5-я флотилия может означать:
Великобритания — формирование Королевского военно-морского флота Великобритании, принимавшее участие как в Первой, так и во Второй мировых войнах, существовавшее с февраля 1910 года по 1942 годы и с 1947 по 1951 годы.
Германия 5-я флотилия миноносцев кригсмарине 5-я флотилия подводных лодок кригсмарине 5-я флотилия эскадренных миноносцев кригсмарине 5-я флотилия минных прорывателей кригсмарине 5-я флотилия торпедных катеров кригсмарине