FMS er en forkortelse for blant annet:

Forsvarets mediesenter, det tidligere navnet på avdelingen Forsvaret kommunikasjon, som ivaretar det overordnede ansvaret for Forsvarets håndtering av media og medier. Fana medisinske senter, offentlig godkjent privat sykehus som ble stiftet 5. juni 1999.