Систематический перечень судоходных рек России (с водохранилищами) составлен на основе перечня внутренних водных путей Российской Федерации. Формирование перечня проходило по принципу: океан — море — река — приток реки — приток притока и так далее. Если река указана и в основных и в дополнительных судовых ходах, в списке указывается только основные судовые хода. Протоки и рукава указаны только для основных ходов.

Атлантический океан

Балтийское море Неман — 100 км, посёлок Пограничный — начало протоки Северная Шешупе — 7 км, посёлок Лесное — Матросовка — 44 км, Неман — Немонин — 14 км, Малый Калининградский мост — Ржевка — 21 км, пос. Гастеллово (Славское городское поселение) — Луговая — 6 км, река Оса — Головкинский канал — 19 км, пос. Зелёный — Дейма — 37 км, исток — Преголя — 109 км, Новая Деревня — город Калининград Старая Преголя — 22 км, исток — город Калининград Нарва (Нарова) — 13 км, город Ивангород — Россонь — 26 км, исток — Нарвское водохранилище — 41 км, город Сланцы — Нарвская ГЭС Чудское озеро Желча — 31 км, посёлок Ямм — Гдовка — 3 км, город Гдов — Самолва — 2 км, деревня Самолва — Псковское озеро (соединяется с Чудским озером через Тёплое озеро) Теребищенка — 4 км, деревня Теребище — Чёрная — 18 км, посёлок Балахоновский — Великая — 34 км, дер. Пристань — Каменка — 6 км, дер. Логозовичи — Черёха — 2 км, деревня Луковка — Луга — 2 участка: 98 км, 207 км от устья — деревня Большой Сабск, и 58 км, город Кингисепп — Россонь см. выше

Нева — 70 км, Шлиссельбург — Санкт-Петербург Малая Нева — 2 км, исток — Тучков мост Большая Невка — 8 км, исток — остров Елагин Средняя Невка — 3 км, исток — Гребной канал Малая Невка — 4 км, исток — Петровский мост Ижора — 10 км, город Колпино — Ладожское озеро Сясь — 19+4 км, пос. Колчаново — Новосясьский канал — Волхов — 224 км, исток — Малый Волховец — 2 км, 2 км — Ильмень Шелонь — 38 км, город Сольцы — Ловать — 40 км, посёлок Парфино — Полисть — 21 км, город Старая Русса — Пола — 7 км, посёлок Городок — Мста — 134 км, деревня Мстинский Мост — Мстинское водохранилище — 25 км, Мстинская плотина — город Вышний ВолочёкВ перечне указан такой порядок пунктов, так как ниже по Мсте участок не судоходный Вышневолоцкое водохранилище — 8 км, посёлок Здешево — город Вышний Волочёк Мстинское водохранилище и Вышневолоцкое водохранилище входят в Вышневолоцкую водную систему, которая соединяет Мсту с Тверцой, притоком Волги, однако в настоящее время в перечень водных путей не включены участки по Тверце выше деревни Павловское и по Мсте ниже Мстинской плотины Свирь — 222 км, посёлок Вознесенье — Паша — 25 км, посёлок Рыбежно — Лисья — 8 км, исток — Онежское озеро Андома — 13 км, Сорокопольская запань — Мегра — 8 км, дер. Нижнее Понизовье — Онежский канал Водла — 28 км, причал Подпорожье — Вытегра — 64 км входит в Волго-Балтийский водный путь, соединена Мариинским каналом с Ковжей (см. ниже) Беломорско-Балтийский канал соединяет Онежское озеро с Выгозером (см. ниже) и Белым морем

Азовское море Кубань — 314 км, город Усть-Лабинск — устье, город Темрюк Протока — 133 км, исток (Кубань 125 км) — устье, посёлок Ачуево Дон — 1089+199+293 км, устье реки Сосна — город Калач-на-Дону — устье 132 канала — город Азов Воронеж — 63 км, посёлок Рамонь — Хопёр — 70 км, станица Слащёвская — Северский Донец — 296 км, хутор Верхнекрасный — Маныч — 179 км, Новоманычская дамба —

Северный Ледовитый океан

Белое море Нижний Выг, Беломорско-Балтийский канал — 220 км, пос. Повенец (шлюз № 1) — г. Беломорск Шлюз № 19 Выгозеро Сегежа — 25 км, причал Репные острова — ) Беломорско-Балтийский канал соединяет Выгозеро с Онежским озером (см. выше) Кемь — 10 км, г. Кемь —

Северная Двина — 664 км, слияние рек Юг и Сухона — устье протоки Уемлянка (в реестре реки Уйма) Сухона — 548 км, шлюз Знаменитый — устье (слияние с р. Юг) Кубенское озеро Уфтюга — 29 км, село Бережное — ) Кубена — 21 км, посёлок Высокое (в перечне внутренних водных путей РФ Высоковское) — ) Вологда — 27 км, город Вологда — ) Лежа — 23 км, деревня Лобково — ) Юг — 358 км, город Никольск — устье (слияние с р. Сухона) Луза — 211 км, 211 км — Вычегда — 935 км, село Вольдино — Сысола — 332 км, село Койгородок — Вишера — 62 км, село Богородск — Нившера — 58 км, село Нившера — Локчим — 154 км, Лопыдино — Вымь — 172 км, Божъюдор — Уфтюга — 72 км, посёлок Куликово — Вага — 256 км, устье Устья — Устья — 14 км, село Благовещенское — Емца — 10 км, село Емецк — Пинега — 654 км, деревня Согра — Дельта Северной Двины — всего 47 километров путей Кулой с каналом Кулой — Пинега — 208 км, деревня Кулогоры — село Долгощелье Немнюга — 37 км, деревня Совполье — Сояна — 17 км, деревня Сояна — Онега — 155 км, деревня Прошково (в перечне внутренних водных путей РФ Городок) — село Порог Свидь и озеро Лача — 100 км, деревня Горка Каргопольского муниципального округа, рядом с Капово — Каргополь Лодьма — 24 км, деревня Часовенская — Мезень — 561 км, село Кослан — территория (деревня) Белый Нос Вашка — 85 км, деревня Кеба — Пёза — 301 км, деревня Сафоново — Мезенская Пижма — 73 км, деревня Шегмас —

Баренцево море

Печора — 1541 км, село Усть-Унья — город Нарьян-Мар Илыч — 81 км, деревня Еремеево (Коми) — Уса — 270 км, село Петрунь — Колва — 330 км, посёлок Хорей-Вер — Адзьва — 50 км, посёлок Харута — Ижма — 82 км, село Ижма — Нерица — 10 км, село Нерица — Пижма — 11 км, хутор Васина изба — Цильма — 59 км, село Трусово — Сула — 133 км, село Коткино —

Карское море

Обь — судоходна по всей длине 3619 км (1924 + 910 + 234 + 252 + 205 + 94 исток — остановочный пункт Соснино — остановочный пункт Перегрёбное — протока Нюрик — остров Пароходский — остров Большие Яры — Надымская Обь) от слияния Бии и Катуни до Надымского бара (входной буя) в устье. Иртыш — судоходен на всей территории России, 2048 км от границы с КазахстаномВ перечне внутренних водных путей РФ указан остановочный пункт Клин, этот пункт в 4 км за границей, от Клина до устья 2052 км до Тара — 365 км, село Кыштовка — Ишим — 211 км, село Викулово — Тобол — 255 км, деревня Карбаны — Тура — 325 км, село Туринская Слобода — Тавда — 725 км, исток (слияние рек Лозьвы и Сосьвы) — Сосьва — 167 км, посёлок Сосьва — устье (слияние с Лозьвой) Лозьва — 219 км, посёлок Понил — устье (слияние с Сосьвой) Пелым — 185 км, деревня Шантальская — Конда — 685 км, посёлок Мулымья (посёлок) — Ах — посёлок Дальний — (через озёра Сатыгинский Туман, Среднесатыгинский Туман и Леушинский Туман) Малая Обь — 483 км — от посёлка Перегрёбное до острова Пароходский Протока Нарыкарская — 4 км, от деревни Нижние Нарыкары до 799 км от устья Малой Оби Северная Сосьва — 660 км, от села Няксимволь до Ляпин — 163 км, от села Саранпауль до Малая Сосьва — 120 км, от посёлка Светлый до Протока Вайсова — 18 км, от 700 км от устья Малой Оби до 36 км от устья Северной Сосьвы Сыня — 90 км, от села Овгорт до Протока Шурышкарская — 3 км, от села Шурышкары до 388 км Малой Оби Протока Кочегатка — 11 км, от 549 км Малой Оби до 534 км Малой Оби Протока Нюрик — 24 км — судоходна на всей длине Хаманельская Обь — 111 км, от острова Большие Яры до 34 км от устья Протока Большая Неречинская — 37 км, от 73 км Хаманельской Оби до 52 км Надымской Оби Протока Звягинское Зерло — 41 км, от 41 км. Надымской Оби до устья реки Надым Протока Вартовская Обь — 13 км, от Нижневартовска до 1694 км от устья Оби Протока Чёрная — 10 км, от 1480 км от устья Оби до 1470 км от устья Оби Протока Юганская Обь — 210 км, от 1513 км от устья Оби до 1350 км от устья Оби Большой Юган — 165 км до Протока Старица — 4 км, от 64 км от устья Большого Югана до 60 км от устья Большого Югана Вах — 432 км до Протока Сабунская — 6 км, село Ларьяк — Коликъёган (Колекъеган) — 253 км, причал Подбаза — Протока Покур — 5 км, село Покур — 1618 км от устья Оби Протока Локосовская — 4 км, село Локосово — 1571 км от устья Оби Тромъёган — 235 км, деревня Русскинская — протока Лагарма Протока Лагарма — 9 км, 65 км от устья Тромъёгана — 1548 км от устья Оби Протока Большая Салымская — 66 км, от 1326 км от устья Оби до 1264 км от устья Оби Большой Салым — 110 км до Протока Большая Юганская — 180 км, от 90 км от устья Юганской Оби до 16 км от устья Большого Салыма Пим — 80 км до Лямин — 170 км до Протока Сытоминка — 30 км, от 1347 км от устья Оби до 1322 км от устья Оби Протока Мулка — 3 км, от Мегиона до 1657 км от устья Оби Протока Синдыкова — 3 км, от 1281 км от устья Оби до села Селиярово Назым — 42 км, от села Кышик до Протока Ендырская — 55 км, от 1145 км от устья Оби до Протоки Горной Протока Алешкинская — 50 км, от 905 км от устья Оби до 875 км от устья Оби Казым — 180 км, от посёлка Верхнеказымский до Полуй — 202 км до Собь — 5 км, от села Катравож до Катунь — 28 км, от Бийского гравийно-песчаного карьера до устья (слияния с Бией) Бия — 225 км, от села Турочак до устья (слияния с Катунью)  — 16 км, от устья Щучьей до 164 км от устья Оби Щучья — 22 км, от посёлка Белоярск до протока Шамопосл — 7 км, от города Лабытнанги до 285 км от устья Оби протока Карантинская — 1 км, от устья протоки Шамопосл до 285 км от устья Оби Чарыш — 80 км, от села Усть-Калманка до Бердь — 34 км, от города Искитим до Чаус — 4 км, от села Скала до Томь — 643 км, от устья реки Мрассу до Чулым — 897 км до Кия — 13 км, от посёлка Красноярка (в реестре водных путей РФ Красноярский рейд) до Чая — 172 км, от села Усть-Бакчар до Кеть — 705+87 км (Кеть и Кеть Копыловская в реестре водных путей РФ) до Пайдугина — 182 км, от нежилого села Берёзовка до Парабель — 225 км, от устья реки Чузик до Чузик — 210 км, от села Пудино до Кёнга — 122 км, от бывшего посёлка Центральный Бакчарского района до Васюган — 593 км, от села Новый Васюган до Нюролька — 60 км, от села Мыльджино до Тым — 560 км, от бывшего посёлка Ванжилькынак (в реестре водных путей РФ Ваньжинль-Кынак) Каргасокского района до Надым — 123 км, от города Надым до Пур — 400 км, от истока (слияние рек Пякупур и Айваседапур) до Пякупур — 80 км до устья (слияния с Айваседапуром) Айваседапур — 171 км до устья (слияния с Пякупуром) Еркалнадейпур — 113 км, от села Халясавэй до Таз — 798 км, от посёлка Толька до Антипаётаяха (Широкая) — 16 км, от посёлка Антипаюта до

Енисей — 2961 км, от города Кызыл до порта Дудинка Большой Енисей (Бий-Хем) — 285 км, от села Тоора-Хем до устья (слияния с Малым Енисеем) Малый Енисей (Ка-Хем, Кызыл-Хем, Шихшид-Гол) — 142 км, от посёлка Эржей до устья (слияния с Большим Енисеем) Ангара — 54+470+281+95+726 км, исток — Иркутская ГЭС + Братское водохранилище + Усть-Илимское водохранилище + Усть-Илимская ГЭС — несуществующиё ныне посёлок Едарма Усть-Илимского района — Братское водохранилище — 470 км Ангарская трасса Оса, залив Оса — 44 км до основного судового хода Братского водохранилища Обуса, залив Обуса — 11 км до Усть-Улей, залив Улей — 4 км до Унга, залив Унга — 32 км до основного судового хода Братского водохранилища Уда, залив Уда — 24 км до основного судового хода Братского водохранилища Ока, Окская трасса — 333 км до Ангарской трассы Ия, Ийская трасса — 138 км до Окской трассы Усть-Илимское водохранилище — 281 км Ангарская трасса Илим, Илимская трасса — 210 км до Ангарской трассы Тасеева — 15 км, от деревни Кандаки до озеро Байкал — всего 2356,6 км судоходных трасс Селенга — 274 км, от устья реки Чикой до Баргузин — 138 км, от улуса Элэсун до Верхняя Ангара — 214 км, от посёлка Уоян до Большой Пит — 183 км, от посёлка Брянка до Сым — 140 км до Кас — 120 км до Елогуй — 170 км, от села Келлог до Турухан — 288 км, от села Янов Стан до Курейка — 88 км, от посёлка Светлогорск до Подкаменная Тунгуска — 1146 км, от села Ванавара до Вельмо — 220 км до Нижняя Тунгуска — 1154+957 км, от посёлка Кислокан до и от Подволошино до Наканно Непа — 532 км, от села Токма до