Gruppespillet i Mesterligaen 1998/1999 begynte 16. september 1998 og ble avsluttet 9. desember 1998. Åtte lag kvalifiserte seg automatisk til gruppespillet, mens 16 kvalifiserte seg gjennom en innledende runde. De 24 lagene ble delt inn i seks grupper på fire, og lagene i hver gruppe spilte mot hverandre hjemme og borte, noe som betyr at hvert lag spilte totalt seks gruppekamper. For hver seier ble lagene tildelt tre poeng, med ett poeng tildelt for uavgjort.
Seeding Seeding var basert på UEFA-forbundenes rangering 1998., på samme måte som forrige sesong.1997–98 European Cups draw Tittelholdere og mester for nasjoner rangert 1–5 ble satt i pot 1. Mestere av nasjoner rangert 6–7 samt lag som kom på andreplass i nasjoner rangert 1–5 (unntatt Frankrike) dannet pot 2. De gjenværende kvalifiserte andreplass lagene (fra nasjonene 6–8) og mestere av topp tre nasjoner rangert under 7 dannet pot 3. Til slutt dannet de resterende seks nasjonale mesterne pot 4.
Farge i gruppetabeller Gruppevinnere og best rangerte andreplass lag går videre til utslagsrunden
Pot 1 Team TH Real Madrid1 Juventus2 Kaiserslautern3 Barcelona4 Lens5 Ajax Pot 2 Team 6 Arsenal7 Porto1 Internazionale2 Bayern München 3 Athletic Bilbao5 PSV Eindhoven Pot 3 Team 6 Manchester United7 Benfica 8 Olympiakos8 Panathinaikos10 Rosenborg11 Sturm Graz Pot 4 Team 12 Spartak Moskva 13 Croatia Zagreb14 Galatasaray15 Brøndby 17 Dynamo Kyiv31 HJK
Grupper
Gruppe A
Gruppe B
Gruppe C
Gruppe D
Gruppe E
Gruppe F
Rangering av andreplass lag
Notater
Referanser
Kategori:Mesterligaen 1998/1999