As eleições municipais em Aracaju em 1988 aconteceram em 15 de novembro, como parte das eleições municipais em 24 estados brasileiros e nos territórios federais do Amapá e Roraima. Neste caso foram eleitos o prefeito Wellington Paixão e o vice-prefeito Carlos Alberto Menezes.Como o processo eleitoral foi deflagrado antes da Constituição de 1988, não foram observados os dois turnos, além disso a Carta Magna criou o estado do Tocantins e elevou os territórios federais do Amapá e Roraima à condição de estados, além de conceder ao Distrito Federal o direito de eleger o seu governador e extinguiu o Território Federal de Fernando de Noronha.
Natural de Aracaju, o advogado Wellington Paixão graduou-se na Universidade Federal de Sergipe, trabalhando antes como bancário, comerciário e funcionário público da Empresa Energética de Sergipe (ENERGIPE). Membro do PCB quando este partido estava na clandestinidade, foi candidato a vereador de Aracaju pelo MDB em 1966 e a deputado federal em 1970, sem lograr êxito. Durante a administração de Jackson Barreto, foi secretário municipal de Assuntos Jurídicos da prefeitura de Aracaju e secretário do Trabalho no governo Antônio Carlos Valadares. Após integrar uma dissidência do PMDB liderada por Jackson Barreto, seguiu rumo ao PSB e foi eleito prefeito da capital sergipana em 1988.
Resultado da eleição para prefeito Foram apurados 136.771 votos nominais (81,28%), 13.297 votos em branco (7,90%) e 18.203 votos nulos (10,82%), resultando no comparecimento de 168.271 eleitores.
Candidatos a prefeito de Aracaju Candidatos a vice-prefeito Número Coligação Votação PercentualWellington PaixãoPSB Carlos Alberto MenezesPDT 40 Frente Progressista(PSB, PDT, PSDB, PCdoB) 78.257 57,22%Lauro MaiaPFL Acival GomesPMDB 25 Aliança Democrática(PFL, PMDB, PL, PJ) 45.549 33,30%Marcelo Déda PT Edmilson AraújoPT 13 PT (sem coligação) 10.521 7,69%Jorge CarvalhoPCB Ana Maria BrasilPCB 23 PCB (sem coligação) 1.372 1,00%José Araújo FilhoPV Paulo DantasPV 43 PV (sem coligação) 1.072 0,79%Fontes:
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