Jochen Heisenberg () é um físico nuclear alemão.

É professor emérito de física da Universidade de Nova Hampshire. Filho do laureado com o Nobel de Física Werner Heisenberg, irmão do neurobiologista e geneticista Martin Heisenberg, tio do diretor Benjamin Heisenberg.

Usando o Acelerador Linear Bates, publicou diversos artgos sobre eletroexcitações.

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