南スーダンの郡（）は、州の下にある第二級行政区画である。郡は複数の（Payam、コミュニティと訳される場合もある）を束ねる。郡の代表（知事）はCounty commissionerと呼ばれている。
変遷
まだ南スーダンがスーダン共和国より分離する前、2008年の国勢調査では南部スーダンに78の郡（ アビエイを含めると79郡）が存在した。2008年以降アコカ郡が設置され、79郡となる。2011年に南部スーダンで独立を問う住民投票が実施された。住民投票はアビエイを除く10州79郡で行われ、どの州・郡でも独立賛成派が多数を占めた。その結果南スーダンは独立を達成し、この時にからと名称が変更された。独立後、一部の州で郡が再編された。
2015年10月、サルバ・キール・マヤルディ大統領は州の再編を発表。州は10から28へ増加することとなり、84の郡は新州へ分配された。また1つの郡が単独で州に昇格することもあった。再編後、多くの州で既存の郡は分割されていった。2016年4月の「新郡創設願い」では25州が合計217郡の設置を要求している（ただし一部の州では設置されず）。
2017年には28州の一部が変更され32州となり、郡も一部の所属が変更された。リストには郡は83と郡の増加がほとんど反映されていないがあくまでリスト上の話であり、ほかの報道によれば新たな郡も存続している。もっとも南スーダンは2013年より続く内戦によって内政は不安定であり、情報についても一部不明確なところがある。また2015年および2017年の州再編については南スーダン政府と反政府勢力の主張が異なっており、政府が任命した知事と反政府勢力が任命した知事双方が郡設置を宣言する事態となっているところもある。
2020年2月15日、内戦の和平プロセスの一環として行政区画を独立当時に戻すことが決まった。これにより郡も79郡に戻された。ただし一部は当事者間の折り合いがつかなかったため、元居た州ではなく特別行政区に移管された。
現在の郡
2008年の国勢調査および2011年の独立住民投票が実施された79郡およびアビエイの一覧。このうちアビエイはスーダン共和国との領土問題となっているため郡としない場合が多い。また国勢調査以降に新設されたアコカ郡に関しても一覧に含まないことがある。
表注 統計は2008年国勢調査に基づいているため、現在とは異なる場合がある。 地方 B - バハル・アル・ガザール地方 E - エクアトリア地方 U - 上ナイル地方
# 郡名 County 面積(km2) 人口 地方 州 備考 2008年国勢調査 2017年推定 2020年以降 1 Abiemnhom 2,380.67 17,012 25,384 U ルウェン行政区 独立時はユニティ州に所属していた。 2 アコボ郡 Akobo 9,056.67 136,210 192,937 U ジョングレイ州 3 中央アウェル郡 Aweil Centre 11,177.40 41,827 59,356 B 北バハル・アル・ガザール州 4 東アウェル郡 Aweil East 6,172.23 309,921 440,055 B 北バハル・アル・ガザール州 5 北アウェル郡 Aweil North 6,376.53 129,127 183,186 B 北バハル・アル・ガザール州 6 Aweil South 1,786.95 73,806 104,385 B 北バハル・アル・ガザール州 7 Aweil West 5,030.22 166,217 236,402 B 北バハル・アル・ガザール州 8 Awerial 4,659.10 47,041 71,616 B レイク州 9 Ayod 13,463.72 139,282 192,937 U ジョングレイ州 アヨク'郡 (Ayok)とも。 10 Baliet 11,689.65 48,010 55,073 U 上ナイル州 2008年以降にアコカ郡が分離。2008年の人口および面積はアコカ郡を含む。 11 Bor 14,115.27 221,106 305,328 U ジョングレイ州 統計上は南ボル郡 (Bor South)とも呼ばれる。 12 Budi 5,758.56 99,234 53,314 E 東エクアトリア州 13 Pigi (Piegi) 4,397.85 99,068 136,742 U ジョングレイ州 カナル郡 (Canal)、ホールフルス郡 (Khorflus)とも呼称される。カナル/ピジーのように併記することもある。 14 Cueibet 4,823.56 117,755 177,987 B レイク州 15 Duk 6,911.48 65,588 89,912 U ジョングレイ州 16 Ezo 8,054.60 80,861 105,228 E 西エクアトリア州 17 Fangak 7,603.72 110,130 151,727 U ジョングレイ州 18 Fashoda 3,546.26 36,518 52,648 U 上ナイル州 現在の都市名であるコドク郡 (Kodok)とも呼称される。 19 Gogrial East 3,890.55 103,283 146,276 B ワラブ州 20 Gogrial West 4,754.37 243,921 346,370 B ワラブ州 21 Guit 3,432.04 33,004 49,018 U ユニティ州 22 Ibba 9,821.66 41,869 54,622 E 西エクアトリア州 23 Ikotos 3,531.39 84,649 129,620 E 東エクアトリア州 24 Juba 18,396.15 368,436 525,953 E 中央エクアトリア州 25 Jur River 10,032.22 127,771 181,402 B 西バハル・アル・ガザール州 26 Kajo Keji 2,636.34 196,387 280,299 E 中央エクアトリア州 27 Kapoeta East 30,015.49 163,997 252,271 E 東エクアトリア州 領土問題があるイレミ・トライアングルを含める。 28 Kapoeta North 5,762.76 103,084 158,889 E 東エクアトリア州 29 Kapoeta South 1,166.84 79,470 122,651 E 東エクアトリア州 30 Koch 4,397.63 74,863 112,040 U ユニティ州 31 Lafon 16,233.08 106,161 163,071 E 東エクアトリア州 ロパ郡 (Lopa)とも。 32 Lainya 3,446.48 89,315 127,552 E 中央エクアトリア州 33 レール Leer 1,612.54 53,022 79,653 U ユニティ州 34 Longochuk 6,971.87 63,166 91,442 U 上ナイル州 35 Nasir 5,147.96 210,002 302,034 U 上ナイル州 ルアパイニィ郡 (Luakpiny)とも呼称される。またルアパイニィ/ナシールと併記することがある。 36 Maban 11,854.72 45,238 65,117 U 上ナイル州 37 Magwi 5,207.95 169,826 260,634 E 東エクアトリア州 38 Maiwut 3,788.66 79,462 113,609 U 上ナイル州 39 Malakal 737.74 126,483 181,498 U 上ナイル州 マカル郡 (Makal)とも。 40 Manyo 6,684.13 38,010 54,034 U 上ナイル州 41 Maridi 7,767.70 82,461 106,834 E 西エクアトリア州 42 Mayendit 3,067.23 53,783 80,529 U ユニティ州 43 Mayom 4,970.65 120,715 180,314 U ユニティ州 44 Melut 6,950.56 49,242 70,659 U 上ナイル州 45 Morobo 1,348.04 103,603 148,023 E 中央エクアトリア州 46 Mundri East 5,078.46 48,318 62,655 E 西エクアトリア州 47 Mundri West 5,837.64 33,975 44,179 E 西エクアトリア州 48 Mvolo 5,609.69 48,134 62,655 E 西エクアトリア州 49 Nagero 9,268.06 10,077 12,852 E 西エクアトリア州 50 Nyirol 7,137.43 108,674 149,854 U ジョングレイ州 51 Nzara 6,466.49 65,712 85,146 E 西エクアトリア州 アンザラ (Anzara)とも呼称される。 52 Panyijiar 5,362.90 50,723 76,152 U ユニティ州 53 Panyikang 5,107.59 45,427 65,117 U 上ナイル州 54 Pariang 9,015.80 82,443 123,419 U ルウェン行政区 パンリアン郡 (Panriang)とも。独立時はユニティ州に所属していた。 55 Pibor 33,273.18 148,475 204,176 U ピボール行政区 独立時はジョングレイ州に所属していた。 56 Pochalla 8,380.87 66,201 91,786 U ピボール行政区 独立時はジョングレイ州に所属していた。 57 Raga 61,792.46 54,340 77,203 B 西バハル・アル・ガザール州 ラジャ郡 (Raja)とも。 58 Renk 10,031.25 137,751 198,123 U 上ナイル州 59 Rubkona 3,597.24 100,236 149,679 U ユニティ州 60 Rumbek Centre 3,866.85 153,550 232,752 B レイク州 61 Rumbek East 3,588.10 122,832 186,412 B レイク州 62 Rumbek North 4,531.13 43,410 65,297 B レイク州 63 Tambura 12,590.89 55,365 71,490 E 西エクアトリア州 64 Terekeka 10,538.23 144,373 206,287 E 中央エクアトリア州 65 Tonj East 3,990.61 116,122 164,215 B ワラブ州 66 Tonj North 11,012.05 165,222 234,593 B ワラブ州 67 Tonj South 7,449.73 86,592 122,816 B ワラブ州 68 Torit 5,795.94 99,740 153,314 E 東エクアトリア州 69 Twic 3,922.65 204,905 291,171 B ワラブ州 70 Twic East 6,098.67 85,349 118,010 U ジョングレイ州 71 Ulang 4,773.03 85,044 121,922 U 上ナイル州 72 Uror 12,141.97 178,519 245,386 U ジョングレイ州 73 Wau 19,251.27 151,320 215,031 B 西バハル・アル・ガザール州 74 Wulu 11,700.60 40,550 61,084 B レイク州 ウーレー郡 (Wule)とも。 75 Yambio 8,847.47 152,257 197,603 E 西エクアトリア州 76 Yei 6,667.76 201,443 288,172 E 中央エクアトリア州 77 Yirol East 5,400.90 67,402 102,158 B レイク州 78 Yirol West 5,024.84 103,190 155,870 B レイク州 79 アビエイ郡 Abyei 10,547.28 52,883 74,518 B アビエイ特別行政区 スーダンとの領土問題のある地域。郡に含まれないことがある。 80 Akoka - 9,842 14,201 U 上ナイル州 2008年から2011年の間にバリート郡より分離。
2011年 - 2020年 2011年の独立投票以降に設置された郡の一覧。このうちバガリ、グウォー、ジェメザ、コマ、タリ、ティゴーの6郡は2015年および2017年の再編リストに名前が載っている。新たに作られた郡の多くが2015年以降の新州の知事によって設置されている。この中で北部リエチュ州では新たな郡が設置されたが、名称は公開されていない。
2020年の和平プロセスで独立時に行政区画が差し戻されたことで廃止された。