Botnelva er ei elv i Kvæfjord kommune i Troms. Den renner ut fra Gunnarvatnet, ved bygda Storjord sentralt på østre del av Hinnøya, og renner mot nordvest til munningen i Straumsbotn, en arm av Kvæfjorden. Elva er lang ( regnet fra øverste kilde), og har et nedbørfelt på . Middelvannføringen ved munningen er .
Botnelva renner gjennom en bred og skogkledt dal, som bare helt øverst går over i snaufjell. Fylkesvei 14 følger hovedelva. Landbruk og bebyggelse finnes ved Storjord øverst i dalen og nederst ved Straumsbotn.
Fjellgrunnen i området består av gneiser og granitter med innslag av kalkstein øverst i nedbørfeltet. I nedre del finnes grus- og sandavsetninger og godt utviklede strandlinjer.
Vassdraget ble vernet mot kraftutbygging i Verneplan II for vassdrag i 1980. Vernet ble begrunnet med store interesser knyttet til friluftsliv. Vassdraget er en viktig del av et attraktivt landskap, som sammen med de øvrige vernede vassdrag i området danner et sammenhengende turterreng på denne delen av Hinnøya.
Referanser NOU 15:1976, Verneplan for vassdrag, s. 59
Kategori:Elver i Kvæfjord