O IBDmix é um método probabilístico para identificar sequências de homininas introgressadas, que não utilizam uma população de referência moderna. O método IBDmix é baseado na identidade por linhagem.
O IBDmix calcula as probabilidades de que um local variante em um indivíduo moderno seja e não seja compartilhado com um genoma arcaico de referência, enquanto contabiliza erros de genotipagem nas sequências humanas arcaicas e modernas de referência. O método usa um algoritmo de programação dinâmica para somar pontuações LOD de site único e maximizar essa pontuação para identificar segmentos introgressados. Entretanto, IBDmix não pode ser usado em genomas individuais ou em amostras pequenas.
Cálculo de genes neandertais para migração humana da África Joshua Akey, geneticista da Universidade de Princeton, aproveitando o fato de que parentes compartilham extensões do DNA correspondente, descobriu que os europeus tinham, em média, 51 milhões de pares de bases que correspondiam ao DNA neandertal e os asiáticos do leste, 55 milhões e concluiu que um grupo de humanos modernos se expandiu para fora da África talvez 200.000 anos atrás e cruzou com os neandertais. Esses humanos modernos então desapareceram. O estudo foi calculado usando o método IBDmix.
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