Фудбалски куп на Македонија 2016-2017 — 25. издание на македонскиот куп во фудбал. Шкендија се бранителите прваци, откако ја освоиле својата прва титула во претходната сезона. Во ова издание Пелистер бил првак.
Прва рунда Избирањето на двојките се одржало на 25 јули 2016 година. Натпреварите се одиграле на 16, 17, 24 и 31 август 2016 година.
|colspan="3" style="background-color:#97DEFF"|16 август 2016
|colspan="3" style="background-color:#97DEFF"|17 август 2016
|colspan="3" style="background-color:#97DEFF"|24 август 2016
|colspan="3" style="background-color:#97DEFF"|31 август 2016
1 Фортуна се откажала од натпреварувањето поради уништениот терен од поплавите во Скопје.
Осминафинале Избирањето на двојките се одржало на 2 септември 2016 година. Првите натпревари се одиграле на 21 септември, додека вторите се одиграле на 12 и 19 октомври 2016 година.
1 Младост се откажал од натпреварувањето поради финансиски причини.
Четвртфинале Избирањето на двојките се одржало на 21 октомври 2016 година. Првите натпревари се одиграле на 23 ноември, додека вторите се одиграле на 7 декември 2016 година.
Полуфинале Жрепката се одржала на 9 декември 2016 година. Првите натпревари се одиграле на 1 март, а вторите се одиграле на 19 април 2017 година.
Прв натпревар
Втор натпревар
Финале
Екипа победник <big>Пелистер2. титула</big>
Поврзано Прва фудбалска лига на Македонија 2016/2017 Втора фудбалска лига на Македонија 2016/2017 Трета фудбалска лига на Македонија 2016/2017
Наводи
Надворешни врски Фудбалска федерација на Македонија MacedonianFootball.com
2016/2017 Куп Куп