田達磨を、C大阪から卜部太郎を、ブラジルのリオ・クラロFCからアランを、川崎からムタイルを、札幌からバウテルを完全移籍で獲得し、横浜FMから平間智和をレンタル移籍で獲得した。新人では、鶴商学園高から根本亮助、前橋育英高から小久保純、静岡学園高から飯塚浩記が加入した。
リーグ戦については、第23節終了時までは中位付近を推移していたが、第24節から第29節にかけて5勝1分をマークし4位まで浮上した。しかし、残り7試合を勝利無しで終えた為、順位を落としてシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は15勝4分17敗の勝点48で7位だった。ヤマザキナビスコカップでは1回戦で京都に敗れた（合計スコア1-9）。天皇杯ではJ1勢の神戸、C大阪を続けて破った後、準々決勝で柏に敗れたものの、クラブ初の天皇杯ベスト8進出を果たした。
このシーズンは真下佐登史が得点源として活躍。最終的には18ゴールを挙げてJ2得点ランキング2位となった。
2000年 植木体制2年目。
庄司孝が大分に、卜部太郎がオーストラリアのに、が東北1部のTDK SCに完全移籍し、平間智和がレンタル元に復帰した。また、アラン、バウテル、ムタイル、本街直樹、原田紘介、飯塚浩記が退団した。
補強面では、大分からエドウィンを、甲府から堀井岳也を、湘南から西山哲平を完全移籍で、ブラジルのアシスナイコフFCからジェフェルソンを、横浜FMから丸山良明をレンタル移籍で獲得した。新人では、中央大から小田島隆幸、帝京大から依田光正、第一経済大から岡村政幸、日大山形高から笠原信、各務原高から松田英樹、イタリアのデボルティボ・イタリアーノユースから中山夢歩が加入し、ユース所属の白井貞義がトップチームに昇格した。
シーズン途中には、元福岡の永井篤志を完全移籍で、ブラジルのサンパウロFCからワシントン（en）をレンタル移籍で獲得した。
リーグ戦については、4連敗以上の大きな連敗を4回繰り返すなど、全体的に精彩を欠いたシーズンとなり低迷したままシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は11勝2分27敗の勝点33で10位だった。しかし、同年にJ1昇格を決めた浦和と第11節で対戦した際にJ2初黒星をつけ、第40節にも2-1で勝利するなど、上位陣を苦しめる場面を作った。ヤマザキナビスコカップでは1回戦で広島に敗れた（合計スコア1-3）。天皇杯は2回戦でJFLのジヤトコに敗れた。
シーズン終了後、植木が契約満了で監督を退任した。
2001年 元サッカー日本代表の柱谷幸一が監督に就任した。
真下佐登史が関東の図南SCに、中森大介がJFLのジヤトコに、岡村政幸が佐川急便東京SCに完全移籍し、丸山良明がレンタル元に復帰した。また、エドウィン、ワシントン、ジェフェルソン、岩元洋成、中山夢歩、白井貞義が退団した。
補強面では、大宮から佐藤悠介、浮氣哲郎、佐藤太一を、京都から大島秀夫を、湘南から鈴木健太郎を、水戸から渡辺卓を、札幌から大野貴史を、浦和から高橋厳一を完全移籍で獲得し、札幌から佐賀一平をレンタル移籍で獲得した。新人では、山形中央高から吉見一星が加入した。
シーズン途中には、堀井岳也が札幌へレンタル移籍した。
リーグ戦については、第19節終了時までは7勝5分7敗の8位と振るわなかったが、第20節〜第43節終了時までに20勝1分3敗と快進撃を見せ2位まで浮上。山形を含む最大6チームがJ1昇格に絡む大混戦となったが、京都が第43節の湘南戦に勝利し、J1昇格圏内の1位を確定させた為、最終節にJ1昇格圏内の2位を山形、仙台、大分の3チームが勝ち点差3という接戦の中で争うことになった。暫定2位の山形は川崎に対し、90分以内で勝利することが出来れば2位が確定していたが、試合は0-0のまま90分間が終了し、Vゴール方式の延長戦に突入した為、暫定3位である仙台の対戦経過次第となった。仙台は後半ロスタイムに決勝点を挙げて京都に勝利した。この結果、仙台の2位が確定した為、山形はJ1昇格を逃した。その後、山形は延長戦の開始直後に失点して試合にも敗れた。リーグ戦の最終成績は27勝6分11敗の勝点80で3位だった。ヤマザキナビスコカップでは1回戦で浦和に敗れた（合計スコア2-3）。天皇杯は3回戦で神戸に敗れた。
2002年 柱谷体制2年目。
浮氣哲郎、西山哲平が大分に、高橋厳一、笠原信がJFLのジヤトコに、吉田達磨がシンガポールのに、佐藤太一がシンガポールのクレメンティ・カルサFCに、小田島隆幸が群馬県1部の草津に、斉藤誠一が佐川印刷に完全移籍し、佐藤淳志が退団した。また、札幌にレンタル移籍していた堀井岳也が完全移籍への移行に伴い退団した。
補強面では、湘南から酒井良、貞富信宏を、浦和から小島徹を、市原から井上雄幾を完全移籍で獲得した。更に、佐賀一平がレンタル移籍から完全移籍に移行した。新人では、駒澤大から桜井繁、順天堂大から藤田芳正、国士舘大から松田和之が加入し、ユース所属の秋葉勝がトップチームに昇格した。
シーズン途中には、ドイツ3部のSVヴァッカー・ブルクハウゼンから西脇良平を完全移籍で獲得した。
リーグ戦については、開幕戦から4連敗を喫し最下位からのスタートとなった。その後も勝ち星を重ねることが出来ずに低迷を引きずったままシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は6勝17分21敗の勝点33で11位だった。天皇杯は1回戦で関東の群馬FCホリコシに敗れた。
2003年 柱谷体制3年目。
佐藤悠介がC大阪に、鈴木健太郎が東京Vに、吉見一星が佐川印刷に、佐賀一平、酒井良、貞富信宏が九州の沖縄かりゆしFCに、西脇良平、大野貴史、松田英樹が東海1部の静岡FCに完全移籍し、小島徹が退団した。また、渡辺卓が現役を退いてユースチームの監督に就任した。その他では、根本亮助と斉藤武志が、ブラジルのに留学する為、1月から6月までチームを離脱した。
補強面では、鹿島から中村幸聖を、FC東京から星大輔、松田正俊を、C大阪から川崎健太郎、羽地登志晃、越智隼人を、G大阪から阿江孝一を、札幌から古川毅を、大宮から伊東真吾を完全移籍で、ブラジルのマルトロンからニヴァウドをレンタル移籍で獲得した。また、ブラジルのオリンピアFC）からアレッシャンドレをレンタル移籍で獲得したが、シーズン途中で退団している。新人では、帝京高から大瀧直也が加入した。
シーズン途中には、市原から小林久晃をレンタル移籍で獲得した。
リーグ戦については、開幕6試合で1分5敗と最下位スタートとなったが、第7節から勝ち星が付き始めて、第24節終了時には4位まで浮上した。しかし、その直後から連敗を重ねるようになり失速。そのままシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は15勝10分19敗の勝点55で8位だった。天皇杯は3回戦で神戸に敗れた。
シーズン終了後、柱谷が契約満了で監督を退任した。
2004年 JFAナショナルトレセンコーチを務めていた鈴木淳が監督に就任した。
鷲田雅一、羽地登志晃が市原に、依田光正、小久保純がJFLの草津に完全移籍し、ニヴァウド、藤田芳正、伊東真吾、松田和之が退団した。また、斉藤武志が現役を退いてクラブ下部組織の育成普及コーチに就任した。
補強面では、大宮から大塚真司を、川崎から林晃平を完全移籍で獲得。小林久晃がレンタル移籍から完全移籍に移行した。また、ブラジルのグアラニFCからレオナルドを、FC東京から迫井深也をレンタル移籍で獲得した。その他では、ブラジルのECサント・アンドレからデーニをレンタル移籍で獲得したが、シーズン途中で退団している。新人では、東海大山形高から堀内大輔、鶴岡東高から井関武志が加入した。
シーズン途中には、新潟から宮沢克行を、浦和から梅田直哉をレンタル移籍で獲得した。
リーグ戦については、第11節終了時点で5勝5分1敗の2位につけるなど幸先の良いスタートを切ったものの、主力選手の怪我などが響いて停滞し、第30節終了時に6位まで順位を下げた。しかし上位進出を目指して、シーズン途中に宮沢らを獲得した結果、第29節から7勝2分と快進撃を見せ3位まで再浮上した。しかし、2位の大宮との直接対決に敗れた為、J1自動昇格圏内に入るまでには至らなかった。その後、J1・J2入れ替え戦の出場権が得られる3位を福岡、京都と争ったが、最終節で3位の福岡との直接対決に敗れた為、J1・J2入れ替え戦進出を逃しシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は19勝14分11敗の勝点71で4位だった。天皇杯は4回戦で横浜FMに敗れた。
このシーズンは、大島秀夫が得点を量産し活躍。22得点を挙げてJ2得点ランキング2位（日本人選手では1位）となった。また、勝点105をマークするなど、圧倒的な強さでJ2を制した川崎に対して2勝1分1敗と、当時J2に所属していたチームの中で唯一勝ち越した。
シーズン終了後、NEC山形時代からゴールマウスを守り続けてきた、地元出身選手の鈴木克美が現役引退を表明した。
2005年 クラブスローガン：INNOVATION 我々が変わり、そして変えていく 鈴木体制2年目。
昨シーズンにJ2得点ランキング2位となった大島秀夫が横浜FMに、星大輔、松田正俊が京都に、中村幸聖が新潟に、井上雄幾が甲府に、大瀧直也が東北1部の盛岡に完全移籍し、宮沢克行、梅田直哉、迫井深也がレンタル元に復帰。古川毅、越智隼人が退団した。
補強面では、横浜FMから小原章吾、本橋卓巳を、横浜FCから臼井幸平を、広島から外池大亮を完全移籍で獲得。また、レオナルドがレンタル移籍から完全移籍に移行した。更に、横浜FMから阿部祐大朗を、広島から高木和正を、鹿島から田中康平を、名古屋から原竜太をレンタル移籍で獲得した。原はシーズン途中に完全移籍へ移行している。その他では、ブラジル2部のアヴァイFCからチッコ をレンタル移籍で獲得したが、シーズン途中で退団している。新人では、大阪学院大から佐々木勇人が加入。開幕戦で先発メンバーに抜擢されるや否や、1ゴール2アシストを記録するなど、加入初年度から即戦力として活躍した。
シーズン途中には、柏から清水健太を、大分から小森田友明をレンタル移籍で獲得し、山形大の塩沢勝吾を特別指定選手として追加登録した。
リーグ戦については、非常に高い守備力を誇り、第36節終了時点で失点数が34点と、京都の33点に次いで2番目に少ない記録だった反面、得点力不足が影響して勝ち切れずに引き分ける試合が多かったことから、自動昇格圏内の京都と福岡に追い付くことが出来ずに3位〜4位を推移した。その後、J1・J2入れ替え戦の出場権が得られる3位を札幌、仙台、甲府と争ったが、第37節から4連敗を喫し脱落した。リーグ戦の最終成績は16勝16分12敗の勝点64で5位だった。天皇杯は4回戦で浦和に敗れた。
シーズン終了後、鈴木が契約満了で監督を退任。新潟の監督に就任した。
2006年
クラブスローガン：CONCENTRATION 集中 横浜FMでトップチームコーチを務めた樋口靖洋が監督に就任した。
この年からサテライトリーグへの参加を開始した（2009年に廃止。2010年以降はみやぎチャレンジリーグに参加）。
大塚真司、川崎健太郎が札幌に、小林久晃が神戸に、田中康平が仙台に、外池大亮が湘南に、高木和正が東海1部の岐阜に、堀内大輔が東北1部の盛岡に完全移籍。また、阿江孝一、井関武志、塩沢勝吾が退団し、小森田友明がレンタル元に復帰した。
補強面では、仙台の看板選手として活躍した財前宣之を、福岡から木藤健太を、川崎から渡辺匠、木村誠を、鳥栖から氏原良二、高林佑樹を完全移籍で獲得。更に、昨シーズン大宮でプレーしたレアンドロを）からレンタル移籍で獲得した。新人では、四日市中央工高から坂井将吾、向上高から鈴木雄太、駒澤大から鈴木亮平、羽黒高からドグラス、韓国の白岩高からイ・ジョンミンが加入した。
シーズン途中には、新潟から2004年に山形でプレーした宮沢克行を、FC東京から前田和也を完全移籍で獲得した。
リーグ戦については、第8節まで勝利することが出来ず最下位に沈んだ為、試合後に不満を抱えた一部の山形サポーターが監督の樋口や、専務理事兼ゼネラルマネージャーの金村勲（当時）に対して引責辞任を求める座り込みの抗議行動まで起こったが、第9節徳島戦で初勝利を挙げた後、第15節から4連勝、第25節から3連勝を達成した結果、順位が6位まで浮上した。しかし、守備に安定感を欠いたことや、主力選手を怪我で欠くなどの影響が及び、最後までJ1昇格争いに加わることが出来ないままシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は17勝14分17敗の勝点65で8位だった。天皇杯は4回戦で甲府に敗れた。
このシーズンは、レアンドロが得点を量産し活躍。23得点を挙げてJ2得点ランキング3位となった。
この年に経営陣の刷新が行われた。任期満了に伴い金森義弘が理事長をシーズン途中に退任。金村も連帯する形で退任した。後任には鹿島元専務の海保宣生が理事長に就任した。この刷新劇の前後に、金森が率いた前経営陣による「J1昇格争いをすれば観客動員が増え収入増になるはず」という強気な経営計画により約1億3000万円の負債を抱えた末に、その穴埋めとして『J1昇格準備金』として用意していた予算を大幅に取り崩していたことが判明し、内外にその厳しい台所事情を露呈した。その他では、3月23日に、日本サッカー協会参事で山形県米沢市出身の新藤一晴が常務理事に就任。12月20日に、財政難で選手補強や有望新人の獲得が難しい状況の中、スカウト部門の強化を図るべく、鹿島のスカウト担当部長だった平野勝哉を強化育成部アドバイザーとして招聘した。
11月28日に、長年に渡りチームを支えた高橋健二と、太田雅之が現役引退を表明。共にフロント入りした。
2007年 クラブスローガン：再創生 リスタート 樋口体制2年目。
昨シーズンに23得点を挙げるなど活躍したレアンドロが神戸に完全移籍した。また、永井篤志が仙台に、内山俊彦が神戸に、原竜太が湘南に、氏原良二が草津に、高林佑樹がJFLのTDK SCに、阿部祐大朗が北信越1部のフェルヴォローザ石川・白山FCに、ドグラスが九州のニューウェーブ北九州に完全移籍し、桜井繁が甲府にレンタル移籍。イ・ジョンミンが退団した。
補強面では、名古屋から北京五輪代表を目指すべく出場機会を求めていた豊田陽平を、鹿島から1999年FIFAワールドユース選手権の準優勝メンバーだった石川竜也をレンタル移籍で獲得。更に、横浜FCから北村知隆を、京都から1999年〜2003年まで山形に在籍していた鷲田雅一を、FC東京から遠藤大志を完全移籍で、浦和から横山拓也をレンタル移籍で獲得した。また、清水健太がレンタル移籍から完全移籍に移行した。新人では、順天堂大から佐藤健太郎、中央大から園田拓也、富山第一高から高橋駿太が加入した。
シーズン途中には、群馬県1部の図南SCから須田興輔を、ブラジル2部のASAからグスタヴォを完全移籍で獲得した。
リーグ戦については、序盤は首位に立ったものの、怪我人の続出を補いきれない選手層の薄さと、深刻な得点力不足から急速にチームは失速。その後も浮上すること無く、第45節愛媛戦に敗れたことでJ1昇格の可能性が消滅。そのままシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は15勝13分20敗の勝点58で9位だった。天皇杯は4回戦でG大阪と対戦したが、PK戦で敗れた。
シーズン終了後、樋口が契約満了で監督を退任。コーチの島根聡一、GKコーチの南省吾も退任した。
11月30日には、主力フォワードの一員として山形の攻撃陣を牽引した林晃平が現役引退を表明した。
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2008年 クラブスローガン：BE MOVING! C大阪元監督の小林伸二が監督に就任した。
チームの看板選手として活躍した佐々木勇人がG大阪に、臼井幸平が湘南に、前田和也が関東1部の日立栃木UVAに、鷲田雅一がJFLの栃木SCに、鈴木亮平が北信越1部の松本山雅に、横山拓也が愛媛に完全移籍し、グスタヴォ、須田興輔が退団した。
補強面では、柏から長谷川悠を、C大阪から宮本卓也を、FC東京からリチェーリをレンタル移籍で、福岡から宮崎光平、内藤友康を完全移籍で獲得。新人では、明治大から石井秀典、市立船橋高から山田拓巳、柏レイソルU-18から太田徹郎、前橋育英高から廣瀬智靖が加入した。
シーズン途中には、千葉から馬場憂太をレンタル移籍で獲得した。
リーグ戦については、第14節終了時は7位だったが、次第に組織的な守備をベースとした戦術が浸透し、少ない得点で勝ち切る試合が増えていった。また、北京五輪日本代表に選ばれた豊田陽平や、加入後にストライカーとして才能を開花させた長谷川を中心とした若手選手の活躍により、仙台とのみちのくダービーでは9年振りに勝ち越すなど、シーズン中盤からはJ1自動昇格圏内の2位をキープし、11月30日第44節の愛媛戦（右図）で勝利を収めて2位が確定。翌12月1日のJリーグ臨時理事会でJ1昇格が承認された。リーグ戦の最終成績は23勝9分10敗の勝点78で2位だった。天皇杯は4回戦で川崎に敗れた。
シーズン終了後、根本亮助が現役引退を表明。Jrユース庄内コーチに就任した。
2009年 - 2011年（J1） 200px 2009年 クラブスローガン：J1出陣。 クラブ史上初となるJ1リーグ1年目のシーズンを迎え、小林体制2年目がスタートした。
2トップの一角としてJ1昇格に貢献した豊田陽平が京都に、本橋卓巳が栃木SCに、高橋駿太が関東1部の日立栃木UVAに、内藤友康が東北1部の福島ユナイテッドFCに、昨シーズンまで甲府にレンタル移籍していた桜井繁が仙台に完全移籍し、リチェーリ、馬場憂太が退団した。
補強面では、C大阪から古橋達弥を、ポルトガル1部のセトゥーバルからキム・ビョンスクを完全移籍で、川崎から植草裕樹、柏から小林亮をレンタル移籍で獲得。更に、石川竜也、宮本卓也がレンタル移籍から完全移籍に移行した。また、ブラジル1部のクルゼイロからジャジャを、ブラジル2部のSEガマからアンドレ・シルバをレンタル移籍で獲得したが、出場機会を得られないままシーズン途中で退団している。新人では、山形FCユースから栗原祐樹が加入。ユース所属の佐藤永志がトップチームに昇格した。
シーズン途中には、浦和から赤星貴文を、広島から西河翔吾を、ブラジル1部のアトレチコ・パラナエンセからファグネルをレンタル移籍で獲得した。
リーグ戦については、開幕戦で磐田と対戦。チーム記録となる6得点を奪いJ1初勝利を収めた（スコア6-2）。その後は、怪我人が続出するなど戦力が維持出来なくなり、第16節終了時点でJ2降格圏内の16位まで順位を下げた。この苦境を打破するべく西河らをレンタル移籍で獲得。これが功を奏し、第30節終了時点で15位とJ1残留圏内まで浮上し、16位の柏との勝点差を10に広げた。しかし、第31節鹿島戦（スコア0-2）では、Jリーグ史上初となるシュート数0本を記録するなど、終盤に近づくにつれ精彩を欠いていった。11月28日の第33節名古屋戦においても敗れたが（スコア0-2）、柏が大宮戦名古屋戦終了の約1時間後にキックオフ。 にて引き分けた為、残り1試合で勝ち点差が4となり、順位が降格圏まで下がる可能性が無くなったことから、J1残留が確定した。リーグ戦の最終成績は10勝9分15敗の勝点39で15位だった。ヤマザキナビスコカップは2勝1分3敗の5位で予選リーグ敗退。 天皇杯は3回戦で明治大学に敗れ（スコア0-3）、日本サッカー史上初となる、公式戦でJ1クラブが大学チームに敗れる波乱となった。
この年のJリーグアウォーズにおいて、J1フェアプレー賞を獲得した。
2010年 クラブスローガン：前へ! 小林体制3年目。
クラブの経営力向上に尽力した理事長の海保宣生が健康上の理由により3月末をもって退任。後任として山形県サッカー協会専務理事の川越進が就任した。また、強化育成部アドバイザーの平野勝哉も1月末をもって退任した。
財前宣之がタイ・プレミアリーグのムアントン・ユナイテッドに、小原章吾が愛媛に、渡辺匠が熊本に、木村誠がJFLの金沢に、木藤健太が九州の三菱重工長崎SCに、遠藤大志がJFLのソニー仙台に完全移籍した。また、長年に渡り守備の要として活躍したレオナルドと、赤星貴文、坂井将吾、ファグネルが退団した。
補強面では、懸案であった攻撃陣の弱さを補うべく、鹿島から田代有三、増田誓志をレンタル移籍で獲得した。また、千葉から戦力外通告を受けてトライアウトに参加していた下村東美を、城南一和から元U-23韓国代表ハン・ドンウォンを完全移籍で、横浜FMからキム・クナンをレンタル移籍で獲得。更に、2008年・2009年のチーム得点王である長谷川悠と、昨シーズン途中加入し残留に大きく貢献した西河翔吾がレンタル移籍から完全移籍に移行した。新人では、国士舘大から伊東俊、浦和ユースから中村隼、高知大から中野圭が加入した。
シーズン途中には、C大阪から前田和哉を完全移籍で獲得した。
リーグ戦については、開幕から4試合連続未勝利でスタートしたが、第5節広島戦で初勝利を挙げた後、第12節終了時点で4勝2分6敗の13位でワールドカップに伴うリーグ中断期間を迎えた。リーグ再開後、ヤマザキナビスコカップから機能し始めた4-3-3システムが功を奏し、J1では初めての開催となるみちのくダービーでの勝利（スコア3-1）を皮切りに、浦和やG大阪、横浜FMといった強豪相手にも勝利を収めるなど、徐々に勝ち点を積み上げてJ1残留圏内を維持した。その後、第32節の京都戦に勝利してJ1残留を決めた。リーグ戦の最終成績は11勝9分14敗の勝点42で13位だった。ヤマザキナビスコカップは3勝1分2敗の3位で予選リーグ敗退。天皇杯は準々決勝で清水と対戦したが、PK戦で敗れた。
シーズン終了後、ヘッドコーチの長島裕明がFC東京のトップチームコーチに就任する理由で退団した。
この年のJリーグアウォーズにおいて、J1フェアプレー賞を2年連続で獲得した。
2011年 クラブスローガン：「粘強」NEZZUGU 小林体制4年目。
田代有三、増田誓志、キム・クナンがレンタル元に復帰し、キム・ビョンソク、ハン・ドンウォン、佐藤永志、栗原祐樹が退団した。
補強面では、鹿島から船山祐二、福岡から大久保哲哉、サンパウロ州リーグ1部（ブラジル）のリオ・クラロFCからマイコン、元東京Vのエルサムニー・オサマを完全移籍で獲得。鹿島から川島大地をレンタル移籍で獲得した。また、植草裕樹、小林亮がレンタル移籍から完全移籍に移行した。その他では、ルーマニア1部のCFRクルジュからウーゴを完全移籍で獲得したが、同年4月10日に「家庭の事情」により退団した。
シーズン途中には、広島から山崎雅人をレンタル移籍で獲得した。
リーグ戦については、開幕戦で川崎に敗れた6日後に東日本大震災が発生。リーグ戦は1ヶ月以上中断した。この間、震災後のインフラ被害や物資不足などの影響で満足にトレーニングを行うことが出来なかった為、リーグ戦を戦い抜く体力が培われず怪我人が続出した。更に、昨シーズンまでの守備偏重の戦術から、ショートカウンターで高い位置からボールを奪うことと、攻撃でポゼッション率を高める戦術に変えて試合に臨んだが成績は低迷し、第20節終了時点でJ2降格圏内の17位に沈んだ。その後、シーズン途中に山崎を獲得して巻き返しを図ったが、崩壊した守備を立て直すことが出来ずに黒星を重ねた。そして、11月3日の第31節神戸戦に敗れてJ2降格圏の16位以下が確定。残り3節を残してJ2降格が決定した。その後、第32節福岡戦でも敗れて最下位に転落。そのままシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は5勝6分23敗の勝点21で18位だった。ヤマザキナビスコカップは1回戦で浦和に敗れた（合計スコア1-4）。天皇杯は3回戦でJ2勢の京都に敗れた。
シーズン終了後に小林伸二が任期満了で監督を退任した。理事長の川越も任期満了を待たずに辞任し、副理事長の高橋節が2012年3月末まで理事長代行を務めることになった。(2012年4月1日より理事長に就任)
この年のJリーグアウォーズにおいて、J1フェアプレー賞を3年連続で獲得した。
2012年 - 2014年（J2） 2012年 クラブスローガン：「連」 連動・連携・連結 元鹿島トップチームコーチの奥野僚右が監督に就任した。
長谷川悠が大宮に、古橋達弥、下村東美が湘南に、佐藤健太郎が千葉に、宮崎光平が徳島に、園田拓也が愛媛に、大久保哲哉が横浜FCに、植草裕樹が神戸に完全移籍し、マイコン、エルサムニー・オサマが退団した。
補強面では、山崎雅人がレンタル移籍から完全移籍に移行し、鳥栖から永田亮太、同じく鳥栖から昨シーズン草津でプレーしていた萬代宏樹を完全移籍で、仙台から中島裕希、清水から岡根直哉、柏から昨シーズンJFLの秋田でプレーしていた比嘉厚平をレンタル移籍で獲得した。新人では、明治大学から宮阪政樹、慶應義塾大から日高慶太が加入した。宮阪は2009年天皇杯3回戦で山形を破った明治大学イレブンの一人だった。
シーズン途中には、柏から林陵平、C大阪からブランキーニョをレンタル移籍で獲得し、伊東俊が愛媛へレンタル移籍した。
リーグ戦については、開幕戦で千葉に敗れたが、第2節から3連勝を達成し、第6節から11試合連続負け無しの成績を収めるなど、第13節、第17節、第18節、第21節終了時にそれぞれ首位に立った。しかし、後半戦初戦となる第22節栃木SC戦で敗れ4位に後退。その後はJ1昇格プレーオフ進出圏内となる6位前後を維持し、第32節終了時には4位まで順位を戻したものの、第33節鳥取戦から3連敗を喫するなど、最終10試合の成績は1勝2分7敗と失速。そのまま浮上すること無くシーズンを終えた。リーグ戦の最終成績は16勝13分13敗の勝点61で10位だった。天皇杯は3回戦でC大阪に敗れた。
6月3日の第17節鳥取戦で、3人の途中交代を含めた出場フィールドプレイヤー13人全員がシュートを記録した（シュート数27本、スコア5-1）。
前年度までキャプテンを務め、クラブ初のJ1昇格に貢献した宮沢克行が、11月8日に現役引退を表明した。
2013年 クラブスローガン：「信」 shin 進化 深化 神化 奥野体制2年目。コーチ陣が一新され、川崎や町田の監督を歴任した相馬直樹がヘッドコーチに就任した。