Proteínas homólogas são proteínas que derivam de um "ancestral comum". Podem estar presentes numa mesma espécies, tendo derivado por duplicação de genes no genoma de um organismo, por paralogia; ou em espécies diferentes, estando o ancestral comum da proteína presente na espécie ancestral comum às duas espécies.
Recursos sobre superfamílias de proteínas Varias bases de dados biológicas documentam as superfamílias proteicas e enovelamentos proteicos; como por exemplo: Pfam - Base de dados de famílias proteicas de alinhamentos e de HMMs PROSITE - Base de dados de domínios de proteínas, famílias e sítios funcionais InterPro - SuperFamily Classification System PASS2 - Protein Alignment as Structural Superfamilies v2 SUPERFAMILY - Biblioteca de HMMs que representa superfamílias e bases de dados de anotações (superfamílias e famílias) para todos os organismos totalmente sequenciados SCOP e CATH - Classificações de estruturas de proteínas em superfamílias, famílias e domínios
Igualmente, existe algoritmos que obtém no PDB proteínas com homologia estrutural com uma estrutura central dada; por exemplo: DALI - Alinhamento estrutural baseado num método de matriz de alinhamento de distância.
Categoria:Proteínas Categoria:Evolução molecular