Skipsfjordelva er ei elv på Vannøya i Karlsøy kommune i Troms. Elva er lang, og har et nedbørfelt på . Middelvannføringen ved munningen er .
Elva har sitt utspring i et fjellskar over Dalbotnen sør for Storvatnet (84 moh.), helt øverst i Skipsfjorddalen. Fra Storvatnet renner elva mot nord, gjennom det myrlendte landskapet i den flate dalbunnen. Elva munner ut innerst i Skipsfjorden.
Nesten hele nedbørfeltet ligger innenfor Skipsfjord landskapsvernområde.
Elven er lakseførende.
Referanser
Kategori:Elver i Karlsøy