沖縄県の二級水系一覧では、沖縄県を流れる水系のうち、沖縄県が管理する二級水系を記述二級河川指定一覧表（沖縄県土木建築部 河川課）する。2015年現在51水系、75河川ある。
リストの順序は北端の国頭村から反時計回り・島嶼部の順に、河口の位置を基準にして並んでいる。なお沖縄県には一級水系は存在しない。
水系名延長(km)流域面積(km2)河川数河口所在地備考 安波川 42.09 3国頭村 奥川 10.88 1国頭村 座津武川 4.3 1国頭村ざつんがわ 辺野喜川 13.18 1国頭村べのきがわ 与那川 11.99 1国頭村 比地川 18.81 2国頭村 田嘉里川 8.91 1国頭村・大宜味村 大保川 23.64 1大宜味村 源河川 19.96 1名護市 真喜屋大川 5.0 1名護市 羽地大川 14.79 3名護市 我部祖河川 13.66 1名護市かぶそががわ 大井川 22.9 1今帰仁村 満名川 12.37 1本部町 屋部川 20.09 2名護市 幸地川 4.2 1名護市 轟川 3.63 1名護市 真謝川 5.34 1名護市 名嘉真川 3.27 1恩納村 比謝川 49.66 2読谷村・嘉手納町 白比川 8.20 1北谷町しるひがわ 普天間川 8.9 1宜野湾市 牧港川 15.17 2浦添市 小湾川 4.83 1浦添市 安謝川 8.10 1浦添市・那覇市 安里川 8.57 4那覇市 国場川 43.06 3那覇市 報得川 18.66 1糸満市むくえがわ 雄樋川 13.74 1八重瀬町・南城市ゆひがわ小波津川 3.76 1西原町 天願川 31.61 2うるま市 石川川 10.31 1うるま市 億首川 10.4 2金武町 漢那福地川 9.0 1宜野座村 汀間川 12.65 1名護市ていまがわ 有銘川 3.33 1東村あるめがわ 福地川 36.00 6東村 新川川 11.31 1東村あらかわがわ 中の川 2.62 3伊平屋村伊平屋島 渡嘉敷川 3.34 1渡嘉敷村渡嘉敷島 内川 0.8 1座間味村座間味島 儀間川 5.3 1久米島町久米島 謝名堂川 3.00 1久米島町久米島・じゃなどうがわ 宮良川 35.4 2石垣市石垣島 名蔵川 16.14 2石垣市石垣島 石垣新川川 10.96 1石垣市石垣島 浦内川 54.24 1竹富町西表島 仲良川 23.85 1竹富町西表島 越良川 18.21 1竹富町西表島・くいらがわ 仲間川 28.41 1竹富町西表島 田原川 7.10 1与那国町与那国島・たばるがわ
脚注
関連項目 河川 二級水系 日本の川一覧
参考資料 沖縄の河川資料室（沖縄県土木建築部河川課）