Распад СССР и экономический кризис в 1990-е годы отрицательно повлияли на маршрутную сеть трамваев Санкт-Петербурга: из-за сокращения числа водителей в парках и старения подвижного состава сократился выпуск на линии и выросли интервалы, ремонт путей практически прекратился, что привело к снижению скорости и дальнейшему ухудшению состояния подвижного состава. Это, вместе с другими факторами (растущей автомобилизацией и ростом рынка маршрутного такси), привело к снижению пассажиропотока и, как следствие, доходов общественного транспорта в целом. Под предлогом "минимизации убытков" началось массовое закрытие трамвайных линий: были демонтированы сотни километров пассажирских путей, а также все грузовые и служебные. До этого последний раз демонтаж линий производился в 1971 годуИстория и настоящее общественного транспорта Ленинграда — Петербурга .
Несмотря на это, инерция была настолько велика, что максимума развития трамвайное хозяйство (как это ни странно) достигло как раз в середине 1990-х. Максимальная длина трамвайных путей была достигнута в период с августа 1992 года по июль 1997 года. Максимальное количество маршрутов (68: 1 — 65 + А + 21А + 90) выходило на линию в период с 13 октября 1997 года по 20 февраля 1998 годаИстория и настоящее общественного транспорта Ленинграда — Петербурга .
К 2007 году, трамвайное движение в центре было сведено к минимуму, а пассажирская сеть была разделена на 3 отдельных фрагментаВ настоящий момент, южная и юго-западная сети соприкасаются на площади Репина, однако, до 1 марта 2013 года, дальние транзитные маршруты через неё отсутствовали. Даже после введения таковых, эффективная связь южного и юго-западного фрагментов, которая раньше осуществлялась по набережной Обводного канала, от Старо-Петергофского до Лиговского проспектов, не будет восстановлена.. С этого момента, трамвай стало больше нельзя использовать для передвижения на значительные расстояния, он стал выполнять исключительно функции подвоза пассажиров к ближайшим станциям железных дорог и метро.
Демонтированные линии Годы Улицы, на которых трамвайное движение закрыто и пути демонтированы 1993 январь: Улица Марата от Колокольной улицы до Стремянной улицы, Стремянная улица (одноимённая конечная станция)Окончательно демонтированы в 2000 году., Дмитровский переулок июнь: Конечная станция «Варшавский вокзал» вместе с отходившей от него линией в грузовой двор станции «Ленинград-Варшавский-Товарный» 1996 Конногвардейский бульвар, Исаакиевская площадь, Адмиралтейский проспект, Дворцовый мост, Биржевая площадь, Биржевой мост, Мытнинская набережная. Линия демонтирована весной 1997 года. 1997 22 мая: Дальневосточный проспект от Народной улицы до проспекта Большевиков, проспект Большевиков от Дальневосточного проспекта до конечной станции «Станция Нева», конечная станция «Станция Нева», грузовая линия к базе завода «Севкабель» 1998 20 февраля: Конюшенная площадь, Царицынский проездПути демонтированы 5 июля 2012 года., Марсово поле, Миллионная улица от Марсова поля до Суворовской площади 2000 август: Улица Жуковского от Литейного проспекта до улицы Восстания 20 октября: Финский переулок 2001 1 июня: Кронверкская улица, улица Ленина, Кирочная улица, улица Восстания, улица Жуковского, Лиговский проспект от улицы Жуковского до 2-й Советской улицы 1 июля: Рижский проспект от Старо-Петергофского проспекта до Гапсальской улицы, Гапсальская улица, Межевой канал, Виндавская улица. Линия на Рижском проспекте от Старо-Петергофского проспекта до Либавского переулка окончательно демонтирована в июне 2011 года. 1 сентября: Малый проспект В. О., 16-17 линии В. О., конечная станция «Набережная реки Смоленки» 1 октября: Большая Разночинная улица, Корпусная улица, Лодейнопольская улица, Петрозаводская улица, конечная станция «Новоладожская улица», конечная станция «Кинотеатр „Юность“» 2002 15 мая: 8-9 линии В. О., Уральская улица, Железноводская улица, проспект КИМа 10 июля: Кондратьевский проспект от улицы Жукова до площади Калинина 22 июля: Ждановская улица, Малый проспект П. С., Пионерская улицаНекоторые фрагменты путей сохранялись до лета 2017 года., Чкаловский проспект от Пионерской улицы до Большой Зелениной улицы, Лазаревский мост, Вязовая улица, Спортивная улица от Лазаревского моста до Крестовского проспекта 7 августа: Набережная Лейтенанта Шмидта, 22-23 линии В. О. от набережной Лейтенанта Шмидта до Большого проспекта В. О., 8-9 линии В. О., Малый проспект В. О. от Гаванской улицы до конечной станции «Малый пр. В. О.»Движение прекращено в 2002 году в связи закрытием маршрута № 37, конечная станция ликвидирована в 2006 году (сохранялась возможность использования линии с использованием двусторонних трамваев), линия по проспекту снята в 2009 году. 28 сентября: Проспект Римского-Корсакова, улица Декабристов, Английский проспект 1 октября: Благодатная улица от Московского проспекта до станции Броневая, Константиновский проспект от Гребной улицы до конечной станции «ЦПКиО» 14 октября: 10-я Красноармейская улица, Рижский проспект, Лермонтовский проспект от Троицкого проспекта до набережной Обводного канала 2003 5 апреля: набережная Обводного канала от Лифляндской улицы до Гутуевского моста, Гутуевский мост, Двинская улица, конечная станция «Порт» 9 июня: Греческий проспект от улицы Некрасова до 2-й Советской улицы 2004 1 июля: Большой Сампсониевский проспект от 1-го Муринского проспекта до улицы Смолячкова 2005 5 октября: Большеохтинский мост, Тульская улица, Новгородская улица, улица Моисеенко, 9-я Советская улица, Греческий проспект, улица Некрасова, Дегтярный переулок. Пути на улице Некрасова демонтированы в 2010—2011 годах. Линия по Дегтярному переулку окончательно заасфальтирована только 12 августа 2017 года. Барочная улица — демонтирована в конце 2007-начале 2008 годов. 2006 12 января: Дорога на Турухтанные острова 1 марта: Площадь Труда, улица Труда, набережная реки Мойки, Поцелуев мост, улица Глинки, проспект Римского-Корсакова, Никольская площадь, Никольский переулок — демонтированы в июне 2010 года. 1 марта: Кадетская и 1-я линии Васильевского острова от Среднего проспекта до Университетской набережной, Университетская набережная, мост Лейтенанта ШмидтаГУП Горэлектротранс Санкт-Петербург — Вопросы горячей линии. Демонтаж выполнен 23 апреля 2007 года. Пути на Ново-Никольском мосту демонтированы только 13 июня 2017 года. 11 апреля: Московский проспект от набережной Обводного канала до Трамвайного парка № 1, набережная Обводного канала от Старо-Петергофского проспекта до Лиговского проспекта, Измайловский проспект, Вознесенский проспектИзменения маршрутной сети и длительные закрытия . Линии демонтированы в ноябре 2006 года. 9 сентября: Пискарёвский проспект от Полюстровского проспекта до конечной станции «Больница имени Мечникова»Пискарёвский проспект останется без деревьев и трамваев, ПТО на улице Руставели, 1 Оборотное кольцо «Средний пр.» («25-я линия») 2007 13 января: Чкаловский проспектПассажирское движение прекращено 13 января 2007 года, после закрытия линии на Крестовский остров осуществление перевозок по Чкаловскому проспекту, а также по улицам Большой Зелениной, Рыбацкой и Введенской оставалось теоретически возможным с использованием двусторонних трамваев, так как с улицы Большой Зелениной отсутствует правый поворот на Чкаловский проспект, равно и как на Чкаловском проспекте отсутствует левый поворот на улицу Большую Зеленину. В 2009 году снята часть трамвайных путей и контактная сеть. Окончательно линия демонтирована 19 июня 2010 года. — демонтирована в июне 2010 года. 1 апреля: Лиговский проспект (от 2-й Советской улицы до Кузнечного переулка), 2-я Советская улицаДемонтирована в октябре 2010 года., проспект Бакунина от 2-й Советской улицы до Перекупного переулка, Херсонская улица от проспекта Бакунина до Перекупного переулкаПоследние две линии демонтированы при ремонте коммуникаций 22 сентября 2008 года.. 4 июля: Введенская улица, Рыбацкая улица, улица Большая Зеленина, Большой Крестовский мост, Петроградская улица, Константиновский проспект, Гребная улица, Спортивная улица, Крестовский проспект, конечная станция «Приморский парк Победы» (крупнейшая в Санкт-ПетербургеТрамвай и троллейбус Санкт-Петербурга. — СПб. : Лики России, 1997. — 240 с. : ил. — ISBN 5-87417-048-0Крестовский остров). Демонтированы в 2008—2010 годах.
Последние остатки закрытой линии — на набережной Обводного канала на участке от Рыбинской улицы до Лиговского проспекта — были демонтированы в сентябре 2025 года. Пути были отремонтированы незадолго до вывода из эксплуатации, кроме того, Горэлектротранс неоднократно заявлял о желании возобновить движение трамваев на этом участке. 15 сентября 2023 года от этих планов окончательно отказались.
Существуют и другие сохранившиеся фрагменты путей, но все они находятся на частной территории.
Линии, не используемые в маршрутном движении Улица Марата от Кузнечного переулка до Колокольной улицы (а также один путь в направлении от Свечного переулка к Кузнечному переулку), Колокольная улица, Владимирский проспект, Литейный проспект, Инженерная улица, мост Белинского, улица Белинского, Литейный мост, Улица Академика Лебедева от Литейного моста до улицы Комсомола — пассажирское движение трамваев прекращено с 2007 года, однако демонтаж путей на них не предполагается. Все линии, кроме Литейного проспекта от улицы Белинского до Невского проспекта, Владимирского проспекта и Колокольной улицы, используются музейным трамвайным маршрутом Т1, а также временными маршрутами при перекрытии движения на соседних улицах. 29 марта 2017 года активисты предложили вернуть трамвай на Литейный проспект, однако в правительстве Санкт-Петербурга назвали эту идею нецелесообразной. Литовская улица — служебная линия к бывшему Петербургскому трамвайно-механическому заводу, используется Службой пути. У дома № 2А становится однопутной. Большая Монетная улица, улица Чапаева, Гренадёрский мост, Гренадёрская улица от Гренадерского моста до Большого Сампсониевского проспекта — используется только временными маршрутами и рейсами в 3-й трамвайный парк. Однопутная линия по проспекту Луначарского от Выборгского шоссе до проспекта Энгельса — используется только временными маршрутами. Улица Руставели от проспекта Просвещения до СТТП — используется только для следования в парк и на маршрут. Ряд конечных станций и оборотных колец.
Строительство новых линий 5 августа 1992 года была открыта новая линия по улице Савушкина от действующей конечной станции «Приморский проспект» до нового трамвайного кольца «Лахтинский разлив». 14 января 1999 года было открыто движение по улицам Стародеревенской, Оптиков и Торфяная дорога к новой станции метро «Старая Деревня» (маршрут № 18), а 27 декабря 2000 года около той же станции метро с другой стороны от железнодорожных путей было открыто движения от нового кольца до улицы Савушкина. 3 февраля 2003 года в связи со строительством Ладожского вокзала было открыто новое трамвайное кольцо «станция метро Ладожская», перенесённое ближе к реке Оккервиль. Таким образом, трамвайная линия по Гранитной улице была удлинена на 600 метров. В августе 2012 года в связи с реконструкцией Приморского шоссе конечная станция «Лахтинский разлив» была перенесена на новое место. В декабре 2012 года на Сенной площади в качестве эксперимента был построен пошёрстный съезд между путями встречного направления. Строительство съезда позволяет осуществлять оборот трамвая по принципу железной дороги, для этого был закуплен специальный двусторонний подвижной состав. В 2013 году подобные съезды появились также на Новочеркасском (на остановке «станция метро Новочеркасская» севернее перекрёстка с Заневским проспектом) и Дальневосточном проспектах (на остановке «Народная улица»), а также на проспекте Обуховской обороны (перед Володарским мостом со стороны Рыбацкого, ныне разобран). В 2016 году пошёрстные съезды также появились у станции метро «Спортивная» на Васильевском острове и на Кронкверкском проспекте (остановка «проспект Добролюбова»).