第29回目となる1999年のカンピオナート・ブラジレイロ・セリエAは、コリンチャンスが優勝した。得点王はアトレチコ-MGのギリェルメ（28ゴール）だった。
第1フェーズ 順位クラブ試合勝分敗得失勝点備考 1 コリンチャンス 21 14 2 5 49 31 44 準々決勝進出 2 クルゼイロ 21 12 6 3 46 32 42 準々決勝進出 3 ヴァスコ・ダ・ガマ 21 10 6 5 33 23 36 準々決勝進出 4 ポンチ・プレッタ 21 10 5 6 23 16 35 準々決勝進出 5 サンパウロ 21 11 1 9 35 24 34 準々決勝進出 6 ヴィトーリア 21 10 4 7 31 33 34 準々決勝進出 7 アトレチコ-MG 21 10 3 8 39 30 33 準々決勝進出 8 グアラニ 21 10 3 8 31 22 33 準々決勝進出 9 アトレチコ-PR 21 9 4 8 36 31 31 10 パルメイラス 21 8 7 6 36 23 31 11 サントス 21 8 6 7 25 26 30 12 フラメンゴ 21 9 2 10 30 33 29 13 コリチーバ 21 7 8 6 31 29 29 14 ボタフォゴ-RJ 21 8 2 11 23 37 26 15 ガマ 21 7 5 9 24 29 26 降格 16 インテルナシオナル 21 7 3 11 18 26 24 17 パラナ 21 6 6 9 23 29 24 降格 18 グレミオ 21 6 4 11 24 43 22 19 ジュベントゥージ 21 5 7 9 18 32 22 降格 20 ボタフォゴ-SP 21 5 6 10 27 38 21 降格 21 ポルトゥゲーザ 21 4 6 11 27 31 18 22 スポルチ 21 3 8 10 14 25 17
準々決勝 コリンチャンス 0-0 ; 2-0 ; 1-1 グアラニ クルゼイロ 2-4 ; 2-3 アトレチコ-MG ヴァスコ・ダ・ガマ 4-5 ; 2-2 ; 1-1 ヴィトーリア ポンチ・プレッタ 2-3 ; 2-1 ; 2-3 サンパウロ
準決勝 コリンチャンス 3-2 ; 2-1 サンパウロ ヴィトーリア 0-3 ; 2-1 ; 0-3 アトレチコ-MG
決勝 コリンチャンス 2-3 ; 2-0 ; 0-0 アトレチコ-MG コリンチャンスが優勝。
降格 この年より過去2シーズンの平均成績によって降格チームが決まる新降格システムが導入された。平均勝点は前シーズンの勝ち点を23（試合数）で割った数に、このシーズンの勝ち点を21（試合数）で割った数を足し、それを2で割って算出される。前シーズンに参加していないチームは、このシーズンの成績のみを対象とする。
サンパウロが起用していたサンドロ・ヒロシが出場資格を有しない選手（年齢詐称）であることが判明したため、スポーツ裁判所は8月4日のボタフォゴ-RJ戦（6-1でサンパウロの勝利）および10月10日のインテルナシオナル戦（2-2で引き分け）の試合結果を取り消し、サンパウロとの対戦相手チームの1-0の勝利とする判決を下した。これは“サンドロ・ヒロシ事件” (Caso Sandro Hiroshi) と呼ばれる。
もしもサンパウロに関係する2試合の試合結果が変更されていなければ降格チームはボタフォゴ-RJ、パラナ、ジュベントゥージ、ボタフォゴ-SPになっていたため、ガマはこの降格に抗議した。一般裁判所はガマの訴えを認め、それが2000年のカンピオナート・ブラジレイロの中止およびその代替大会としてのコパ・ジョアン・アヴェランジェ開催へと繋がっていく。
順位 クラブ 1998勝点 1999勝点 平均勝点 17 インテルナシオナル 32 24 1.267 18 ボタフォゴ-RJ 29 26 1.249 19 ガマ - 26 1.238 20 パラナ 24 26 1.141 21 ジュベントゥージ 26 22 1.089 22 ボタフォゴ-SP - 21 1.000
参考文献 RSSSF Brasil