В химии, раскраска по CPK (, ) — популярная схема цветового обозначения атомов различных химических элементов в молекулярных моделях. Данная схема названа в честь молекулярной модели CPK, созданной и Лайнусом Полингом и усовершенствованной Уолтером Колтуном.
История В 1952 году Кори и Полинг опубликовали описание объёмной модели белков и других биомолекул, которую они создали в Калифорнийском технологическом институте.Robert B. Corey and Linus Pauling (1953): Molecular Models of Amino Acids, Peptides, and Proteins. Review of Scientific Instruments, volume 24, issue 8, p. 621—627. . Их модель представляла атомы деревянными шариками, раскрашенными в яркие цвета, соответствующие химическим элементам. Их цветовая модель включала: белый для водорода, чёрный для углерода, голубой для азота, красный для кислорода. Они также построили уменьшенные модели, используя пластиковые шарики такой же цветовой схемы.
В 1965 году Колтун запатентовал улучшенную версию модели Кори — Полинга.Walter L. Koltun (9165), Space filling atomic units and connectors for molecular models. U. S. Patent 3170246. В своём патенте он упоминает следующие цвета: белый для водорода, чёрный для углерода, синий для азота, красный для кислорода, тёмно-жёлтый для серы, пурпурный для фосфора, оттенки от светло- до тёмно-зелёного соответственно для галогенов (F, Cl, Br, I), серебряный для металлов (Co, Fe, Ni, Cu).
Типичные цветовые обозначения Типичные цветовые обозначения в CPK включают: водород (H)белыйуглерод (C)чёрныйазот (N)синийкислород (O)красныйфтор (F), хлор (Cl)зелёныйбром (Br)тёмно-красныйиод (I)тёмно-фиолетовыйблагородные газы (He, Ne, Ar, Xe, Kr)голубойфосфор (P)оранжевыйсера (S)жёлтыйбор (B), большинство переходных металловбежевыйщелочные металлы (Li, Na, K, Rb, Cs)фиолетовыйщелочноземельные металлы (Be, Mg, Ca, Sr, Ba, Ra)тёмно-зелёныйтитан (Ti)серыйжелезо (Fe)темно-оранжевыйдругие элементырозовый
Некоторые из цветов CPK мнемонически связаны с цветами чистых элементов или их соединений. Например, водород — бесцветный газ, углерод в виде угля или графита чёрный, многие формы серы имеют жёлтый цвет, хлор — зеленоватый газ, бром — тёмно-красная жидкость, иод в эфире фиолетовый, одна из аллотропных модификаций фосфора имеет красный цвет, железная ржавчина имеет тёмно-оранжевый оттенок, и т. д. В случае других элементов, таких как кислород и азот, выбор цвета менее понятен. Вероятно, красный цвет для кислорода был выбран потому что он часто ассоциируется с горением, а синий цвет для азота обусловлен тем, что это главный компонент земной атмосферы, имеющей синии тона.
Современные варианты Следующая таблица представляет собой цвета, назначаемые каждому элементу в популярных компьютерных программах. Колонка C содержит изначальные цвета Кори и Полинга, колонка K содержит цвета из патента Колтуна. Колонка J описывает цветовую схему, используемую молекулярным визуализатором Jmol.Jmol color table на sourceforge.net. Колонка R описывает цветовую схему, используемую программой RasMol; в случае если указаны два цвета, второй актуален для версий 2.7.3 и выше.Rasmol color table на bio.cmu.edu. Все цвета даны приблизительно и могут зависеть от дисплея и настроек видео.
Атомный номер Символ Название Цвета
1 H водород 1 2H (D) дейтерий 1 3H (T) тритий 2 He гелий 3 Li литий 4 Be бериллий 5 B бор 6 C углерод 6 13C углерод-13 6 14C углерод-14 7 N азот 7 15N азот-15 8 O кислород 9 F фтор 10 Ne неон 11 Na натрий 12 Mg магний 13 Al алюминий 14 Si кремний 15 P фосфор 16 S сера 17 Cl хлор 18 Ar аргон 19 K калий 20 Ca кальций 21 Sc скандий 22 Ti титан 23 V ванадий 24 Cr хром 25 Mn марганец 26 Fe железо 27 Co кобальт 28 Ni никель 29 Cu медь 30 Zn цинк 31 Ga галлий 32 Ge германий 33 As мышьяк 34 Se селен 35 Br бром 36 Kr криптон 37 Rb рубидий 38 Sr стронций 39 Y иттрий 40 Zr цирконий 41 Nb ниобий 42 Mo молибден 43 Tc технеций 44 Ru рутений 45 Rh родий 46 Pd палладий 47 Ag серебро 48 Cd кадмий 49 In индий 50 Sn олово 51 Sb сурьма 52 Te теллур 53 I иод 54 Xe ксенон 55 Cs цезий 56 Ba барий 57 La лантан 58 Ce церий 59 Pr празеодим 60 Nd неодим 61 Pm прометий 62 Sm самарий 63 Eu европий 64 Gd гадолиний 65 Tb тербий 66 Dy диспрозий 67 Ho гольмий 68 Er эрбий 69 Tm тулий 70 Yb иттербий 71 Lu лютеций 72 Hf гафний 73 Ta тантал 74 W вольфрам 75 Re рений 76 Os осмий 77 Ir иридий 78 Pt платина 79 Au золото 80 Hg ртуть 81 Tl таллий 82 Pb свинец 83 Bi висмут 84 Po полоний 85 At астат 86 Rn радон 87 Fr франций 88 Ra радий 89 Ac актиний 90 Th торий 91 Pa протактиний 92 U уран 93 Np нептуний 94 Pu плутоний 95 Am америций 96 Cm кюрий 97 Bk берклий 98 Cf калифорний 99 Es эйнштейний 100 Fm фермий 101 Md менделевий 102 No нобелий 103 Lr лоуренсий 104 Rf резерфордий 105 Db дубний 106 Sg сиборгий 107 Bh борий 108 Hs хассий 109 Mt мейтнерий 110 Ds дармштадтий 111 Rg рентгений 112 Cn коперниций 113 Nh нихоний
Примечания
Ссылки What is the basis for the CPK color scheme? Which colors is used for which atom? Physical Molecular Models Модель Кори-Полинга-Колтуна: стандарт «молекулярного конструктора»
Категория:Молекулы Категория:Моделирование Категория:Атомы