2012-13年シーズンのFリーグは、リーグ戦が2012年6月30日に開幕、翌2013年1月27日まで行われ、プレーオフが同年2月1日から10日まで行われた。優勝は名古屋オーシャンズ。
2012-13年シーズンのFリーグ参加クラブ 参加クラブは以下の通りである。 エスポラーダ北海道 バルドラール浦安 府中アスレティックFC ペスカドーラ町田 湘南ベルマーレ アグレミーナ浜松（新規参入） 名古屋オーシャンズ シュライカー大阪 デウソン神戸 バサジィ大分 ※このシーズンより浜松が参加。
レギュレーション 今回からレギュラーシーズン（1シーズン制）と、その上位3チームによるプレーオフ（決勝トーナメント）の2段階制を採用した。
レギュラーシーズンは平年同様に各チーム3回戦総当り方式（ホーム・アンド・アウェーおよびセントラル開催）を採用。勝ち点制度で争われ勝ちが3点、引分が1点、負けは0点。この勝ち点の上位3位までに入ったチーム（同勝ち点は得失点差、総得点、直接対決の成績、さらには抽選により順位決定）がプレーオフ（正式名称：Ｆリーグ2012-13 powered by ウイダーinゼリー Charge→Go プレーオフ ）に進出する。
なおセントラル開催（リーグ主管の集結戦）は前年度より多く組まれており、国立代々木競技場第1体育館（渋谷区 第1・2節）とべっぷアリーナ（別府市 第10・11節）、大田区総合体育館（大田区 第19・20節）で各2連戦の6節分が割り当てられ、事実上「ホーム&アウェー&セントラル」の方式で行われた。
プレーオフはパラマストーナメントで開催され、レギュラーシーズン2位対同3位がまず1st Roundを戦い2勝したほうがFinal Roundに進む。Finai Roundはこの勝者と同1位が戦い、3勝（1位はアドバンテージ1勝を含む）した方が総合優勝となる。
リーグ戦結果
順位クラブ名試合勝点勝利引分敗戦得点失点得失備考1名古屋オーシャンズ2775243014253+89プレーオフ進出2シュライカー大阪275316569158+33プレーオフ進出3府中アスレティックFC2747152107865+13プレーオフ進出4バルドラール浦安274413598567+185デウソン神戸274212698064+166エスポラーダ北海道274011797688-127バサジィ大分2734104136263-18ペスカドーラ町田272567146688-229湘南ベルマーレ2714351972114-4210アグレミーナ浜松278222345137-92
プレーオフ結果
☆・★=1位クラブ（名古屋オーシャンズ）に対するアドバンテージの1勝・1敗分
1st Round シュライカー大阪（2位）対府中アスレティックFC（3位）会場：テバオーシャンアリーナ
Final Round 名古屋オーシャンズ（1位）対シュライカー大阪 会場：テバオーシャンアリーナ
得点ランキング 順位 選手名 チーム名 得点 1 森岡薫 名古屋オーシャンズ 34 2 リカルジーニョ 名古屋オーシャンズ 33 3 ヴィニシウス シュライカー大阪 31 4 水上玄太 エスポラーダ北海道 27 5 ボラ ペスカドーラ町田 25 6 山田ラファエルユウゴ 府中アスレティック 20 7 稲葉洸太郎 バルドラール浦安 17 8 ラファエル・サカイ 名古屋オーシャンズ 14 逸見勝利ラファエル 名古屋オーシャンズ ロドリゴ 府中アスレティック
脚注
関連項目 2012年のスポーツ